數(shù)據(jù)的完整性和準(zhǔn)確性是后續(xù)獲得具有統(tǒng)計(jì)學(xué)和生物學(xué)意義的分析結(jié)果的必要條件。在確保實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的合理性和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性的基礎(chǔ)上，百泰派克首先對數(shù)據(jù)的完整性進(jìn)行檢查，對缺失值進(jìn)行刪除或者補(bǔ)充，刪除極值，并對數(shù)據(jù)進(jìn)行樣本間和代謝物間的歸一化處理，以確保各樣本之間和代謝物之間可平行比較。原始數(shù)據(jù)中，缺失值超過50%的代謝物將被去除，不參與后續(xù)分析；對代謝物的表達(dá)量進(jìn)行對數(shù)轉(zhuǎn)換并利用Autoscaling方法（Mean-centered and divided by the standard deviation of each variable）進(jìn)行歸一化處理。下圖顯示了正離子模式數(shù)據(jù)經(jīng)歸一化處理前后的分布情況，結(jié)果表明數(shù)據(jù)經(jīng)歸一化處理后基本呈正態(tài)分布。