雖然說兩鄭內(nèi)戰(zhàn)并沒有造成太多的兵力損失，但是其影響卻是極其惡劣的，這場內(nèi)戰(zhàn)實際上加速了明鄭政權(quán)的瓦解。

在平叛之戰(zhàn)后，鄭經(jīng)突然將自己的叔父鄭泰逮捕，主要是因為鄭泰手里掌握著一支龐大的水師，大約在萬余人左右，在鄭經(jīng)繼承王位之后，鄭經(jīng)得到了鄭泰私通黃昭的證據(jù)，于是將其逮捕，不久鄭泰自殺身亡，其親信蔡璋、弟弟鄭鳴俊、兒子鄭纘緒帶領(lǐng)戰(zhàn)船100余艘，士兵7000多人到福建向清廷投降，隨后，恐慌在鄭軍中蔓延，右武衛(wèi)楊富、左武衛(wèi)何義、禮官都 事陳彭、參知軍政事蔡雷鳴、侍郎蔡協(xié)吉、通政蔡源、忠靖伯陳輝、統(tǒng)領(lǐng)掛寧南將軍印左都督陳舜穆率轄下總兵二員、副總兵六員、參將二十員、游擊十九員、都司三員、守備一員、兵部主事一員、工部郎中一員、監(jiān)紀(jì)推官二員向清方投降，前后降清的鄭軍戰(zhàn)兵超過一萬人，處于風(fēng)雨飄搖之中的明鄭政權(quán)遭到了沉重的打擊。

屋漏偏逢連夜雨，此時，荷蘭人又回來了?？滴醵臧嗽拢逋㈩C圣旨于荷蘭艦隊司令波特：“荷蘭國夾板船十七只，攜帶火藥、兵器等，駛抵閩安鎮(zhèn)。伊等恪守諾言，前來助剿海賊，殊甚可嘉。”雙方的勾結(jié)實際上始于康熙元年的七月，但直到康熙二年的十月，雙方才達(dá)成協(xié)議。這份協(xié)議，總共十一條，因為篇幅原因，就說一下七、八、九條吧：“荷蘭東印度公司創(chuàng)中國與一切華人得享有貿(mào)易之自由，不受任何干涉；克復(fù)金廈兩島后，兩國共駐軍隊，以防海賊攻擊；克復(fù)金廈兩島后，聯(lián)軍應(yīng)駛往臺灣，攻取此島后，清軍應(yīng)將該島以及一切城堡物件交與荷蘭人，以供其居住”。

所以不能不說，和很多人想的不同，清統(tǒng)治者的眼中只有這幾個關(guān)鍵詞：朱氏、大明、延平王、招討大將軍，至于其他的東西，對于清王朝來說真的沒那么重要，大清的頭頭腦腦們根本就不在乎。

十月，清朝與荷蘭兩方共同舉兵，清廷陸師提督馬得功帶領(lǐng)楊富、鄭鳴俊等鄭軍叛徒自泉州港出海，水師提督施瑯以及另一個鄭軍叛徒黃梧從海澄港出兵，耿繼茂以及荷蘭海軍司令波特從同安的劉五店出海，三路大軍氣勢洶洶地殺向金廈，廈門高崎守將陳升帶兵出海投降清軍。到初五日，明清兩軍在潯尾海域開戰(zhàn)。

兩軍先是炮戰(zhàn)，到初六日，鄭軍主動登岸偷襲清軍，但是被清都統(tǒng)王大用、游擊史定國部擊潰，清軍繳獲完整盔甲11副，噴火筒20余副，鄭軍退回高崎。

一直到十月十九日，楊富等鄭軍叛徒到齊，清荷聯(lián)軍才于金門外港一帶的海域向鄭軍水師發(fā)動進(jìn)攻。楊富、陳輝、鄭鳴俊這些叛徒也算是沒有辜負(fù)新主子的期望一下子就把自己的老同事黃廷打得落花流水“鄭鳴駿、陳輝、陳一 明等犁沉賊舟三，奪獲大舟二，斬首三百，生擒四十余，炮傷溺死無算。楊富炮擊偽總兵謝福船，折其桅，過船殺賊二百人，生擒十八人。閩安水師游擊鄭洪、中軍守備孔應(yīng)賢獲鳥船一，趕繒船二，水底熕二，殺賊八十余，余皆跳水死”僅僅楊富指揮的戰(zhàn)船就消滅鄭軍218人，鄭鳴俊、陳輝、陳一明三人總共擊沉鄭軍戰(zhàn)船三艘，俘獲兩艘，擊斃鄭軍300人，俘虜40人。

波特荷蘭艦隊于當(dāng)月二十日向鄭軍發(fā)動進(jìn)攻，荷艦的炮火打得鄭軍抬不起頭來，很快，鄭軍戰(zhàn)船便紛紛從金門周圍逃跑躲進(jìn)廈門港，周全斌的13艘戰(zhàn)船卻未能及時突圍。面對清軍和荷軍的圍攻，按理說周全斌是死定了，但接下來發(fā)生的一幕，真是令人瞠目結(jié)舌，周全斌的13艘戰(zhàn)船巧妙地繞開了荷蘭艦隊，直撲馬得功本陣，荷軍對這十幾艘戰(zhàn)船連連開炮，卻沒有一炮打中“往來奮擊，剽疾如馬”，馬得功部大約有200多艘帆船，這些帆船和周全斌的船隊一經(jīng)交鋒，便如同羊群見了狼一樣四散奔逃，有些戰(zhàn)船直接逃向荷軍陣中，把荷蘭人的大炮都給擋住了，馬得功本人也被跳幫的鄭軍擊殺，當(dāng)年荻港水戰(zhàn)，這個叛徒和田雄直接出賣了自己的主將黃得功和弘光皇帝，今天終于也被自己的部下賣掉了，本來應(yīng)該保護(hù)主帥的其他船只一接敵便四散逃跑，這也算是一種出賣吧。

關(guān)于馬大提督的陣亡，還有一個比較有趣的小細(xì)節(jié)，那就是在開戰(zhàn)之前，馬得功看上了鄭鳴俊的坐船，鄭鳴俊的座船十分高大，頗為拉風(fēng)，馬得功于是與鄭鳴俊調(diào)換。周全斌沖陣時，一邊擊沉擋路的清軍戰(zhàn)船，同時拼命尋找叛徒鄭鳴俊，因為鄭鳴俊畢竟在鄭軍之中呆了這么多年，他的座船很多人都認(rèn)識，所以很快就找到了，然后，明軍戰(zhàn)船上的士兵紛紛跳到那艘“頗為熟悉”的船上廝殺，但此時這艘船的主人已經(jīng)換成了馬得功“馬得功坐鳴駿中軍船，全斌誤以為鳴駿也，直前攻入。黃廷中軍將吳朝宰，鄭經(jīng)親軍將蕭乘龍前后夾攻，揮兵過船，得功親隨鐵甲精兵三百人皆被殺下水，得功頓足自投水而死”馬得功被干掉之后，又一個倒霉蛋靠了上來，楊富見馬得功的船被圍攻，于是命座船靠上去準(zhǔn)備營救，結(jié)果，全船士卒死得一個都不剩，楊富本人被扔進(jìn)了海里，被清軍小艇搭救，這才保全性命。

此戰(zhàn)之后，由于馬大提督死得太過于搞笑，清廷為了搞清馬得功陣亡的真相查了很久，馬得功部下有十幾名將領(lǐng)都被逮捕接受審問，這事兒折騰了好久。

但不管怎樣，海戰(zhàn)以鄭軍的敗北而告終，鄭軍退回廈門之后，耿繼茂把大營扎在潯尾嵩嶼，然后令王大用、徐成功、夏有功、徐文耀、王蟒、張元德、田養(yǎng)民、王梅、朱懷德、吳效忠、馬化麒、郭文可、史定國等人趁著夜色登陸廈門。李率泰令游擊謝四、黃梧副將吳淑、游擊戴亮、總兵蔡祿、郭義等人一同沖上廈門島，鄭軍不能抵擋。二十一日，清軍翻過中安山，居高臨下如同潮水一般地沖下來，施瑯、蔡祿、郭義、柯義、林祖等鄭軍叛徒移兵鼓浪嶼，領(lǐng)戰(zhàn)船50艘發(fā)炮轟擊中左所城，在多方夾擊之下，鄭軍在廈門已經(jīng)全線崩潰，鄭經(jīng)先退往金門，后又遭到楊富部清軍以及荷蘭艦隊的追擊，金門沒有守住，鄭經(jīng)只能帶領(lǐng)六七百艘戰(zhàn)船向東撤退，而黃廷、周全斌等人則退往其他未失守的沿海諸島，不久，二人也投降清朝。至此，明鄭軍堅守了十幾年的金廈落入清方之手。

上島的清軍以沒有來得及逃走的鄭軍敗兵躲藏在島上為名，四處燒殺掠搶，不少投誠兵其實可能在幾個月之前還是鄭軍，所以一些清軍實際上對金廈頗為熟悉，擄掠起來可真是如同蝗蟲一般，金廈二島數(shù)十萬生靈，多遭兵刃，被俘虜?shù)钠矫衲袐D幼童成群結(jié)隊，長索系頸，清軍驅(qū)之若驅(qū)犬羊一般，島上的墳?zāi)苟荚獾桨l(fā)掘，連已經(jīng)死了12年的大倒霉蛋鄭彩先生也被刨了出來，墳?zāi)贡粡氐灼茐摹岸墩\兵所至搜掠財物，發(fā)掘家墓，至剖建國公鄭彩之棺而殘其尸”《靖海志》

廈門失守標(biāo)志著明鄭勢力在福建的徹底崩潰，但南明的歷史并未結(jié)束，明鄭政權(quán)一直堅持到1683年，但是我認(rèn)為廈門之戰(zhàn)以及1664年的茅麓山之戰(zhàn)后，雖然在理論上南明政權(quán)依然存在，但1664年到1683年這20年可以被認(rèn)為是一個“后南明時代”因此時明朝皇帝已經(jīng)不存在了，但是，在弘光隆武永歷三朝活動的梟雄們，在這20年間依舊頗為活躍，比如上文所提到的楊富，此人在三藩之亂中準(zhǔn)備響應(yīng)吳三桂，但最終失敗被殺。

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