使用 Ingenuity Pathway analysis 程序（IPA； https:?//analysis.ingenuity.com）進一步分析?**差異表達基因（DEGs）影響的生化途徑。

IPA 的核心組件是 Ingenuity Pathways Knowledge Base (IPKB)，其中包含一個精選基因集和 330 多個生化通路的生物學功能、相互作用和其他相關信息。這種基于通路的軟件旨在從給定的基因列表中識別全局規(guī)范通路、動態(tài)生成的生物網(wǎng)絡和全局功能。

基本上，將帶有符號或相應的 GenBank 登錄號或兩者的基因上傳到 IPA 中，并使用 IPKB 的整個基因集作為背景與每個規(guī)范途徑中包含的基因進行比較。提取了具有與候選基因重疊的一個或多個基因的所有途徑。在 IPA 中，這些途徑中的每一個都被分配了一個p通過 Fisher 精確檢驗得出的值，表示通路和輸入基因之間重疊的概率。

翻譯于PMID: 23874651