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醫(yī)學(xué)AI公司Owkin:打破數(shù)據(jù)孤島以加速藥物研發(fā)

2020-05-20 12:02 作者:財(cái)經(jīng)涂鴉  | 我要投稿

“治療疾病的真相在于人類數(shù)據(jù)的研究。”

作者:步搖

編輯:tuya

出品:財(cái)經(jīng)涂鴉

5月9日,Owkin獲得了2500萬(wàn)美元融資,此輪融資的投資者包括Bpifrance Large Venture、Cathay Innovation和MACSF(法國(guó)臨床醫(yī)生養(yǎng)老基金),以及現(xiàn)有投資者GV等,加上這一筆融資,公司的A輪融資總額已經(jīng)達(dá)到了4310萬(wàn)美元。

Owkin成立于2016年,由血液腫瘤學(xué)家和研究員Thomas Clozel與計(jì)算機(jī)科學(xué)教師研究人員Gilles Wainrib以及斯坦福大學(xué)PostDoc共同創(chuàng)立。公司的最終目標(biāo)是希望制藥公司、大學(xué)和其他研究機(jī)構(gòu)能夠一同進(jìn)入他們所提供的虛擬實(shí)驗(yàn)室,并將他們的研究成果進(jìn)行共享,這樣就能夠使他們了解為什么藥物效果因人而異,從而改善藥物研發(fā)過(guò)程。

公司主要產(chǎn)品是Owkin Studio,它能夠收集生物醫(yī)學(xué)圖像、基因組學(xué)研究和臨床數(shù)據(jù)。醫(yī)學(xué)工作者可以登錄到Owkin Studio,訪問(wèn)匿名數(shù)據(jù)集和模型,從而了解藥物療效因患者而異的原因,完善藥物開(kāi)發(fā)過(guò)程,確定更適合患者的藥物以改善治療效果。目前,Owkin的醫(yī)學(xué)研究合作涉及了腫瘤學(xué)、免疫學(xué)和心血管疾病。

在新冠疫情期間,Owkin啟動(dòng)了Covid-19開(kāi)放AI聯(lián)盟(COAI),通過(guò)自身的平臺(tái)來(lái)共享信息,以推動(dòng)治療方法的臨床開(kāi)發(fā)。

Owkin CEO Thomas Clozel(左)和CSO Gilles Wainrib(右)


如何用機(jī)器學(xué)習(xí)來(lái)加快醫(yī)療研發(fā)?

全球醫(yī)藥行業(yè)對(duì)醫(yī)療大數(shù)據(jù)與人工智能的需求日益提升。在8000億美元的醫(yī)藥市場(chǎng)中,每年專利失效的藥品約占5%,且專利失效的速度也在加劇,這促使藥企研發(fā)新藥來(lái)應(yīng)對(duì)行業(yè)競(jìng)爭(zhēng),研發(fā)的需求更加廣泛。同時(shí),基于AI的精準(zhǔn)治療也逐步成為醫(yī)療(特別是癌癥)領(lǐng)域的主流發(fā)展方向。

Owkin目前的主要產(chǎn)品是一個(gè)名為蘇格拉底的平臺(tái),這個(gè)面向醫(yī)學(xué)研究者的平臺(tái)通過(guò)機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)算法,讓用戶可以輕松創(chuàng)建預(yù)測(cè)模型,并在應(yīng)用在醫(yī)學(xué)研究的每個(gè)領(lǐng)域,包括優(yōu)化藥物開(kāi)發(fā)、生存預(yù)測(cè)、目標(biāo)發(fā)現(xiàn)、臨床試驗(yàn)還有藥品市場(chǎng)分析。

在實(shí)際應(yīng)用中,Owkin的的技術(shù)人員提供機(jī)器學(xué)習(xí)的專業(yè)知識(shí),讓醫(yī)學(xué)專家的研發(fā)力大幅提升,讓專家們結(jié)合海量的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù),更好的使用機(jī)器學(xué)習(xí)來(lái)實(shí)現(xiàn)研發(fā)過(guò)程。

這次融資,Owkin打算利用新資金建立一個(gè)虛擬實(shí)驗(yàn)室,讓參與研發(fā)的各方諸如數(shù)據(jù)科學(xué)家,臨床醫(yī)生,學(xué)者和制藥公司都可以登錄到Owkin稱為Owkin Studio的虛擬實(shí)驗(yàn)室當(dāng)中。在這個(gè)虛擬環(huán)境中,所有的參與者都有權(quán)訪問(wèn)匿名數(shù)據(jù)集和模型,以完善自己的研究和開(kāi)發(fā)。通過(guò)這樣的方式,所有參與研發(fā)的人員都能確保對(duì)新型生物標(biāo)志物的作用機(jī)制和預(yù)測(cè)模型有最前沿的認(rèn)知,并將這些新數(shù)據(jù)用于他們的研發(fā)過(guò)程中。

Owkin的盈利方式也來(lái)源于這種數(shù)據(jù)分享。Owkin通過(guò)允許遠(yuǎn)程訪問(wèn)制藥公司的數(shù)據(jù)集并將大學(xué)開(kāi)發(fā)的模型許可給這些公司來(lái)賺錢,這種方式吸引了研究人員源源不斷的加入,并為過(guò)去40年來(lái)一些資金下降的研究機(jī)構(gòu)提供了額外的收入來(lái)源。

公司首席執(zhí)行官Thomas Clozel表示,我們有一大批學(xué)術(shù)大學(xué)正在開(kāi)發(fā)算法并共享數(shù)據(jù),最終,它有助于開(kāi)發(fā)更好的藥物?!?/p>

GV的普通合伙人(GP)Adam Ghobarah表示,Owkin利用EHR衍生的臨床數(shù)據(jù)、病理成像和測(cè)序數(shù)據(jù),創(chuàng)建了一種差異化的方法來(lái)獲得豐富的數(shù)據(jù)集,這對(duì)研究機(jī)構(gòu)和制藥行業(yè)來(lái)說(shuō)非常有價(jià)值。”

Owkin如何加快研發(fā)進(jìn)程,有一個(gè)案例可以說(shuō)明。Owkin之前在《自然·醫(yī)學(xué)》上發(fā)表過(guò)題為《基于深度學(xué)習(xí)的間皮瘤分類可改善對(duì)患者結(jié)局的預(yù)測(cè)》的論文描述了Owkin如何基于肺組織活檢圖像開(kāi)發(fā)了詳細(xì)而準(zhǔn)確的預(yù)后模型,以預(yù)測(cè)疾病進(jìn)展并鑒定間皮瘤的相關(guān)生物學(xué)特征。

Owkin的名為MesoNet的深度學(xué)習(xí)模型用于分析來(lái)自近3000名間皮瘤患者的胸膜手術(shù)活檢的數(shù)字化全片圖像(WSI)。為了培訓(xùn)和測(cè)試MesoNet,Owkin使用了來(lái)自MESOBANK的廣泛數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集來(lái)自多個(gè)法國(guó)機(jī)構(gòu)。著名的法國(guó)癌癥研究所Center Leon Berard(CLB)的病理學(xué)醫(yī)學(xué)專家對(duì)模型結(jié)果進(jìn)行了專家驗(yàn)證,證實(shí)了MesoNet優(yōu)于所有現(xiàn)有的生存模型,并且在通過(guò)The Cancer的不同染色圖像成功驗(yàn)證后證明了異質(zhì)性的魯棒性基因組圖譜(TGCA)。

除了其預(yù)測(cè)性能和表征間皮瘤亞組的新穎方法外,Owkin開(kāi)發(fā)的深度學(xué)習(xí)模型還能夠突出顯示與預(yù)后預(yù)測(cè)相關(guān)的精準(zhǔn)區(qū)域。這種關(guān)鍵的可解釋性功能,再加上使用Owkin軟件平臺(tái)與專家病理學(xué)家進(jìn)行的原始迭代合作,已導(dǎo)致鑒定出新穎的生物學(xué)特征,從而可以更深入地解釋這種疾病的異質(zhì)性。

Leon Leonard中心病理學(xué)教授Fran?oiseGalateau表示,除了改善我們的預(yù)后模型外,MesoNet還能夠在腫瘤微環(huán)境的基質(zhì)區(qū)域內(nèi)識(shí)別出可以預(yù)測(cè)生存的新生物標(biāo)記,這種能力確實(shí)使Owkin的AI模型與眾不同,并為我們?cè)陂g皮瘤研究中提供了新的方向。

Owkin現(xiàn)在正在與生物制藥行業(yè)的合作伙伴合作,利用這一見(jiàn)識(shí)來(lái)豐富臨床試驗(yàn)中的患者選擇,并確定哪些患者最有風(fēng)險(xiǎn),因此最適合在試驗(yàn)環(huán)境中采用新的藥物治療方法。Owkin在學(xué)術(shù)界與生物制藥行業(yè)之間進(jìn)行合作的創(chuàng)新模式正在從在試驗(yàn)和臨床實(shí)踐中從患者身上獲得的真實(shí)數(shù)據(jù)中產(chǎn)生新的治療方法。

克洛澤爾表示,“間皮瘤患者的生存期從幾個(gè)月到幾年都顯示出很高的變異性,我們的研究有助于解釋這種變異的生物學(xué)原因,并將最終開(kāi)發(fā)出更具針對(duì)性的藥物來(lái)治療這些疾病。

而這些數(shù)據(jù)如何改善患者的治療護(hù)理?公司表示,制藥行業(yè)面臨的一個(gè)重要問(wèn)題是,它無(wú)法充分利用其生成的數(shù)據(jù),另一個(gè)問(wèn)題是訪問(wèn)現(xiàn)實(shí)世界的數(shù)據(jù)非常昂貴,Owkin通過(guò)基于現(xiàn)實(shí)世界中患者生成的數(shù)據(jù)的集體信息來(lái)解決這些問(wèn)題。

公司補(bǔ)充到,制藥業(yè)的典型用例是利用我們的技術(shù),以及在現(xiàn)實(shí)世界數(shù)據(jù)上預(yù)先訓(xùn)練的數(shù)據(jù),通過(guò)基于耐藥性和毒性的患者隊(duì)列更好地了解藥物開(kāi)發(fā)機(jī)會(huì)。我們可以幫助公司通過(guò)成像或其他生物標(biāo)記物在臨床試驗(yàn)中微調(diào)患者招募,同時(shí),制藥公司還可以購(gòu)買使用與合作伙伴一起開(kāi)發(fā)的真實(shí)數(shù)據(jù),生物標(biāo)記或目標(biāo)構(gòu)建的預(yù)測(cè)模型。

充當(dāng)企業(yè)和科研力量的廣泛“節(jié)點(diǎn)”

在醫(yī)療領(lǐng)域,Owkin充當(dāng)了一個(gè)大“節(jié)點(diǎn)”——鏈接科研、醫(yī)院和制藥等機(jī)構(gòu)。同樣不可忽視的是,Owkin也是推動(dòng)這些鏈接的重要力量,或者說(shuō),推動(dòng)數(shù)據(jù)打通也是醫(yī)療技術(shù)的一個(gè)重大進(jìn)步。

Owkin任命帕克·莫斯(Parker Moss)為首席業(yè)務(wù)官,帕克將致力于加強(qiáng)Owkin與醫(yī)院,學(xué)術(shù)中心以及制藥和生物技術(shù)公司的合作關(guān)系。帕克曾在英國(guó)國(guó)家衛(wèi)生局(NHS)工作了五年,擔(dān)任過(guò)英國(guó)最大的NHS社區(qū)服務(wù)提供商Virgin Care的首席技術(shù)官。

帕克曾表示,了解疾病生物學(xué)的'基本事實(shí)'是提高某些最復(fù)雜和破壞性疾病的存活率并降低治療毒性的關(guān)鍵,而'真相'在于人類數(shù)據(jù)的研究。帕克的任務(wù)是打破數(shù)據(jù)孤島,并創(chuàng)建對(duì)在真實(shí)數(shù)據(jù)上訓(xùn)練的情報(bào)的獲取。

Owkin與安進(jìn)(Amgen)和羅氏(Roche)等一些最大的制藥公司合作,并與居里研究所(Institut Curie)和INSERM(僅次于NCI的世界第二大癌癥研究組織)進(jìn)行了研究合作。

不止于此,Owkin和很多公司和機(jī)構(gòu)都有跨領(lǐng)域的多種合作。2020年3月,Owkin與匹茲堡大學(xué)合作設(shè)計(jì)和驗(yàn)證高級(jí)機(jī)器學(xué)習(xí)模型。2019年12月2日,Owkin宣布,將與科技公司 NVIDIA 和倫敦國(guó)王學(xué)院合作,在醫(yī)療和生命科學(xué)領(lǐng)域提供聯(lián)合學(xué)習(xí)。Owkin還與國(guó)際注冊(cè)機(jī)構(gòu)CAPACITY合作研究新冠病毒患者的心血管并發(fā)癥,CAPACITY與全球50多個(gè)中心都有合作。

此外,Owkin還有全球一級(jí)學(xué)術(shù)醫(yī)療中心的網(wǎng)絡(luò)Okin Loop ,在那里,科學(xué)家可以從參與培訓(xùn)和驗(yàn)證分散數(shù)據(jù)的模型,通過(guò)擴(kuò)展培訓(xùn)數(shù)據(jù)集的大小,Okin確保模型可以在不刪除醫(yī)院數(shù)據(jù)的情況下對(duì)異構(gòu)數(shù)據(jù)進(jìn)行培訓(xùn),該網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)包括法國(guó)和美國(guó)的一級(jí)醫(yī)院,KCL及其倫敦醫(yī)院合作伙伴將是英國(guó)第一個(gè)參與學(xué)術(shù)醫(yī)療聯(lián)盟。

Owkin與學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)、科技公司、制藥公司和醫(yī)院的廣泛合作,不僅為其數(shù)據(jù)打通奠定了基礎(chǔ),同時(shí)也能充當(dāng)各個(gè)機(jī)構(gòu)的連接點(diǎn),幫助各個(gè)平臺(tái)提升研發(fā)效率,從而又能吸引更多的力量加入,形成正循環(huán),超大節(jié)點(diǎn)也是Owkin所構(gòu)建的無(wú)形競(jìng)爭(zhēng)力。

目前Owkin有98名員工,都是來(lái)自機(jī)器學(xué)習(xí)、統(tǒng)計(jì)、醫(yī)學(xué)、生物學(xué)和商業(yè)等領(lǐng)域的人才,其中包括24位博士、87位碩士和屢獲殊榮的數(shù)據(jù)科學(xué)家。Owkin打算利用新一輪融資的資金來(lái)擴(kuò)大其員工人數(shù),并繼續(xù)與學(xué)術(shù)研究機(jī)構(gòu)建立合作伙伴關(guān)系。

2019年3月8日,Owkin完成A輪融資,該輪融資由斯道資本(富達(dá)亞洲)和F-Prime Capital Partners領(lǐng)投,以及凱輝基金跟投。2018年1月,Owkin獲得了1100萬(wàn)美元A輪融資,由Otium Venture領(lǐng)投,Cathay Innovation, Plug and Play和NJF Capital跟投。

根據(jù)《健康經(jīng)濟(jì)學(xué)雜志》(Journal of Health Economics)2016年的一篇論文,將一種藥物推向市場(chǎng)平均需要花費(fèi)19億歐元和13年?;诖耍絹?lái)越多技術(shù)致力于推動(dòng)這個(gè)進(jìn)程和費(fèi)用的縮短。

在美國(guó),由比爾·蓋茨(Bill Gates)和對(duì)沖基金經(jīng)理大衛(wèi)·肖(David EShaw)投資的Schr?dinger完成了一輪1.1億美元的融資,總部位于波士頓的Relay Therapeutics從包括軟銀愿景基金在內(nèi)的投資者那里籌集了4億美元。技術(shù)顛覆醫(yī)療的進(jìn)程正在展開(kāi)。

醫(yī)學(xué)AI公司Owkin:打破數(shù)據(jù)孤島以加速藥物研發(fā)的評(píng)論 (共 條)

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