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5分鐘講清楚國科金中“研究基礎(chǔ)”做到什么程度剛剛好,附帶實例展示

2023-01-19 09:44 作者:爾云間  | 我要投稿

“研究基礎(chǔ)”,應(yīng)該是很多人在課題申報中最尷尬,最糾結(jié)的部分。

不用過多的講什么大道理強調(diào)“研究基礎(chǔ)”的重要性,相信大家都清楚的。比如,“科學假說”是國科金的魂,“研究基礎(chǔ)”是根;或者說,國科金需要的是“科學的”假說,而不是空想的假說,而“科學”的核心是要有根據(jù)的,不能閉門造車。

繼續(xù)請出這個表情包來震場子。

部分人尷尬、糾結(jié)的原因無非是巧婦難為無米之炊,前期數(shù)據(jù)太少。對于這類群體的粉絲,如果實在前期數(shù)據(jù)太少,那只能是勸大家厚積薄發(fā),再多充實下數(shù)據(jù);如果還有些數(shù)據(jù),那就繼續(xù)積累基礎(chǔ)的同時,也申請著嘗試下,拼拼人品。

在這里,小仲給大家分享下國科金研究基礎(chǔ)的基本內(nèi)容,粉絲朋友可以根據(jù)自己實際情況,安排自己的進度(如果您對標書依然吃不準,或者想獲得更多的私人建議,歡迎給我們留言,我們會免費給大家回復(fù)。

先上結(jié)論:

根據(jù)實驗的性質(zhì),小仲將整個實驗內(nèi)容分為三部分:驗證、功能和通路;

最理想的研究基礎(chǔ),應(yīng)該做到驗證和功能層面,將通路作為待證實部分;

下面,小仲分別進行詳述驗證、功能和通路的意思。

一、驗證

本質(zhì)上說,是我們通過文獻查詢/二代測序/數(shù)據(jù)挖掘等各種渠道獲得了某個候選基因,我們認為該基因和臨床表型可能存在關(guān)系。在探討機制之前,需要確認這個基因與臨床表型間的相關(guān)性。

p?對臨床樣本、細胞/動物樣本中篩選出的關(guān)鍵基因(hub基因或者通路基因)進行qPCRmRNA/基因表達)

p?WB/IHC/IF(蛋白表達)等檢測

p?比如下圖

二、功能

對表達符合預(yù)期的基因,進一步論述該基因與表型之間的因果關(guān)系,則為基因的功能試驗。

p?在體外(細胞系)、體內(nèi)(一般是動物模型)中進行目的基因的敲低/過表達

p?檢測細胞表型(增殖、凋亡、侵襲、遷移、克隆形成、細胞周期、特定分子指標變化等)和動物表型(疾病指標變化)

p?比如下圖

三、通路

探索該基因通過何種方式實現(xiàn)對臨床表型的影響,通常為一些熟知的熱門通路,比如NF-KB、Wnt等。

p?在功能實驗基礎(chǔ)上,從體內(nèi)、體外去檢測一些熱門信號通路

p?做完基因敲低/過表達之后,做轉(zhuǎn)錄組測序,哪個通路有差異,就找哪個通路,比我們一個個通路去試錯,其實效率更高

p?比如下圖

四、實例展示

比如在‘基于RBBP4介導(dǎo)的自噬性死亡研究雷公藤甲素抗非小細胞肺癌的作用機制’這篇標書中,技術(shù)路線圖的3列,則分別對應(yīng)著驗證、功能和通路三部分諸位粉絲可以對比體會一下。

有話說

其實很難掌控到底什么程度才是剛剛好,小仲給大家提供一個基本邏輯和思路供大家參考。大家根據(jù)自己的經(jīng)費、周期、實驗條件等情況來實際安排,做到自己當前情況下的最優(yōu)解即可,其余的就交給玄學了。


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