廣泛的耐藥性已經(jīng)成為全球衛(wèi)生保健的關(guān)鍵問題，其中腫瘤耐藥也一直是國自然熱門課題，所以一些整理耐藥信息的數(shù)據(jù)庫應(yīng)運而生···

目前已經(jīng)開發(fā)了一些耐藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫，但都是針對某些疾病類別，比如癌癥（如CancerDR和KinaseMD）、病毒感染（如Stanford HIV數(shù)據(jù)庫和HBVdb）、細菌感染（如CARD和MEGARes）以及真菌感染（如MARDy）。然而，出現(xiàn)耐藥性的疾病遠不止癌癥/感染，所以迫切需要建立一個涵蓋各種疾病類別和不同類型的機制的綜合性耐藥數(shù)據(jù)庫。

科研的終極目標就是應(yīng)用，浙大朱峰教授團隊在Nucleic Acids Research上發(fā)布了全球首個綜合耐藥性數(shù)據(jù)庫DRESIS。

p?數(shù)據(jù)庫概況

DRESIS作為全球首個綜合耐藥性數(shù)據(jù)庫，首次系統(tǒng)地提供了所有六種類型的耐藥分子機制，覆蓋了現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫中最廣泛的疾病，并描述了超過20000種藥物的臨床/實驗驗證的耐藥數(shù)據(jù)。

DRESIS數(shù)據(jù)庫包含6種耐藥分子機制：

i.?藥物治療靶點的異常(ADTT)

ii.?藥物攝取和藥物排出的不規(guī)則(IDUE)

iii.?結(jié)構(gòu)修飾導(dǎo)致的藥物失活(DISM)

iv.?DNA、RNA和蛋白質(zhì)的表觀遺傳改變(EADR)

v.?促生存途徑的異常激活(UAPP)

vi.?疾病微環(huán)境的調(diào)節(jié)(RTDM)

p?數(shù)據(jù)庫收錄信息

數(shù)據(jù)庫收錄了超過20 000種具有臨床/實驗驗證耐藥性信息的藥物（包括816個FDA批準的藥物、336種臨床前/臨床試驗藥物和19675種研究藥物），對應(yīng)395種耐藥疾病（其中有232種(58.7%)屬于癌癥或感染），以及2197個關(guān)鍵耐藥分子的分子機制，并分析了耐藥相關(guān)分子的疾病特異性和組織特異性。

p?數(shù)據(jù)庫檢索結(jié)果展示

1)?藥物的耐藥性信息的詳細描述

數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)地提供了每種藥物的耐藥性信息的詳細描述，以化療藥物“多柔比星”為例，主要信息包括：藥物名稱、藥物同義詞、疾病適應(yīng)癥(以及藥物的相應(yīng)臨床狀態(tài))、藥物結(jié)構(gòu)(可下載2D和3D格式)、藥物靶點，與其他分子生物學數(shù)據(jù)庫的外部鏈接（如PubChem），以及已報告對該藥物具有耐藥性的疾病列表。

3)?藥物耐藥機制信息

DRESIS中繪制了一個交互式圖表以展示藥物、疾病和機制之間的相互作用。藥物被放置在中間，并被各種類型的機制所包圍，各種疾病類別與每種機制類型相關(guān)聯(lián)，而每種機制類型又與關(guān)鍵的抗性分子相關(guān)聯(lián)。以“多柔比星”為例，交互圖顯示它有六種耐藥機制，在每個機制下顯示相應(yīng)的抗性疾病，并為相應(yīng)的疾病提供關(guān)鍵的抗性分子。

此外，數(shù)據(jù)庫也可以根據(jù)疾病類別分類的藥物的詳細耐藥機制，提供了關(guān)鍵耐藥分子、耐藥證據(jù)類型和實驗細節(jié)的數(shù)據(jù)。共鑒定出2197個關(guān)鍵耐藥分子，針對關(guān)鍵耐藥分子，描述了它們在耐藥疾病中的變化，以及不同類型的耐藥證據(jù)(臨床報告，由體內(nèi)模型驗證或由細胞系實驗確定)。還提供了各種實驗細節(jié)，包括多樣化的實驗技術(shù)、數(shù)百種疾病細胞系和感染性菌株、數(shù)百種體內(nèi)模型以及在耐藥疾病中被調(diào)節(jié)的各種信號通路。

3)?針對特定疾病的耐藥藥物的全景圖

數(shù)據(jù)庫提供針對特定疾病的藥物和關(guān)鍵耐藥分子的綜合列表。以“乳腺癌”為例，在縱軸上使用藥物id提供了耐藥藥物的完整列表，在橫軸上使用相應(yīng)的分子id顯示了關(guān)鍵耐藥分子列表。由于乳腺癌(以及許多其他疾病)中涉及大量藥物和關(guān)鍵分子，DRESIS通過拖動圖中所示交互圖底部和右側(cè)的滑塊，實現(xiàn)了整個全景的可視化圖。圖中用不同顏色的圓圈(中間有字母“R”)表示了不同類型的抗性機制，將鼠標放在任意一個圓圈上，可以交互查看機制類型、耐藥藥物和關(guān)鍵分子的詳細信息。

除了全景圖之外，詳細的耐藥機制也在DRESIS的疾病網(wǎng)頁中有明確的描述，包括關(guān)鍵分子的數(shù)據(jù)、耐藥性證據(jù)的類型和實驗細節(jié)，信息與第2步中一致。

4)?耐藥分子的疾病/組織特異性豐度

DRESIS提供了關(guān)鍵抗性分子的疾病和組織特異性表達豐度。基于TCGA和GTEx數(shù)據(jù)庫分析了疾病患者和健康個體之間這些關(guān)鍵抗性ncRNAs的豐度差異，以小提琴圖形式展示。基于GEO和GTEx數(shù)據(jù)庫分析不同組織之間關(guān)鍵抗性分子的組織特異性豐度變化，以柱狀圖形式展示。

p?數(shù)據(jù)下載

用戶可以從數(shù)據(jù)庫“Download”頁面免費下載數(shù)據(jù)庫完整數(shù)據(jù)。

參考文獻

Sun X, Zhang Y, Li H, et al. DRESIS: the first comprehensive landscape of drug resistance information. Nucleic Acids Res. 2023;51(D1):D1263-D1275. doi:10.1093/nar/gkac812

小云之聲

本次數(shù)據(jù)庫的介紹就分享到這里了，關(guān)注耐藥方向的小伙伴可以嘗試使用下數(shù)據(jù)庫哦！

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