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「青蓮聚焦」蛋白質(zhì)組學揭示糖尿病治療新靶點GDF15

2022-06-17 10:19 作者:青蓮百奧  | 我要投稿

1型糖尿?。═1D)是由β細胞進行性喪失引起的,是由促炎細胞因子信號傳導的過程,破壞了促凋亡蛋白和抗凋亡蛋白之間的平衡,但其具體機制目前尚不清楚。2020年02月04日,來自美國太平洋西北國家實驗室等研究團隊在國際知名學術(shù)期刊Cell Metabolism(IF:21.567)上發(fā)表了題為“Comprehensive Proteomics Analysis of Stressed Human Islets Identifies GDF15 as a Target for Type 1 Diabetes Intervention”的研究論文。該研究通過綜合蛋白質(zhì)組學分析,旨在揭示細胞因子誘導的β細胞信號的分子特征,以確定調(diào)節(jié)細胞死亡和生存之間平衡的因素。研究發(fā)現(xiàn)了一種生長/分化因子15(GDF15,也稱為巨噬細胞抑制因子1[MIC-1])是一種胰島保護因子,可作為T1D干預的潛在靶標。


1型糖尿?。═1D)是一種慢性疾病,這種疾病會縮短患者的壽命超過10年。T1D是由自身免疫介導的破壞胰島中產(chǎn)生胰島素的β細胞引起的,免疫療法已被廣泛測試以預防或治療該疾病。最近的臨床試驗表明,免疫調(diào)節(jié)可以推遲某些高危個體的疾病發(fā)病,但對藥物治療的反應通常是不同的,持續(xù)時間有限。這一過程中主要障礙是缺乏對胰腺β細胞在免疫激活和疾病進化過程中的反應的了解。因此,研究人員采用促炎細胞因子(IL-1β和干擾素-γ)聯(lián)合處理人胰島,并進行深入的蛋白質(zhì)組學分析,并闡明了促炎癥細胞因子調(diào)節(jié)GDF15合成的機制、其在阻斷凋亡信號傳導中的作用以及在體內(nèi)預防胰腺炎的活性。


實驗材料

來自10個供體的50 U/mL IL-1β和1000?U/mL干擾素-γ?處理的胰島和對照胰島組織


技術(shù)策略

TMT蛋白質(zhì)組學


研究結(jié)果

細胞因子處理胰島的蛋白質(zhì)組學綜合分析

蛋白質(zhì)組學分析共得到11,324種蛋白質(zhì)的定量信息,其中387個蛋白的豐度在細胞因子處理后發(fā)生了顯著變化(圖1C)。接下來,作者使用DAVID數(shù)據(jù)庫進行了功能富集分析,發(fā)現(xiàn)細胞因子處理調(diào)節(jié)了與核因子-κB信號、細胞分裂素受體相互作用、細胞凋亡、抗原處理和呈遞、細胞外基質(zhì)、凝血和補體級聯(lián)、類風濕性關(guān)節(jié)炎和癌癥轉(zhuǎn)錄失調(diào)相關(guān)的蛋白(圖1D)。蛋白質(zhì)組學檢測共鑒定到54種細胞因子、趨化因子和生長因子,其中19種受IL-1β+干擾素-γ調(diào)節(jié)。在這些受調(diào)控的細胞因子、趨化因子和生長因子中,16個上調(diào),3個下調(diào)。綜上所述,蛋白質(zhì)組學分析顯示,促炎癥細胞因子處理的胰島中與細胞因子信號轉(zhuǎn)導和凋亡相關(guān)的蛋白質(zhì)有顯著的調(diào)節(jié)作用。

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圖1.干擾素-γ和IL-1β處理的人胰島的蛋白質(zhì)組分析


篩選關(guān)鍵靶點

為了確定可能的治療靶點,采用以下4個標準進一步篩選蛋白:(1)對IL-1β+干擾素-γ處理具有調(diào)節(jié)作用;(2)參與細胞凋亡;(3)分類為細胞因子、趨化因子或生長因子;

(4)非標蛋白質(zhì)組驗證可靠性。

基于以上標準共篩選出5個蛋白:Fractalkine、IL-1α、IL-1β、骨橋蛋白(SPP1)和生長/分化因子15(GDF15)。在這些細胞因子中,SPP1和GDF15被選作進一步研究,因為關(guān)于它們在T1D中作用的報道有限。作者通過用IL-1β+干擾素-γ處理EndoC-βH1人和小鼠MIN6β細胞系,驗證了細胞因子介導的SPP1和GDF15的下調(diào)(圖2B、C)。接下來,分析了GDF15和SPP1在非肥胖糖尿病(NOD)小鼠胰島中的表達,與非胰腺炎NOD小鼠相比,胰腺炎NOD小鼠的胰島中GDF15和SPP1的豐度降低(圖2D和2E)。

圖2. 干擾素-γ和IL-1β對胰島細胞因子、趨化因子和生長因子的調(diào)節(jié)


GDF15和SPP1在人胰島表達的調(diào)控機制

為了探討其調(diào)控機制,作者比較了IL-1β+干擾素-γ處理的人胰島中GDF15和SPP1的蛋白和轉(zhuǎn)錄水平。結(jié)果顯示,這兩種蛋白在細胞因子處理后均顯著降低(圖3A)。與轉(zhuǎn)錄調(diào)控過程一致,細胞因子處理使編碼SPP1的mRNA水平顯著下降(圖3A)。相比之下,編碼GDF15的mRNA水平通過細胞因子處理后增加了兩倍,這表明該蛋白在轉(zhuǎn)錄后水平上受到調(diào)節(jié)。為了驗證GDF15蛋白水平的下降是否由于GDF15 mRNA翻譯受阻導致的,作者進行了多核糖體圖譜分析實驗。結(jié)果表明,在細胞因子處理過程中,GDF15?mRNA主要存在于單核糖體部分(圖3C、D)。這些結(jié)果表明,促炎癥細胞因子可阻斷GDF15?mRNA的翻譯。

圖3. 細胞因子對β細胞GDF15表達的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控


GDF15保護β細胞免受IL-1β和干擾素-γ誘導的細胞死亡

首先使用MetaCore工具對GDF15和SPP1調(diào)控的下游信號進行了網(wǎng)絡(luò)分析。發(fā)現(xiàn)GDF15和SPP1都參與到調(diào)節(jié)細胞凋亡(圖4A)。之后采用50 ng/mL?rSPP1或100 ng/mL?rGDF15處理人胰島素分泌的EndoC-βH1細胞12-16h,然后再用干擾素-γ+IL-1β處理24 h。蛋白質(zhì)印跡分析顯示,干擾素-γ+IL-1β單獨處理誘導了細胞凋亡(圖4B-4D)。而GDF15和SPP1處理后導致細胞凋亡減少(圖4B-4D)。以上結(jié)果證實了GDF15和SPP1預處理對細胞因子誘導的細胞凋亡具有保護作用(圖4E)。

圖4. GDF15和SPP1阻斷干擾素-γ+IL-1β誘導的細胞凋亡


GDF15抑制NOD小鼠胰腺炎及降低糖尿病發(fā)生率

在確定GDF15保護β細胞免受干擾素-γ+IL-1β誘導的細胞凋亡后,又討論了它是否也能在體內(nèi)保護胰島的問題。作者采用rGDF15或?qū)φ瘴镏委?周齡雌性NOD小鼠(n=5),每兩天一次,連續(xù)兩周監(jiān)測小鼠體重和血糖水平,結(jié)果顯示GDF15給藥后體重和血糖穩(wěn)定且不受GDF15給藥的影響(圖5A和5B)。之后取小鼠胰腺進行組織病理學分析,結(jié)果顯示,與對照組相比,GDF15處理的小鼠的胰腺炎顯著減少(圖5C和5D)。此外,進一步探究了GDF15是否可以預防或推遲糖尿病的發(fā)生。利用6周齡的NOD小鼠(n=20)每2天服用rGDF15,持續(xù)4周,并在長達24周的時間內(nèi)監(jiān)測糖尿病的發(fā)展,結(jié)果發(fā)現(xiàn)GDF15處理后糖尿病發(fā)病率降低53%。

圖5. GDF15減輕NOD小鼠胰腺炎癥


糖尿病患者胰腺組織中GDF15水平的研究

最后,為了驗證GDF15在臨床水平上的可靠性,分析了糖尿病供體胰腺中GDF15的水平。免疫染色分析顯示,T1D患者的胰島中GDF15的豐度降低了約10倍,并且T2D患者和非糖尿病對照者的胰島中GDF15豐度相似(圖7A、B)。綜上所述,研究表明,患有T1D的人胰島中GDF15的豐度降低,與在促炎細胞因子處理的胰島和患有胰腺炎的NOD小鼠的胰島中發(fā)現(xiàn)的情況相似。

圖6. GDF15在人胰腺中的表達


總結(jié)

該研究提供了一個獨特的資源,用于鑒定受促炎癥細胞因子調(diào)控的人胰島蛋白。研究證明了在IL-1+干擾素-γ調(diào)控的β細胞中促凋亡和抗凋亡蛋白之間存在不平衡。這種不平衡包括轉(zhuǎn)錄后GDF15的下調(diào),目前顯示GDF15是一種抗凋亡蛋白。人類胰島蛋白質(zhì)組的進一步擴展和挖掘有可能為糖尿病的治療指明新的途徑。


人胰島蛋白質(zhì)組學綜合分析確定GDF15為1型糖尿病干預靶點

期刊名稱:Cell Metabolism

影響因子:21.567

樣本選擇:細胞因子處理胰島和對照胰島

技術(shù)策略:TMT蛋白質(zhì)組學

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