• 1.Update Description

• 2. Algorithm 算法程序

• 3. Genomics 基因組學(xué)

• 4. Transcriptomics 轉(zhuǎn)錄組學(xué)

• 5. Proteomics 蛋白質(zhì)組學(xué)

• 6. Metabolomics 代謝組學(xué)

• 7. Clinical 臨床醫(yī)學(xué)

• 8. MicroOrganism 微生物組

1.Update Description

BioSciTool v1.3.1
Website: https://bioscitools.github.io
Github: https://github.com/bioscitools/bioscitools.github.io

親愛的BioSciTools用戶:
BioSciTool再次美化和更新布局，完善菜單分類及層級(jí)，同時(shí)新增30款組學(xué)數(shù)據(jù)分析程序。主要包括:

①Algorithm 算法分類中的PairsCorrelation, BetweenStats, WithinStats, PercentBlock等；

②Genomics 基因組學(xué)分類中的HG19GeneExp, HG19GeneMarker, ChloroplastGenome, MitoGenome, MafTiTv, MafAAChange, MafSomaticInteraction等；

③Transcriptomics 轉(zhuǎn)錄組學(xué)分類中的ExpressionTrend, BubbleOrdinary；

④Proteomics 蛋白質(zhì)組學(xué)分類中的NetworkTree；

⑤Metabolomics 代謝組學(xué)分類中的PartialLeastSquares, ScorePLS, LoadingPLS, WeightPLS, OrthogonalPLS, ScoreOPLS, LoadingOPLS, WeightOPLS；

⑥Clinical 臨床醫(yī)學(xué)分類中的SensitivityROC, TimeROC, AnatoGram, BrainMap；

⑦MicroOrganism 微生物組分類中的TernaryDiagram, OTUTree。

以下將從程序界面美化、分析程序更新簡單展示敘述。

2. Algorithm 算法程序

2.1 PairsCorrelation
配對(duì)相關(guān)性分析及可視化

2.2 BetweenStats
組間比較統(tǒng)計(jì)及小提琴圖可視化

2.3 WithinStats
組內(nèi)比較統(tǒng)計(jì)及小提琴圖可視化

2.4 PercentBlock
矩形比例布局可視化

3. Genomics 基因組學(xué)

3.1 HG19GeneExp
基于人類基因組HG19的基因表達(dá)圈圖

3.2 HG19GeneMarker
基于人類基因組HG19的基因表達(dá)圈圖及關(guān)鍵基因位置標(biāo)記

3.3 ChloroplastGenome
植物葉綠體基因組圈圖可視化

3.4 MitoGenome
線粒體基因組圈圖可視化

3.5 MafTiTv
基因變異數(shù)據(jù)的單個(gè)堿基轉(zhuǎn)換和顛換

3.6 MafAAChange
基因變異數(shù)據(jù)中氨基酸變異

3.7 MafSomaticInteraction
基因變異數(shù)據(jù)中染色體間的交互

4. Transcriptomics 轉(zhuǎn)錄組學(xué)

4.1 ExpressionTrend
轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)趨勢(shì)圖譜

4.2 BubbleOrdinary
轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)氣泡圖

5. Proteomics 蛋白質(zhì)組學(xué)

5.1 NetworkTree
蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)圖

6. Metabolomics 代謝組學(xué)

6.1 PartialLeastSquares
基于偏最小二乘法對(duì)各樣本中所有代謝物分析

6.2 ScorePLS
基于偏最小二乘法代謝物得分圖

6.3 LoadingPLS
基于偏最小二乘法代謝物載荷圖

6.4 WeightPLS
基于偏最小二乘法代謝物權(quán)重圖

7. Clinical 臨床醫(yī)學(xué)

7.1 SensitivityROC
基于臨床生存分析的ROC及AUC曲線

7.2 TimeROC
多時(shí)間基于臨床生存分析的ROC及AUC曲線

7.3 BrainMap
腦圖數(shù)據(jù)可視化

8. MicroOrganism 微生物組

8.1 TernaryDiagram
微生物組學(xué)分析中三元圖

8.2 OTUTree
微生物組學(xué)中物種OTU進(jìn)化樹