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文獻(xiàn)分享# 新冠病毒的兩種亞型

2020-03-26 14:27 作者:分子科普小feng子  | 我要投稿


原文鏈接:

https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaa036/5775463?searchresult=1

文獻(xiàn)分享

新冠病毒的兩種亞型

3月3號(hào),中國(guó)科學(xué)院主辦的《國(guó)家科學(xué)評(píng)論》(National Science Review)發(fā)表題為《關(guān)于SARS-CoV-2的起源和持續(xù)進(jìn)化》的論文。文中對(duì)103個(gè)SARS-CoV-2基因組進(jìn)行的群體遺傳學(xué)分析表明,這些病毒演變成兩種主要類(lèi)型(命名為L(zhǎng)和S);L型(?70%)更為普遍,但S型(?30%)更古老。

文中提出盡管L型是從古代S型新進(jìn)化而來(lái)的,但它在人類(lèi)群體中的傳播或復(fù)制速度更快,L可能比S類(lèi)型更具攻擊性和侵略性。但目前尚不清楚在SARS-CoV-2的發(fā)展過(guò)程中L型是如何從S型特別進(jìn)化的。

根據(jù)研究分析的103個(gè)新冠病毒基因組數(shù)據(jù)表明,這些病毒株一共存在149個(gè)突變位點(diǎn),且多數(shù)突變?cè)诮诎l(fā)生。具體而言,兩個(gè)亞型的區(qū)別在于病毒RNA基因組的第28144位點(diǎn),L型是T堿基(對(duì)應(yīng)亮氨酸,Leu),S型是C堿基(對(duì)應(yīng)絲氨酸,Ser)。通過(guò)與其他冠狀病毒比較,作者發(fā)現(xiàn)S型新冠病毒與蝙蝠來(lái)源的冠狀病毒在進(jìn)化樹(shù)上更接近,從而得出S型相對(duì)更古老的結(jié)論。

圖注:103個(gè)SARS-CoV-2基因組的無(wú)根系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)


圖注:SARS-CoV-2病毒的單倍型分析


作者在文章中表示,后續(xù)工作需要擴(kuò)大樣本量,以驗(yàn)證這些結(jié)論或推測(cè)。

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