在玩家打敗彼方，并從小田卷博士處獲得HM03沖浪術(shù)之后，玩家就可以用沖浪穿過之前只能坐船通過的105、106、107、108、109號道路，并且和里面的訓(xùn)練師對戰(zhàn)，在105號道路，玩家可以找到第二處沒有洞口的遺跡。此外廢棄船的設(shè)置也沒有太大變化。

一路回到紫堇市之后，會看到小霞霞在寶可夢中心的門口，和她對話之后，她會告訴玩家新紫堇的機械設(shè)備運轉(zhuǎn)過熱，自己害怕出風(fēng)險，在一番撒嬌之后，小霞霞會把新紫堇的鑰匙送給玩家，希望玩家?guī)兔﹃P(guān)掉新紫堇的機械設(shè)備。隨后玩家就可以通過沖浪找到新紫堇的入口并進入關(guān)閉新紫堇最深處的機械設(shè)備，在那里玩家可以得到雷電石。當玩家成功返回后，小霞霞會送給玩家十萬伏特的技能機器。

完成新紫堇事件之后，玩家就可以繼續(xù)向茵郁市進發(fā)了。在118號道路越過一片水域之后，玩家會再次遇到栞子，栞子會告訴玩家她的進步有目共睹，并祝愿玩家接下來旅途順利，然后就會立刻離開。同樣在118號道路，和一位釣魚者對話，他會把好釣竿送給玩家。118號道路右側(cè)樹果大師的家沒有太大變化。

繼續(xù)向上，到達天氣研究所的位置，發(fā)現(xiàn)繼續(xù)前進的路被黑洞團的小兵擋住了，進入天氣研究所并和黑洞團的小兵對戰(zhàn)，當?shù)竭_二層之后，玩家會發(fā)現(xiàn)小豪正在管天氣研究所的研究員們強行索要漂浮泡泡，這時和小豪對話，他會告訴玩家自己已經(jīng)去過多個平行宇宙，已經(jīng)向自己的野心大大的靠近了，只要最后奪得送神火山的某個道具，自己的野心就可以最終實現(xiàn)了，接著就會觸發(fā)對戰(zhàn)。小豪此時會使用：LV30陀螺皮（雌性）【注1】、LV30豪力丘（雄性）【注2】和LV30泥偶巨人。在戰(zhàn)勝小豪后，黑洞團的中層干部——達克多會出現(xiàn)，通知小豪，嵐珠已經(jīng)帶著白洞團搶先抵達了送神火山，接著小豪會再次警告玩家任何人都無法阻止他的野心，然后就帶著黑洞團的人離開了。隨后天氣研究所的博士就會把漂浮泡泡送給玩家。

從天氣研究所出來，越過吊橋之后，通過沖浪穿過里面的河流，可以在某個岸邊拿到草之石?；氐桨哆呄蛏献?，玩家會再次遇見步夢。步夢此時會使用：LV29奇魯莉安（雌性）、LV30電龍（雌性）、LV30波克基古（雄性）以及LV32相克寵。在打敗步夢之后，她會把HM02飛空術(shù)技能機器送給玩家。在步夢離開之后，熏子會突然出現(xiàn)，并祝愿玩家成功，然后離開。

到達茵郁市，這時前往道館，會發(fā)現(xiàn)道館被看不見的不明物體擋住了去路。繼續(xù)向右走可以在吊橋處再一次遇到栞子，栞子會告訴玩家這附近有許多喜歡惡作劇的變隱龍，并且把三船公司的觀察鏡送給玩家。這時調(diào)查吊橋上的攔路物體，就會發(fā)現(xiàn)果然是一只變隱龍，這時可以選擇打敗它或是收服它。此后栞子會向玩家表達自己對青梅竹馬——嵐珠的擔心，擔心無止境追求力量的野心會破壞這個世界的平衡，隨后離開。

栞子離開之后，玩家就可以返回到茵郁市。在調(diào)查了道館前面的攔路物體之后，果然是一只變隱龍，隨后這只變隱龍會逃走，接下來就可以進入茵郁道館挑戰(zhàn)了。館主艾瑪維爾德，使用草系寶可夢，包括：LV31風(fēng)妖精（雌性）、LV32坐騎山羊（雄性）、LV33羅絲雷朵（雌性）、LV33芽吹鹿（雌性）和LV35妙蛙花（雄性，MEGA進化）。打敗艾瑪之后，玩家就可以獲得第六枚徽章。當玩家走出道館之后，會收到熏子的電話，熏子對玩家打敗第六道館著實感到了震驚，不過熏子也已經(jīng)感受到了玩家就是她一直尋找的強大訓(xùn)練師，之后熏子就會掛掉電話。。。

注1：陀螺皮的形象來源于早期寶可夢游戲廢案當中的一只融合了皮寶寶、柯波郎和皮皮玩偶外形特征的寶可夢，形象如下：

注2：豪力丘是日本人制作的改版游戲《寶可夢星座系列》（牛郎星、織女星、天狼星、南河三、天津四）中登場的一只惡搞寶可夢，為皮卡丘通過親密值進化而成的進化型，長著皮卡丘的腦袋和豪力的身體。