生物化學(xué)名詞解釋 第二章
1,構(gòu)形(configuration):有機分子中各個原子特有的固定的空間排列。這種排
列不經(jīng)過共價鍵的斷裂和重新形成是不會改變的。構(gòu)形的改變往往使分子的光
學(xué)活性發(fā)生變化。
2,構(gòu)象(conformation):指一個分子中,不改變共價鍵結(jié)構(gòu),僅單鍵周圍的原
子放置所產(chǎn)生的空間排布。一種構(gòu)象改變?yōu)榱硪环N構(gòu)象時,不要求共價鍵的斷
裂和重新形成。構(gòu)象改變不會改變分子的光學(xué)活性。
3,肽單位(peptide unit):又稱為肽基(peptide group),是肽鍵主鏈上的重
復(fù)結(jié)構(gòu)。是由參于肽鏈形成的氮原子,碳原子和它們的 4 個取代成分:羰基氧
原子,酰氨氫原子和兩個相鄰α-碳原子組成的一個平面單位。
4,蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)(protein 在蛋白質(zhì)分子中的局布區(qū)域內(nèi)氨基酸殘基的有規(guī)
則的排列。常見的有二級結(jié)構(gòu)有α-螺旋和β-折疊。二級結(jié)構(gòu)是通過骨架上的羰
基和酰胺基團之間形成的氫鍵維持的。
5,蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)(protein tertiary structure): 蛋白質(zhì)分子處于它的天然折
疊狀態(tài)的三維構(gòu)象。三級結(jié)構(gòu)是在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上進一步盤繞,折疊形成
的。三級結(jié)構(gòu)主要是靠氨基酸側(cè)鏈之間的疏水相互作用,氫鍵,范德華力和鹽
鍵維持的。
6,蛋白質(zhì)四級結(jié)構(gòu)(protein quaternary structure):多亞基蛋白質(zhì)的三維結(jié)
構(gòu)。實際上是具有三級結(jié)構(gòu)多肽(亞基)以適當(dāng)方式聚合所呈現(xiàn)的三維結(jié)構(gòu)。
7,α-螺旋(α-heliv):蛋白質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤
繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。每個氨基酸
殘基(第 n 個)的羰基與多肽鏈 C 端方向的第 4 個殘基(第 4+n 個)的酰胺氮
形成氫鍵。在古典的右手α-螺旋結(jié)構(gòu)中,螺距為 0.54nm,每一圈含有 3.6 個氨
基酸殘基,每個殘基沿著螺旋的長軸上升 0.15nm. 8, β-折疊(β-sheet): 蛋白
質(zhì)中常見的二級結(jié)構(gòu),是由伸展的多肽鏈組成的。折疊片的構(gòu)象是通過一個肽鍵
的羰基氧和位于同一個肽鏈的另一個酰氨氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎
都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(由 N 到 C 方向)或者是反平行
排列(肽鏈反向排列)。
9,β-轉(zhuǎn)角(β-turn):也是多肽鏈中常見的二級結(jié)構(gòu),是連接蛋白質(zhì)分子中的二
級結(jié)構(gòu)(α-螺旋和β-折疊),使肽鏈走向改變的一種非重復(fù)多肽區(qū),一般含有 2~
16 個氨基酸殘基。含有 5 個以上的氨基酸殘基的轉(zhuǎn)角又常稱為環(huán)(loop)。常
見的轉(zhuǎn)角含有 4 個氨基酸殘基有兩種類型:轉(zhuǎn)角 I 的特點是:第一個氨基酸殘
基羰基氧與第四個殘基的酰氨氮之間形成氫鍵;轉(zhuǎn)角Ⅱ的第三個殘基往往是甘
氨酸。這兩種轉(zhuǎn)角中的第二個殘侉大都是脯氨酸。
10,超二級結(jié)構(gòu)(super-secondary structure):也稱為基元(motif).在蛋白質(zhì)
中,特別是球蛋白中,經(jīng)??梢钥吹接扇舾上噜彽亩壗Y(jié)構(gòu)單元組合在一起,
彼此相互作用,形成有規(guī)則的,在空間上能辨認(rèn)的二級結(jié)構(gòu)組合體。
11,結(jié)構(gòu)域(domain):在蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)內(nèi)的獨立折疊單元。結(jié)構(gòu)域通常
都是幾個超二級結(jié)構(gòu)單元的組合。
12,纖維蛋白(fibrous protein):一類主要的不溶于水的蛋白質(zhì),通常都含有
呈現(xiàn)相同二級結(jié)構(gòu)的多肽鏈許多纖維蛋白結(jié)合緊密,并為 單個細(xì)胞或整個生物
體提供機械強度,起著保護或結(jié)構(gòu)上的作用。
13,球蛋白(globular protein):緊湊的,近似球形的,含有折疊緊密的多肽鏈的
一類蛋白質(zhì),許多都溶于水。典形的球蛋白含有能特異的識別其它化合物的凹
陷或裂隙部位。
14,角蛋白(keratin):由處于α-螺旋或β-折疊構(gòu)象的平行的多肽鏈組成不溶于水
的起著保護或結(jié)構(gòu)作用蛋白質(zhì)。
15,膠原(蛋白)(collagen):是動物結(jié)締組織最豐富的一種蛋白質(zhì),它是由原
膠原蛋白分子組成。原膠原蛋白是一種具有右手超螺旋結(jié)構(gòu)的蛋白。每個原膠
原分子都是由 3 條特殊的左手螺旋(螺距 0.95nm,每一圈含有 3.3 個殘基)的
多肽鏈右手旋轉(zhuǎn)形成的。
16,疏水相互作用(hydrophobic interaction):非極性分子之間的一種弱的非共
價的相互作用。這些非極性的分子在水相環(huán)境中具有避開水而相互聚集的傾向。
17,伴娘蛋白(chaperone):與一種新合成的多肽鏈形成復(fù)合物并協(xié)助它正確
折疊成具有生物功能構(gòu)向的蛋白質(zhì)。伴娘蛋白可以防止不正確折疊中間體的形
成和沒有組裝的蛋白亞基的不正確聚集,協(xié)助多肽鏈跨膜轉(zhuǎn)運以及大的多亞基
蛋白質(zhì)的組裝和解體。
18,二硫鍵(disulfide bond):通過兩個(半胱氨酸)巰基的氧化形成的共價
鍵。二硫鍵在穩(wěn)定某些蛋白的三維結(jié)構(gòu)上起著重要的作用。
19,范德華力(van der Waals force):中性原子之間通過瞬間靜電相互作用產(chǎn)
生的一弱的分子之間的力。當(dāng)兩個原子之間的距離為它們范德華力半徑之和
時,范德華力最強。強的范德華力的排斥作用可防止原子相互靠近。
20,蛋白質(zhì)變性(denaturation):生物大分子的天然構(gòu)象遭到破壞導(dǎo)致其生物
活性喪失的現(xiàn)象。蛋白質(zhì)在受到光照,熱,有機溶濟以及一些變性濟的作用
時,次級鍵受到破壞,導(dǎo)致天然構(gòu)象的破壞,使蛋白質(zhì)的生物活性喪失。
21,肌紅蛋白(myoglobin):是由一條肽鏈和一個血紅素輔基組成的結(jié)合蛋
白,是肌肉內(nèi)儲存氧的蛋白質(zhì),它的氧飽和曲線為雙曲線型。
22,復(fù)性(renaturation):在一定的條件下,變性的生物大分子恢復(fù)成具有生
物活性的天然構(gòu)象的現(xiàn)象。
23,波爾效應(yīng)(Bohr effect):CO2 濃度的增加降低細(xì)胞內(nèi)的 pH,引起紅細(xì)胞
內(nèi)血紅蛋白氧親和力下降的現(xiàn)象。
24,血紅蛋白(hemoglobin): 是由含有血紅素輔基的 4 個亞基組成的結(jié)合蛋
白。血紅蛋白負(fù)責(zé)將氧由肺運輸?shù)酵庵芙M織,它的氧飽和曲線為 S 型。
25,別構(gòu)效應(yīng)(allosteric effect):又稱為變構(gòu)效應(yīng),是寡聚蛋白與配基結(jié)合改變
蛋白質(zhì)的構(gòu)象,導(dǎo)致蛋白質(zhì)生物活性喪失的現(xiàn)象。
26,鐮刀型細(xì)胞貧血?。╯ickle-cell anemia): 血紅蛋白分子遺傳缺陷造成的
一種疾病,病人的大部分紅細(xì)胞呈鐮刀狀。其特點是病人的血紅蛋白β—亞基 N
端的第六個氨基酸殘缺是纈氨酸(vol),而不是下正常的谷氨酸殘基(Ghe)。