DNA上先驅(qū)轉(zhuǎn)錄因子的序列依賴性表面凝聚

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這是一篇在《Nature Physics》的近期科研報(bào)道
生物分子凝聚物是蛋白質(zhì)的密集組裝體,它們形成不同的生化區(qū)室而不被膜包圍。一些,例如 P 顆粒和應(yīng)力顆粒,表現(xiàn)為液滴并包含數(shù)百萬個(gè)分子。其他的,例如在 DNA 表面形成的轉(zhuǎn)錄凝聚物,很小,含有數(shù)千個(gè)分子。 DNA表面上形成小凝聚物的物理學(xué)仍在討論中。
來自德國馬克斯普朗克復(fù)雜系統(tǒng)物理研究所的Frank Jülicher博士和來自馬克斯普朗克分子細(xì)胞生物學(xué)和遺傳學(xué)研究所的Stephan W. Grill博士的團(tuán)隊(duì)共同合作,使用先驅(qū)轉(zhuǎn)錄因子 Krüppel 樣因子 4 (Klf4) 研究轉(zhuǎn)錄因子縮合物的性質(zhì)。
Frank Jülicher博士和Stephan W. Grill博士的團(tuán)隊(duì)通過實(shí)驗(yàn)證明 Klf4 在高濃度下可以自行相分離,但在低濃度下,Klf4 僅在 DNA 上形成凝聚物。使用光學(xué)鑷子,他們證明這些 Klf4 凝聚物在 DNA 上形成一種表面凝聚。這種表面凝結(jié)涉及從薄吸附層到厚凝結(jié)層的開關(guān)狀轉(zhuǎn)變,這顯示了預(yù)潤濕轉(zhuǎn)變的標(biāo)志。 DNA上縮合物的定位與序列相關(guān),表明Klf4在DNA上的縮合物形成是表面縮合的序列依賴性形式。預(yù)潤濕與序列特異性一起可以解釋表面冷凝物的大小和位置控制。他們推測,先鋒轉(zhuǎn)錄因子在 DNA 上的預(yù)潤濕轉(zhuǎn)變是轉(zhuǎn)錄凝聚物的形成和定位的基礎(chǔ),并為轉(zhuǎn)錄調(diào)控提供了穩(wěn)健性。