用過很多生物類軟件，有做結(jié)構(gòu)對接的，刪除冗余序列的，序列比對，進(jìn)化樹構(gòu)建，分子模擬，結(jié)構(gòu)展示等等，不管是windows系統(tǒng)還是Linux系統(tǒng)的軟件，接觸到新軟件，從安裝到應(yīng)用，用多了，就覺得都是一個(gè)套路，每用到一個(gè)新軟件，我都會(huì)把它的使用教程寫下來，如果羅列這些教程，對大家用處不大，畢竟每個(gè)人做的領(lǐng)域不同，我用的，不一定是你需要的，因此就寫個(gè)基本適用于所有軟件的教程吧，“授之以魚不如授之以漁”

1.軟件查找：當(dāng)你想解決一個(gè)問題，期望可以找到相關(guān)的軟件來幫你，建議先簡單百度一下，雖然百度簡單好用，但專業(yè)的信息還是很少，推薦用Google查找專業(yè)問題，然后去NCBI pubmed里找文章，發(fā)過文章的軟件更靠譜，看看這個(gè)軟件是否被多個(gè)文章引用過，生物軟件林林總總，難免會(huì)有“渾水摸魚”的，做好前期的調(diào)研工作，后期才不用返工重做，比如你用了一個(gè)冷門的軟件，就可能會(huì)被審稿人質(zhì)疑你結(jié)果的可靠性，這一步軟件的調(diào)研，選擇哪個(gè)軟件還是至關(guān)重要的。

2.軟件下載安裝：下載軟件就不用說了，軟件安裝，如果是Windows系統(tǒng)大家很熟悉，Linux系統(tǒng)如果比較生疏，也無需畏懼，軟件包里一般都會(huì)有一個(gè)install/read me文件，安裝步驟寫得很詳細(xì)，如果出現(xiàn)意料之外的bug，建議Google搜索你出現(xiàn)的bug，我每次都是這樣解決的，要堅(jiān)信，沒有安裝不上的軟件。

3.軟件使用：一般軟件的官方網(wǎng)站上會(huì)有教程，但都是英文的，初看會(huì)比較費(fèi)時(shí)費(fèi)力，所以我都是先百度查找看看有沒有人翻譯過，或?qū)戇^這個(gè)軟件的中文教程，有的話就對照著和英文一起看，沒有的話就只能硬著頭皮看英文的了，使用中如果遇到問題，比如一直報(bào)錯(cuò)，又在網(wǎng)上查不到解決辦法，建議你給軟件開發(fā)者發(fā)Email，我之前有過幾次這種情況，對方非常耐心且熱心的告訴我原因和解決辦法，有一次我用一個(gè)序列分析的軟件，結(jié)果總出錯(cuò)，實(shí)在沒辦法，就給軟件開發(fā)者發(fā)了郵件，他告訴了我這樣的bug可能是因?yàn)檩斎胛募行蛄忻Q包含了”-”，按照他的說明，我做了修改，果然運(yùn)行成功了，軟件官網(wǎng)上都會(huì)有咨詢軟件問題的Email。

另附幾個(gè)對大家可能有用的網(wǎng)址：

信號肽預(yù)測：http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

分子量，靜電荷計(jì)算：http://protcalc.sourceforge.net/

雙系統(tǒng)安裝教程：http://www.360doc.cn/article/7845658_525119337.html

畫進(jìn)化樹：https://itol.embl.de/