DIA蛋白質(zhì)組學(xué)樣品處理步驟
數(shù)據(jù)非依賴(lài)性采集模式(data independent acquisition,DIA)DIA蛋白質(zhì)組學(xué)指利用DIA技術(shù)(如SWATH技術(shù))對(duì)樣品中的蛋白質(zhì)組進(jìn)行檢測(cè)分析。百泰派克生物科技提供基于質(zhì)譜的DIA蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)和蛋白質(zhì)樣品制備服務(wù)。
DIA蛋白質(zhì)組學(xué)
DIA是一種全息式的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集模式。DIA在一級(jí)質(zhì)譜檢測(cè)后,會(huì)對(duì)特定質(zhì)荷比范圍內(nèi)的所有母離子進(jìn)行碎裂,采集所有母離子的碎片離子,并快速地依次掃描相鄰的母離子寬口內(nèi)的所有碎片離子,從而獲得完整的肽段信息,大大提高了數(shù)據(jù)的可重現(xiàn)性。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)可以對(duì)蛋白質(zhì)組進(jìn)行相對(duì)或絕對(duì)定量。
DIA蛋白質(zhì)組學(xué)樣品處理步驟

由于蛋白質(zhì)組非常復(fù)雜,因此沒(méi)有一種標(biāo)準(zhǔn)的方法可以制備蛋白質(zhì)樣品以進(jìn)行質(zhì)譜分析(MS)。具體的樣品處理方案取決于樣品類(lèi)型、實(shí)驗(yàn)?zāi)繕?biāo)和使用的分析方法。設(shè)計(jì)樣品處理策略時(shí)要考慮許多因素,包括蛋白質(zhì)的來(lái)源、類(lèi)型、物理特性、豐度、復(fù)雜性和細(xì)胞位置等。DIA蛋白質(zhì)組學(xué)與其他基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)一樣,其樣品處理步驟一般包括細(xì)胞裂解、高豐度蛋白質(zhì)消耗或目標(biāo)蛋白質(zhì)富集以及蛋白質(zhì)的還原和酶切。