腫瘤相關生信現(xiàn)在競爭這么激烈，該怎么拿高分呢？

看看生信文章分布，基本就是預后（占比最高）、分型、轉移和耐藥，突破點又在哪里？

最顯而易見的方法就是探索其他方向，比如“復發(fā)”

小云這次就發(fā)現(xiàn)了一個超厲害的方向，可以用最簡單的分析套路去發(fā)高分文章，它就是——生化復發(fā)（Biochemical recurrence，BCR）。目前BCR屬于一個待發(fā)掘方向，生信文章還不多，競爭壓力比較小，特別適合想做腫瘤方向生信的朋友哦。

下面就一起看看BCR相關生信如何只用2張圖搞定8分+的文章的吧！性價比超高的方向，看到就是賺到哦！

發(fā)表時間：2022年2月

發(fā)表雜志：Front. Immunol.

影響因子：IF=8.786

文章題目：能量代謝相關基因預后指數(shù)預測接受根治性前列腺切除術的前列腺癌患者生化復發(fā)

研究背景

根治性前列腺切除術(RP)是治療局限性前列腺癌的首選，然而近50%的患者在手術后遇到生化復發(fā)(BCR)。BCR的發(fā)生是基于多種系統(tǒng)途徑的改變。在腫瘤轉化過程中，前列腺細胞進行代謝重編程，以滿足生長和增殖的需要。充足的能量代謝對腫瘤細胞的生存至關重要，因此我們需要構建一個能量代謝相關基因預后指數(shù)來預測接受RP的PCa患者的BCR。

數(shù)據(jù)來源

研究流程及主要結果

首先基于TCGA-PCa隊列數(shù)據(jù)進行差異基因分析，以及通過加權基因共表達網絡分析(WGCNA)識別腫瘤相關基因。隨后，通過腫瘤相關基因、DEGs和能量代謝相關基因的交集來確定候選基因。使用Lasso和COX回歸分析找出與無BCR生存率相關的獨立風險基因，然后建立能量代謝相關基因預后指數(shù)(EMRGPI)。隨后進行KM生存分析，并利用ROC曲線評估EMRGPI對BCR的預測能力。評估EMRGPI與TME的相關性，并根據(jù)EMRGPI中位數(shù)將患者分為高低風險組進行GSEA分析。

文章小結

看完思路有沒有覺得8分+的文章也能如此簡單？關鍵還是在于分析方向的選擇，本文是以“生化復發(fā)”作為研究對象，區(qū)別常規(guī)的預后、轉移或耐藥等分析，創(chuàng)新性比較高。另外構建了“能量代謝相關風險指數(shù)”，與“生化復發(fā)”這一創(chuàng)新點強強聯(lián)合，用最簡單常規(guī)的分析內容，輕松拿下8分+文章！

小云悄悄告訴你：“生化復發(fā)”方向的生信目前主要集中發(fā)表于前列腺癌，思路都非常簡單，并且除了PCa，生化復發(fā)還可以做多個癌種（比如婦科腫瘤、骨肉瘤等），也就是說只要公共數(shù)據(jù)中有BCR信息，換個癌種就可以輕松復現(xiàn)啦！