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熱點(diǎn)思路梳理-細(xì)胞焦亡

2022-02-21 14:45 作者:爾云間  | 我要投稿

大家好呀!今天跟大家從已發(fā)表的焦亡文章,梳理下如何細(xì)胞焦亡如何發(fā)文章。

細(xì)胞焦亡(pyroptosis)是由炎性小體引發(fā)的一種細(xì)胞程序性死亡,表現(xiàn)為細(xì)胞不斷脹大直至細(xì)胞膜破裂,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)容物釋放進(jìn)而引起強(qiáng)烈的炎癥反應(yīng)。細(xì)胞焦亡的發(fā)生依賴于炎性半胱天冬酶(caspase)和GSDMs蛋白家族,越來越多的證據(jù)證實(shí)了細(xì)胞焦亡在腫瘤中的重要作用,關(guān)于細(xì)胞焦亡與腫瘤關(guān)系的結(jié)論并不完全一致,這表明腫瘤的異質(zhì)性和免疫微環(huán)境的復(fù)雜性。細(xì)胞焦亡不僅可以抑制腫瘤細(xì)胞增殖,還可以形成適合腫瘤細(xì)胞生長的微環(huán)境,促進(jìn)腫瘤生長。

第一篇 Cell Death Discovery(IF:5.241)

細(xì)胞焦亡分子亞型識別+預(yù)后模型構(gòu)建+功能富集

第一篇文章(A novel defined pyroptosis-related gene signature for predicting the prognosis of ovarian cancer[J]. Cell Death Discovery)作者在卵巢癌中對細(xì)胞焦亡基因進(jìn)行刻畫,分析了表達(dá)水平的差異,基于細(xì)胞焦亡基因的識別分子亞型,構(gòu)建與驗(yàn)證預(yù)后模型,識別差異基因與功能分析,刻畫免疫活性。

細(xì)胞焦亡分子亞型識別
預(yù)后模型構(gòu)建
功能富集

第二篇 Cell Death DiscoveryIF:5.241

細(xì)胞焦亡預(yù)后模型構(gòu)建+TME+ceRNA網(wǎng)絡(luò)

關(guān)于這篇肺腺癌的文章(Identification of the pyroptosis related prognostic gene signature and the associated regulation axis in lung adenocarcinoma)作者對細(xì)胞焦亡基因的表達(dá)水平、遺傳改變和功能進(jìn)行刻畫,基于細(xì)胞焦亡基因構(gòu)建預(yù)后模型,分析了TME、TMB、MSI和藥物敏感性,最后基于重要臨床特征構(gòu)建了ceRNA網(wǎng)絡(luò)。

細(xì)胞焦亡預(yù)后模型構(gòu)建+TME+ceRNA網(wǎng)絡(luò)
細(xì)胞焦亡預(yù)后模型構(gòu)建+TME+ceRNA網(wǎng)絡(luò)

第三篇Frontiers in Cell and Developmental Biology(IF6.684)

細(xì)胞焦亡分子亞型識別+TME+免疫治療

第三篇細(xì)胞焦亡文章(The Pyroptosis-Related Signature Predicts Prognosis and Indicates Immune Microenvironment Infiltration in Gastric Cancer,Front. Cell Dev. Biol.)作者收集了醫(yī)院臨床樣本,并且訓(xùn)練數(shù)據(jù)量很大,內(nèi)容也非常豐富,刻畫得很細(xì)致。在胃癌中,作者分析了細(xì)胞焦亡基因的表達(dá)水平和遺傳改變,并且基于臨床樣本進(jìn)行驗(yàn)證,識別了分子亞型并對亞型進(jìn)行TME和臨床特征的分析,構(gòu)建風(fēng)險模型并進(jìn)行驗(yàn)證和TME與免疫治療的刻畫。

第四篇 OncoImmunology(IF:8)

細(xì)胞焦亡分子分型+TME+突變landscape+免疫治療

關(guān)于這篇結(jié)直腸癌的文章(Identification of pyroptosis-related subtypes, the development of a prognosis model, and characterization of tumor microenvironment infiltration in colorectal cancer),發(fā)的比較高,8+的雜志,作者對細(xì)胞焦亡基因的表達(dá)水平、遺傳改變和功能進(jìn)行刻畫,然后分子分型,基于細(xì)胞焦亡基因構(gòu)建預(yù)后模型,分析了TME、TMB、MSI和藥物敏感性。

細(xì)胞焦亡分子分型+TME+突變landscape+免疫治療

感興趣的小伙伴們可以仔細(xì)研讀細(xì)細(xì)體會下,純生信思路,蹭熱點(diǎn)就趁現(xiàn)在。


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