病毒(細(xì)胞)RNA的提取
一、實(shí)驗(yàn)材料
微量移液器(1mL、200μL),DEPC水處理過(guò)的槍頭/EP管,Trizol試劑,氯仿,異丙醇,75%乙醇(用DEPC水配制)
二、實(shí)驗(yàn)原理
在哺乳動(dòng)物中,平均每個(gè)細(xì)胞內(nèi)大約含有10-15μg RNA,其中rRNA占總量的80%-85%,tRNA和核內(nèi)小分子RNA占10-15%,而mRNA只占1-5%。Trizol試劑適用于從細(xì)胞和組織中快速分離RNA。Trizol的主要成分是異硫氰酸胍和酚。異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類強(qiáng)力的蛋白質(zhì)變性劑,可溶解蛋白質(zhì)主要作用是裂解細(xì)胞,使細(xì)胞中的蛋白,核酸物質(zhì)解聚得到釋放。酚雖可有效的變性蛋白質(zhì),但是它不能完全抑制RNA酶活性,因此Trizol中還加入了β-羥基喹啉、β-巰基乙醇等來(lái)抑制內(nèi)源和外源RNase。在加入氯仿離心后,溶液分為水相和有機(jī)相,RNA選擇性地進(jìn)入無(wú)DNA和蛋白質(zhì)的水相中。取出水相用異丙醇沉淀可回收RNA;用乙醇沉淀中間層可回收DNA;用異丙醇沉淀有機(jī)相可回收蛋白質(zhì)。
三、實(shí)驗(yàn)方法
1.?直接在培養(yǎng)板中加入Trizol裂解細(xì)胞,24孔板每孔加1?ml,用移液器吸打幾次。
2.?1ml Trizol加入0.2ml氯仿,劇烈振蕩15s,冰浴10 min。(注意:此步振蕩非常重要,建議在旋渦振蕩器上進(jìn)行,使其充分混勻。)
3.?4℃ 12000?rpm離心5 min。樣品分為三層:底層為藍(lán)色有機(jī)相,上層為無(wú)色水相和一個(gè)中間層。RNA主要在水相中,水相體積約為所用Trizol試劑的60%。
4.?把400-600?μl水相轉(zhuǎn)移到新的EP管中,加入等體積的異丙醇,混勻,室溫放置10?min。(異丙醇作用為沉淀RNA)。該步驟中的10?min可以縮短為5?min(貼壁細(xì)胞可以換成5?min,原代細(xì)胞10?min)。
5.?4℃ 12000?rpm離心10?min,棄上清。(離心前看不出RNA沉淀,離心后在管側(cè)和管底出現(xiàn)膠狀沉淀)(注意:該步驟很關(guān)鍵,一定要棄干凈。棄掉一次之后再甩一下用將管壁的殘留離心下來(lái),用白槍頭吸盡殘存的液體)
6.?加入1mL 75%乙醇洗滌RNA沉淀。4℃ 7600?rpm離心5 min,用槍頭吸盡殘存的乙醇。(該步驟用100%乙醇洗滌和75%乙醇洗滌差別不大,配置75%乙醇比較浪費(fèi)DEPC水)
7.?打開(kāi)離心管管蓋,室溫放置干燥,使殘存的痕量乙醇揮發(fā)殆盡,直至白色沉淀看不見(jiàn)為止即可。
8.?加20~50μl DEPC水溶解。
四、注意事項(xiàng)