這些腸道微生物群的使命是輔助食物消化功能和防止病原微生物的入侵。食物在其發(fā)酵作用下，會產生二氧化碳、氧氣、甲烷、硫化氫、硫醇等多種氣體，相互融合形成“蕩氣回腸”的帶味腸氣。
腸道微生物群還能產生糞臭素（讓臭豆腐香飄十里的成分之一）、吲哚（低濃度如花香四溢，高濃度則臭名昭著）等代謝產物，在它們的助力下，使得便便“別有風味”。

大便本身常帶有臭味，只是輕重不一，人體的嗅覺不一定都能分辨出來，所以有人用臭雞蛋味、魚臭味或蒜臭味等來形容。

由于我們每日會攝入不同種類的食物，其蛋白質、碳水化合物、脂質等營養(yǎng)物質的構成比例不同，也就使排泄物中最終含有各種代謝產物的比例不同，從而導致大便的氣味存在個體差異。這也是造成“肉食者味重，素食者味輕”的原因。