小云前面提到：想要突破生信內(nèi)卷，可以從臨床出發(fā)找新出路

主要包括3類：1）從一些臨床問題入手

??????????????2）利用一些臨床數(shù)據(jù)庫做分析

??????????????3）拉上臨床試驗，做成臨床+基礎(chǔ)研究類開拓性新思路

第1和3條路小云都給朋友們分享過相關(guān)思路，感興趣的小伙伴可點擊文末鏈接或公眾號搜索觀看哦

咱們這回從第2條——臨床數(shù)據(jù)庫入手，臨床公共數(shù)據(jù)庫也有很多，常用的、發(fā)文量比較多的比如SEER、NHANES數(shù)據(jù)庫等，分析不難，并且又比較容易發(fā)高分，實在是個不可多得的發(fā)文好途徑呀~?~

????

先介紹一下SEER數(shù)據(jù)庫！（NHANES數(shù)據(jù)庫后面介紹相關(guān)分析文章，敬請期待哦）

p?什么是SEER數(shù)據(jù)？

SEER數(shù)據(jù)庫（Surveillance, Epidemiology, and End Results Program），是美國國家癌癥研究所監(jiān)測，流行病學(xué)和最終結(jié)果數(shù)據(jù)庫，是臨床常用的公共數(shù)據(jù)庫之一。它收錄了大量的臨床腫瘤回顧性研究資料，數(shù)據(jù)獲取便捷并且公開免費，以SEER數(shù)據(jù)庫為數(shù)據(jù)來源的SCI文章正逐年增長。網(wǎng)址：

https://seer.cancer.gov/SEER

p?SEER數(shù)據(jù)庫內(nèi)容

SEER數(shù)據(jù)庫涵蓋了9大類部位腫瘤：乳腺腫瘤、結(jié)腸與直腸腫瘤、其他消化系統(tǒng)腫瘤、女性生殖系統(tǒng)腫瘤、淋巴系統(tǒng)腫瘤與血液系統(tǒng)腫瘤、男性生殖腫瘤、呼吸系統(tǒng)腫瘤、泌尿系統(tǒng)腫瘤及其他尚未確定的類型（最大的四個癌癥組是肺癌，結(jié)腸癌/直腸癌，乳腺癌和前列腺癌）。數(shù)據(jù)記錄中包括患者的注冊編號、個人信息、原發(fā)病灶部位、腫瘤尺寸、腫瘤編碼、治療方案、死亡原因等信息。SEER提交的數(shù)據(jù)將在每年的十一月進(jìn)行檢查，在第二年的四月中旬開放注冊。

今天以一個10分+的SEER數(shù)據(jù)庫分析文章給小伙伴們打個樣，看看如何只用一個數(shù)據(jù)庫做些分析就發(fā)高分，對于臨床研究者相當(dāng)適合、發(fā)文周期也比較快，感興趣的朋友抓緊學(xué)起來啦！

l?題目：輔助紫杉烷加蒽環(huán)類藥物與紫杉烷為基礎(chǔ)的化療方案治療老年淋巴結(jié)陽性、三陰性乳腺癌的臨床結(jié)果對比：一項SEER-Medicare研究

l?雜志：European Journal of Cancer.

l?影響因子：IF=10.002

l?發(fā)表時間：2023年2月

研究背景

三陰性乳腺癌(TNBC)是一種與侵襲性臨床過程相關(guān)的乳腺癌亞型。輔助化療降低了淋巴結(jié)陽性TNBC患者的復(fù)發(fā)風(fēng)險并提高了生存率。在患有淋巴結(jié)陽性TNBC的老年婦女中，蒽環(huán)類藥物加紫杉類藥物(ATAX)方案與不含蒽環(huán)類藥物、基于紫杉類藥物的方案(TAX)相比，其益處尚不明確。

研究思路

使用SEER數(shù)據(jù)庫，收集在2010年至2015年間的1106名年齡在66歲及以上的診斷為淋巴結(jié)陽性TNBC的女性患者數(shù)據(jù)。根據(jù)輔助化療方案比較了患者的臨床特征(化療與不化療，ATAX與TAX)。邏輯回歸來估計優(yōu)勢比(OR)和95%置信區(qū)間(CIs)。Kaplan-Meier生存曲線用于估計3年總生存率(OS)和癌癥特異性生存率(CSS)。在控制患者和腫瘤特征的情況下，采用Cox比例風(fēng)險模型來分析OS和CSS。

主要結(jié)果

1. 患者基線特征

2010年至2015年間的1106名年齡在66歲及以上的診斷為淋巴結(jié)陽性TNBC的女性患者被納入隊列分析，患者基線特征見表1。

表1?患者基線特征

2.?與使用輔助化療有關(guān)的因素分析

Logistic回歸分析對化療與未化療、含紫杉烷+蒽環(huán)類藥物方案與含紫杉烷方案的變量（包括患者基本特征、腫瘤大小和淋巴結(jié)狀態(tài)和醫(yī)學(xué)共?。┻M(jìn)行OR估計（表2）。分析顯示，與66-70歲的患者相比，年齡≥76歲的患者接受輔助化療、接受ATAX與TAX治療的可能性較低。在接受以紫杉烷為基礎(chǔ)的化療方案的患者中，有4個或更多陽性淋巴結(jié)的患者比有1-3個陽性淋巴結(jié)的患者更有可能接受ATAX治療(OR 1.63，95% CI:1.13-2.37，P < 0.01)。與沒有心力衰竭的患者相比，先前診斷為心力衰竭的患者接受輔助化療的可能性更低，然而，在接受輔助化療的既往心力衰竭患者中，接受ATAX與TAX的比例沒有顯著差異。（ps：邏輯回歸分析也可以用小云新開發(fā)的零代碼生信分析小工具實現(xiàn)，云生信分析工具平臺包含超多零代碼分析和繪圖小工具，上傳數(shù)據(jù)一鍵出圖，感興趣的小伙伴歡迎來嘗試喲，網(wǎng)址：http://www.biocloudservice.com/home.html）。

表2?與使用輔助化療有關(guān)因素的邏輯回歸分析

3. 化療類型與生存期分析

Kaplan-Meier生存曲線用于估計接受化療與未接受化療患者、接受ATAX與TAX化療患者的3年總生存率(OS)和癌癥特異性生存率(CSS)。結(jié)果顯示，化療顯著改善了CSS和OS（圖1A, B）。對于接受含紫杉烷方案的患者，接受ATAX的患者與接受TAX的患者相比，在CSS或OS方面沒有差異（圖1C, D）。在有四個或更多淋巴結(jié)的患者中，與TAX相比，ATAX有改善CSS和OS的趨勢(圖1G–H)。

圖1 化療類型與生存期分析

4. 控制協(xié)變量的CSS和OS的分析

在控制患者和腫瘤特征等協(xié)變量的情況下，采用多變量Cox風(fēng)險模型來分析OS和CSS，并繪制森林圖。結(jié)果顯示，與TAX相比，ATAX并沒有改善CSS。然而，當(dāng)按年齡和陽性淋巴結(jié)數(shù)目分層時，CSS中出現(xiàn)了一種特定的趨勢——與TAX相比，接受ATAX治療的年齡大于等于76歲且有4個或更多陽性淋巴結(jié)的老年患者的CSS有所改善；?ATAX治療的老年患者淋巴結(jié)受累較少，有1-3個陽性淋巴結(jié)，CSS有減少的趨勢（圖2）。OS的趨勢與CSS趨勢相似（圖3）。

圖2 多變量分析CSS

圖3?多變量分析OS

小結(jié)

這篇文章利用SEER數(shù)據(jù)庫探索不同化療方案對臨床結(jié)果的影響，數(shù)據(jù)分析方法并不復(fù)雜，僅用3圖2表就發(fā)到1區(qū)top的10分+文章，性價比之高讓人驚嘆！如果你也收集樣本困難，但又需要發(fā)高分文章，不妨試試這個思路吧！發(fā)文速度也很快，用于畢業(yè)或單位評審非常哇塞哦