「青蓮干貨」蛋白質(zhì)組學(xué)FAQ基礎(chǔ)定義(一)
蛋白質(zhì)組學(xué)(英語:proteomics,又譯作蛋白質(zhì)體學(xué)),是以蛋白質(zhì)組為研究對(duì)象,研究細(xì)胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學(xué)。這個(gè)概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名詞。
以上簡單的介紹了一下什么是蛋白質(zhì)組學(xué)~
現(xiàn)在小編將帶您進(jìn)入今日主題
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1. 蛋白組學(xué)的定義?
答案:蛋白質(zhì)組(Proteome)一詞源于蛋白質(zhì)(protein)與 基因組(genome)兩個(gè)詞的組合,意指“一種基因組所表達(dá)的全套蛋白質(zhì)”,即包括一種細(xì)胞乃至一種生物所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)。蛋白質(zhì)組與轉(zhuǎn)錄組有許多相似之處,也具有時(shí)空特異性,會(huì)隨著環(huán)境、組織或個(gè)體的改變而改變。
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2.?蛋白組學(xué)可以用來發(fā)現(xiàn)什么?
答案:蛋白質(zhì)組學(xué)本質(zhì)上指的是在大規(guī)模水平上研究蛋白質(zhì)的特征,包括蛋白質(zhì)的表達(dá)水平,亞細(xì)胞定位,翻譯后的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質(zhì)水平上的關(guān)于疾病發(fā)生、細(xì)胞代謝、生長發(fā)育以及各種脅迫反應(yīng)等過程的整體而全面的認(rèn)識(shí)。?
3.?SDS-PAGE的原理是什么?
答案:SDS-聚膠電泳,是在聚凝膠系統(tǒng)中引進(jìn)SDS,SDS能斷裂分子內(nèi)和分子間氫鍵,破壞蛋白質(zhì)的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu),強(qiáng)還原劑能使半胱氨酸之間的二硫鍵斷裂,蛋白質(zhì)在一定濃度的含有強(qiáng)還原劑的SDS溶液中,與SDS分子按比例結(jié)合,形成帶負(fù)電荷的SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,這種復(fù)合物由于結(jié)合大量的SDS,使蛋白質(zhì)喪失了原有的電荷狀態(tài)形成僅保持原有分子大小為特征的負(fù)離子團(tuán)塊,從而降低或消除了各種蛋白質(zhì)分子之間天然的電荷差異,由于SDS與蛋白質(zhì)的結(jié)合是按重量成比例的,因此在進(jìn)行電泳時(shí),蛋白質(zhì)分子的遷移速度取決于分子大小。?
4.?WB的原理是什么?
答案:Western Blot采用的是聚疑膠電泳,待檢測物是蛋白質(zhì),“探針”是抗體,“顯色”用標(biāo)記的二抗。SDS-PAGE可對(duì)蛋白質(zhì)樣品進(jìn)行分離,轉(zhuǎn)移到固相載體,例如硝酸纖維素薄膜(NC)上。固相載體可以吸附蛋白質(zhì),并保持電泳分離的多肽類型及其生物學(xué)活性不變。轉(zhuǎn)移后的NC膜就稱為一個(gè)印跡(blot)。用蛋白溶液(如5%BSA)處理,封閉NC膜上的疏水結(jié)合位點(diǎn)。用目標(biāo)蛋白的抗體(一抗)處理NC膜(只有待研究的蛋白質(zhì)才能與ー抗特異結(jié)合形成抗原抗體復(fù)合物),這樣清洗除去未結(jié)合的一抗后,只有在目標(biāo)蛋白的位置上結(jié)合著一抗。用一抗處理過的NC膜再用標(biāo)記的二抗處理(二抗是指一抗的抗體),處理后,帶有標(biāo)記的形成抗體復(fù)合物可以指示一抗的位置,即是待研究的蛋白質(zhì)的位置。
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5.?IP、co-IP、pulldown的區(qū)別是什么?
答案:IP(免疫沉淀):是利用抗原抗體特異性反應(yīng)純化富集目的蛋白的一種方法。
co-IP(免疫共沉淀):可對(duì)兩種已知蛋白是否存在相互作用進(jìn)行驗(yàn)證,也可以驗(yàn)證在總蛋白中是否含有與已知蛋白相互作用的未知蛋白。
Pulldown:帶標(biāo)簽的誘餌蛋白能被特異結(jié)合該標(biāo)簽的固相親和配基捕獲,形成“次級(jí)親和支持物”,用于純化與誘餌蛋白相互作用的其他蛋白。可用來證明兩種已知蛋白間存在的相互作用或?qū)ふ遗c已知蛋白直接發(fā)生相互作用的未知分子。
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本周的FAQ就到此結(jié)束啦~
?我們下周不見不散~