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中國(guó)科技企業(yè)首次 | 百度以第一完成單位登頂《Nature》正刊!

2023-05-10 20:19 作者:薈呀薈學(xué)習(xí)  | 我要投稿

百度,以第一完成單位的身份在《Nature》雜志發(fā)表論文了!



國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊《Nature》正刊發(fā)表了百度與合作單位在生物計(jì)算領(lǐng)域的重磅突破性成果——《Algorithm for Optimized mRNA Design Improves Stability and Immunogenicity》,提出mRNA序列優(yōu)化算法LinearDesign。


據(jù)介紹,mRNA 疫苗被公認(rèn)為是遏制 COVID-19 的可行工具,但 mRNA 疫苗和藥物仍面臨一些挑戰(zhàn)。其中如何高效設(shè)計(jì)出穩(wěn)定、成藥性更好的 mRNA 序列,是 mRNA 療法研究領(lǐng)域的難點(diǎn)之一。百度運(yùn)用自然語(yǔ)言處理中網(wǎng)格解析(Lattice Parsing)技術(shù),對(duì) mRNA 疫苗序列進(jìn)行優(yōu)化,提升疫苗穩(wěn)定性和有效性。LinearDesign 算法將序列設(shè)計(jì)的海量計(jì)算簡(jiǎn)化為自然語(yǔ)言處理中的經(jīng)典問(wèn)題,能在短短 11 分鐘之內(nèi)找到最穩(wěn)定的候選序列,LinearDesign 算法設(shè)計(jì)序列將有助于生物醫(yī)藥公司快速研發(fā)更有效的 mRNA 疫苗,縮短研發(fā)周期,降低研發(fā)成本。



注:
這是中國(guó)科技企業(yè)首次以第一完成單位的身份在《Nature》雜志發(fā)表論文。鑒于論文對(duì)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的重要性,Nature雜志在正式排版之前先將預(yù)覽版快車(chē)道上線?(accelerated article preview),這也是AI應(yīng)用于mRNA領(lǐng)域的首篇CNS主刊論文。


mRNA疫苗被公認(rèn)為是遏制COVID-19的可行工具,但mRNA疫苗和藥物仍面臨一些挑戰(zhàn)。其中如何高效設(shè)計(jì)出穩(wěn)定、成藥性更好的mRNA序列,是mRNA療法研究領(lǐng)域的難點(diǎn)之一。


百度運(yùn)用自然語(yǔ)言處理中網(wǎng)格解析(Lattice Parsing)技術(shù),對(duì)mRNA疫苗序列進(jìn)行優(yōu)化,提升疫苗穩(wěn)定性和有效性。LinearDesign算法巧妙地將序列設(shè)計(jì)的海量計(jì)算簡(jiǎn)化為自然語(yǔ)言處理中的經(jīng)典問(wèn)題,讓“大海撈針”變成了“按圖索驥”。

④ 以新冠病毒Spike蛋白為例,若采用遍歷法尋找一條穩(wěn)定序列,需要查看10的632次方個(gè)mRNA序列。假如由一臺(tái)超級(jí)計(jì)算機(jī)每秒計(jì)算一個(gè)序列,那么從宇宙誕生到現(xiàn)在的138億年,連潛在mRNA序列的億萬(wàn)分之一都無(wú)法計(jì)算完畢,而LinearDesign算法則能在短短11分鐘之內(nèi)找到最穩(wěn)定的候選序列


實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)證明,LinearDesign算法設(shè)計(jì)序列將有助于生物醫(yī)藥公司快速研發(fā)更有效的mRNA疫苗,縮短研發(fā)周期,降低研發(fā)成本。這一算法的有效性已經(jīng)在新冠mRNA疫苗和帶狀皰疹mRNA疫苗兩種疫苗中得到驗(yàn)證。與傳統(tǒng)基準(zhǔn)相比,百度的設(shè)計(jì)顯著改善了體外mRNA半衰期和蛋白質(zhì)表達(dá),使體內(nèi)抗體反應(yīng)增強(qiáng)了高達(dá)128倍。


截至目前,百度已打造完整的基于飛槳的生物計(jì)算平臺(tái)-螺旋槳PaddleHelix,涵蓋文心大模型-生物計(jì)算大模型,探索AI技術(shù)在小分子、蛋白/多肽、RNA等場(chǎng)景的應(yīng)用。其中生物計(jì)算等大模型屬于百度文心大模型家族中的一員。


百度文心大模型形成了系統(tǒng)性的大模型技術(shù)體系,包括自然語(yǔ)言處理、視覺(jué)、跨模態(tài)、生物計(jì)算等,最近火爆的文心一言就是百度自主研發(fā)的知識(shí)增強(qiáng)大語(yǔ)言模型。文心一言通過(guò)百度智能云對(duì)外提供服務(wù),為企業(yè)構(gòu)建自己的模型和應(yīng)用,未來(lái)醫(yī)療、工業(yè)、金融等重點(diǎn)領(lǐng)域效率將會(huì)大幅提升,快速形成新產(chǎn)業(yè)空間。

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