一、加載R包

1. 安裝R包[1]

2. 加載R包：

二、 準備數(shù)據(jù)

a. 染色體信息數(shù)據(jù)見圖1，第一列數(shù)據(jù)為染色體名稱，第二列為染色體開始位置，第三列為染色體結(jié)束為止，第三列為染色體填充顏色，第五列為物種名稱，第六列是物種名稱在圖片中顯示的大小，第七列是物種名稱的顏色，支持RGB和十六進制的顏色。

b.共線性數(shù)據(jù)，具體格式見圖 2，第一列為圖一中物種排名第一的數(shù)據(jù)如此處為Grape，且第一列為染色體ID，跟隨其后的兩行為所在染色體為止的信息，第二個物種就是圖一中排序在后的物種的染色體ID，跟隨兩行為染色體位置信息，最后一列為填充的顏色，根據(jù)你感興趣的基因，設置彩色，并將其排序到最后以方便在圖片中顯示。

三、運行R包

ideogram包中karyotype為染色體信息數(shù)據(jù)，synteny為共線性數(shù)據(jù)，output為svg圖片輸出路徑，結(jié)果如圖 3。

[1] Hao Z, Lv D, Ge Y, et al. RIdeogram: drawing SVG graphics to visualize and map genome-wide data on the idiograms[J]. PeerJ Computer Science, 2020, 6: e251.