銅死亡解鎖細(xì)胞死亡新方式
細(xì)胞死亡的相關(guān)研究一直是生命科學(xué)領(lǐng)域的熱點(diǎn)。依據(jù)發(fā)生機(jī)制的不同 (起始的刺激、中間過程的激活和末端的效應(yīng)器的不同) ,細(xì)胞的死亡可以區(qū)分為不同的方式,常見的有細(xì)胞凋亡、焦亡、壞死、鐵死亡等。

圖 1. 不同死亡方式的比較
"鐵死亡"的相關(guān)研究更是近幾年熱點(diǎn)中的“熱點(diǎn)“,這也證明了金屬元素在細(xì)胞死亡中的獨(dú)特作用。迎來鐵死亡,又遇銅死亡。
今年 3 月題為 Copper induced cell death by targeting lipoylated TCA cycle protein 一文提出:生物體內(nèi)不可缺少的微量元素—銅在其濃度超過了維持穩(wěn)態(tài)機(jī)制的閾值時也會表現(xiàn)出細(xì)胞毒性。這種現(xiàn)象與鐵積累導(dǎo)致細(xì)胞死亡的情況有相似之處 (但機(jī)制明顯區(qū)別于鐵死亡)。研究人員將這種銅離子誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的機(jī)制命名為 “銅死亡” (Cuproptosis)。
■ 銅死亡的簡要機(jī)制
銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡: 當(dāng) Cu2+ 在依賴線粒體呼吸的細(xì)胞中過度積累 (Cu2+ 通過銅離子載體運(yùn)入細(xì)胞),Cu2+ 與硫辛?;?DLAT 結(jié)合,誘導(dǎo) DLAT 的異聚化。不溶性 DLAT 的增加導(dǎo)致細(xì)胞毒性,誘導(dǎo)細(xì)胞死亡。
注:蛋白質(zhì)硫辛?;揎検且环N保守的賴氨酸翻譯后修飾,只發(fā)生在涉及 TCA 循環(huán)的四種蛋白,其中就包括 DLAT。DLAT 是丙酮酸脫氫酶復(fù)合體 (PDH Complex) 組分之一,丙酮酸脫氫酶可催化 TCA 循環(huán)中的丙酮酸脫羧生成乙酰輔酶 A。
FDX1 (一種還原酶、Elesclomol 的直接靶標(biāo)) 作為蛋白質(zhì)硫辛?;揎椀纳嫌握{(diào)節(jié)因子,一方面,參與調(diào)節(jié)蛋白質(zhì) (包括 DLAT) 的硫辛?;A硪环矫?,F(xiàn)DX1 將 Cu2+ 還原成更具毒性的 Cu+,導(dǎo)致 Fe-S 簇蛋白合成的抑制,誘導(dǎo)細(xì)胞死亡。
銅穩(wěn)態(tài)失調(diào)導(dǎo)致的細(xì)胞死亡:? 銅的穩(wěn)態(tài)主要依賴與三個銅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白 SLC31A1、ATP7A/B、SLC31A1,SLC31A1 負(fù)責(zé)攝入銅,ATP7A 和 ATP7B 負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)出銅。銅穩(wěn)態(tài)失調(diào)導(dǎo)致的細(xì)胞死亡與銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡的機(jī)制一致。

圖 2. 銅死亡機(jī)制圖
■? 銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡
在這篇文章中,研究人員測試了 1448 個銅離子載體 (一種高度親脂性的 Cu2+ 結(jié)合分子,可將銅離子送入細(xì)胞),發(fā)現(xiàn)對 489 個細(xì)胞系的細(xì)胞殺傷作用 (圖 3A)。以 Elesclomol (一種高度親脂性的 Cu2+ 載體) 為例,單獨(dú)加入 Elesclomol 不影響細(xì)胞的生長,同時加入銅離子,細(xì)胞生長就會受到極大抑制,而其他金屬離子 (鐵、鈷、鋅和鎳等) 并不會影響細(xì)胞的生長 (圖 3B)。使用 NSC-319726,Disulfiram 等其它銅離子載體處理細(xì)胞也得到了相同的結(jié)果 (圖 3D-E)。
但使用 Tetrathiomolybdate (TTM;一種銅螯合劑) 聯(lián)合 Elesclomol 處理細(xì)胞,可以緩解 Elesclomol 對細(xì)胞的殺傷作用。這些結(jié)果表明銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡主要依賴于細(xì)胞內(nèi)銅的積累。

圖 3. 銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡對銅具有高度選擇性
A:1448 個銅離子載體對 489 個細(xì)胞系的生長抑制;B:不同金屬離子的情況下,用 Elesclomol 處理 MON 細(xì)胞;C:其他銅離子載體條件的細(xì)胞活力測定 D:使用 TTM 預(yù)處理 ABC1 細(xì)胞,然后 Elesclomol 處理
■? 銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡是非凋亡性的
有研究表明 Elesclomol 誘導(dǎo)活性氧依賴性細(xì)胞凋亡,但實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明 Elesclomol 誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡不涉及 Caspase 3 (細(xì)胞凋亡的標(biāo)志) 的切割或激活 (圖 4D-E)。并且當(dāng)細(xì)胞凋亡的關(guān)鍵效應(yīng)子 BAX 和 BAK1 被敲除時,以及用 Caspase 抑制劑 (Z-VAD-FMK 和 Boc-D-FMK) 處理細(xì)胞,Elesclomol 仍然維持對細(xì)胞的殺傷潛力,此外,其他已知細(xì)胞死亡機(jī)制的抑制劑處理細(xì)胞 (包括鐵死亡 (Ferrostatin-1)、壞死性凋亡 (Necrostatin-1) 和氧化應(yīng)激 (N-acetylcysteine) ),也都未能消除銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡。
這些結(jié)果表明銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡機(jī)制與細(xì)胞凋亡途徑不同。

? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?? ? ? ? 圖 4. 銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡不通過凋亡
A:ICP-MS 檢測細(xì)胞內(nèi)的銅離子和鋅離子;B:ES-Cu 處理 細(xì)胞,檢測 Caspase 3/7 的激活;C:檢測 Caspase 3 的表達(dá);F:用 Elesclomol-CuCl2 處理 KO 細(xì)胞,檢測細(xì)胞活力;
■? 線粒體呼吸調(diào)節(jié)銅離子誘導(dǎo)細(xì)胞死亡
研究人員觀察到主要依賴線粒體呼吸的細(xì)胞對銅離子的敏感性更高 (圖 5A)。用線粒體抗氧化劑、脂肪酸和線粒體功能抑制劑等線粒體呼吸途徑相關(guān)的抑制劑處理細(xì)胞,發(fā)現(xiàn):電子傳遞鏈復(fù)合物的抑制劑和線粒體丙酮酸攝取抑制劑 ( UK5099 ) 處理的條件下,銅離子誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡受抑制,鐵死亡抑制劑的處理對其沒有影響 (GPX4 抑制劑 ML162 ) (圖 5B)。
此外,線粒體氧化磷酸化解偶聯(lián)劑 FCCP 處理對銅離子誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡沒有影響。這些結(jié)果表明 線粒體呼吸途徑是銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的必要條件 。
https://zhuanlan.zhihu.com/p/536402438
研究人員還對比了缺氧條件刺激以及 FG-4592 激活缺氧誘導(dǎo)因子 (HIF) 途徑,發(fā)現(xiàn)只有真實(shí)缺氧條件會降低細(xì)胞對銅離子載體的敏感性 (圖 5D),進(jìn)一步確認(rèn)了線粒體呼吸在銅誘導(dǎo)細(xì)胞死亡中的關(guān)鍵作用。
隨后,研究人員分析銅離子處理對細(xì)胞耗氧率 (OCR) 的影響,結(jié)果顯示 Elesclomol 的處理會影響細(xì)胞的最大耗氧量 (圖 5E)。 這表明銅離子可能不直接影響電子傳遞鏈,而是影響三羧酸循環(huán) (TCA)。

圖 5. 線粒體呼吸調(diào)節(jié)銅細(xì)胞誘導(dǎo)細(xì)胞死亡
A-B:葡萄糖或半乳糖的條件下,檢測細(xì)胞活力;B:Elesclomol 等處理細(xì)胞,檢測細(xì)胞活力;C:FCCP 預(yù)處理細(xì)胞后用 Elesclomol 處理,檢測細(xì)胞活力;D:對照組 (21% O2)、缺氧的條件 (1% O2) 或 FG-4592 (21% O2) 條件下檢測細(xì)胞活力;E:細(xì)胞耗氧率檢測
■? FDX1 和蛋白硫辛?;倾~細(xì)胞誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的關(guān)鍵調(diào)節(jié)者
為進(jìn)一步闡明銅離子和 TCA 循環(huán)之間的聯(lián)系。研究人員使用 CRISPR-Cas9 技術(shù),分別敲除不同的基因,再使用銅離子載體 (Elesclomol-copper) 處理細(xì)胞,以確定涉及參與銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的基因。
結(jié)果發(fā)現(xiàn)有 7 個基因的敲除可以明顯緩解銅離子載體介導(dǎo)的細(xì)胞殺傷作用 (圖 6A-C),包括 FDX1,LIPT1、LIAS、DLD (硫辛酸途徑的三個關(guān)鍵酶),DLAT、PDHA1、PDHB (丙酮酸脫氫酶復(fù)合體的三個組分)。另外,敲除 FDX1 和 LIAS 基因明顯減輕銅離子載體引起的細(xì)胞毒性(圖 6D-E),研究人員猜測 FDX1 有可能是蛋白質(zhì)硫辛酰化修飾的上游調(diào)節(jié)因子。

圖 6. FDX1 和硫辛酸途徑相關(guān)基因是銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡的關(guān)鍵介質(zhì)
A:敲除了不同基因后,細(xì)胞參與銅離子載體誘導(dǎo)的死亡的基因 B:硫辛酸通路的示意圖;C-E:敲除 ABC1 細(xì)胞的 FDX1 和 LIAS 基因,用 Elesclomol 處理細(xì)胞,檢測細(xì)胞活力。
為進(jìn)一步驗(yàn)證這個假設(shè),研究人員通過資源庫 Cancer Dependency Map,發(fā)現(xiàn) FDX1 和硫辛酸途徑相關(guān)蛋白在銅離子載體誘導(dǎo)細(xì)胞死亡方面是高度相關(guān)的 (圖 7A)。隨后,研究人員選取腫瘤樣本,對 FDX1 和硫辛?;鞍走M(jìn)行免疫組化染色,發(fā)現(xiàn) FDX1 和硫辛?;鞍妆磉_(dá)顯著相關(guān) (圖 7B-C)。敲除 FDX1 會導(dǎo)致 DLAT 蛋白和 DLST 蛋白的硫辛?;笔?(圖 7D),還會導(dǎo)致細(xì)胞呼吸水平下降 (圖 7E)。
此外,研究人員通過代謝物分析發(fā)現(xiàn)敲除 FDX1 會導(dǎo)致丙酮酸和 α-酮戊二酸積累和琥珀酸的的消耗。還觀察到 LIAS 的關(guān)鍵底物 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 的積累。這些結(jié)果表明 FDX1 是蛋白質(zhì)硫辛?;纳嫌握{(diào)節(jié)劑 (圖 7F)。

圖 7. FDX1 是蛋白質(zhì)硫辛?;纳嫌握{(diào)節(jié)器
A:FDX1 敲除的相關(guān)基因網(wǎng)絡(luò);B-C:腫瘤樣本的 FDX1 和硫辛酸的免疫組化染色;D:敲除 FDX1,檢測硫辛?;鞍椎谋磉_(dá)量;E:敲除 FDX1 基因,檢測細(xì)胞耗氧率;F:敲除 FDX1,檢測與硫辛?;緩较嚓P(guān)的代謝物的變化。
■? 銅直接結(jié)合并誘導(dǎo)硫辛?;?DLAT 的寡聚化
有研究報道銅離子與游離脂酸的離解常數(shù)為 10–17,這表明銅離子有可能直接與硫辛?;鞍捉Y(jié)合 。 為了驗(yàn)證這一猜想,研究人員純化了 DLAT 和 DLST 蛋白,發(fā)現(xiàn) DLAT 和 DLST 都可以與偶聯(lián)銅的樹脂結(jié)合 (圖 8A)。而敲除 FDX1 會導(dǎo)致 DLAT 蛋白的硫辛?;揎椣?,且 DLAT 和 DLST 也不再與偶聯(lián)銅的樹脂結(jié)合 (圖 8B)。 這表明蛋白質(zhì)的硫辛?;揎検墙Y(jié)合銅的必要條件 。此外,銅與硫辛?;鞍?DLAT 的結(jié)合,會導(dǎo)致蛋白的寡聚化。而?Elesclomol?處理會增加 DLAT 蛋白的寡聚化 (圖 8C-D)。
原文參考:http://www.activeinhibitor.com/xw/995.html
上述結(jié)果表明:在銅離子載體處理后硫辛?;鞍椎亩拘允怯伤鼈儺惓5墓丫圩饔媒閷?dǎo)的。此外質(zhì)譜分析還發(fā)現(xiàn)銅離子載體處理會導(dǎo)致 Fe-S 簇蛋白的水平降低 (圖 8E),這整個過程都依賴于 FDX1 蛋白的存在。

圖 8.? 銅直接結(jié)合硫辛酰化的 DLAT 并誘導(dǎo)其寡聚化
A:細(xì)胞提取蛋白和偶聯(lián)銅的樹脂的結(jié)合;B:FDX1 敲除細(xì)胞中提取蛋白和偶聯(lián)銅的樹脂的結(jié)合;C:IB 分析 DLAT 蛋白寡聚化;D: 免疫熒光共定位分析 E: Mass 分析
■? 銅誘導(dǎo)細(xì)胞死亡機(jī)制與銅穩(wěn)態(tài)失調(diào)的遺傳模型相同
銅的穩(wěn)態(tài)主要依賴與三個銅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白? (圖 9A)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證與銅離子載體介導(dǎo)的死亡與自然狀態(tài)下的銅紊亂的機(jī)制是否相同,研究人員過表達(dá) SLC31A1(圖 9B)。另外,過表達(dá) SLC31A1 的細(xì)胞被銅離子載體處理后蛋白硫辛酰化減少,F(xiàn)e-S 簇蛋白水平降低,HSP70 水平升高 (圖 9C)。
在過表達(dá) SLC31A1 的細(xì)胞中使用鐵死亡、壞死性凋亡和凋亡抑制劑不影響銅誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡,銅螯合劑卻可緩解銅離子載體產(chǎn)生的細(xì)胞殺傷作用 (圖 9D)。老年 ATP7B 缺陷小鼠 (Atpb7b?/?,銅失調(diào)綜合征 Wilson’s disease 模型) 與雜合子 (Atpb7b+/?) 和野生型對照小鼠對比,發(fā)現(xiàn) ATP7B 缺陷小鼠的肝臟中蛋白的硫辛?;胶?Fe-S 簇蛋白的含量均有顯著降低,Hsp70 蛋白則有明顯增加 (圖 9F)。 多種模型證明銅穩(wěn)態(tài)失調(diào)導(dǎo)致的細(xì)胞死亡和銅離子載體誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡是同一種機(jī)制 。

圖 9. 化學(xué)和基因誘導(dǎo)的銅依賴的細(xì)胞死亡之間具有共同的機(jī)制性
A:銅穩(wěn)態(tài)示意圖;B-C:過表達(dá)SLC31A1,CuCl2 處理細(xì)胞;D:用? Nec-1 等處理過表達(dá) SLC31A1 的細(xì)胞,加入 CuCl2,檢測細(xì)胞活力;E:FDX1 KO 細(xì)胞中過表達(dá) SLC31A1,加入 CuCl2 處理后檢測細(xì)胞的活力;F:檢測 Atpb7b-/- 小鼠與對照組肝臟的蛋白質(zhì)含量
總結(jié):
這項(xiàng)研究通過利用多種死亡方式的誘導(dǎo)劑與抑制劑從多維度闡明了銅離子誘導(dǎo)的細(xì)胞死亡是一種新型細(xì)胞死亡即銅死亡。研究人員發(fā)現(xiàn)銅離子積累主要通過調(diào)控 FDX1 來介導(dǎo)銅死亡。
一方面,F(xiàn)DX1 將 Cu 2+? 還原成更具毒性的 Cu + ,可促使 TCA 循環(huán)中硫辛?;鞍桩惓9丫刍?,另一方面,F(xiàn)DX1 導(dǎo)致 Fe-S 簇蛋白的不穩(wěn)定。