• 1.Update Description

• 2.Update User Interface UI

• 3 New Applications

• 3.1 Seq Motif

• 3.2 BarStat

• 3.3 ScatterPlot

• 3.4 GroupLine

• 3.5 QQ (Quantile-Quantile)

• 3.6 DensityNormal

• 3.7 BoxStat

• 3.8 ViolinStat

• 3.9 PieStat

• 3.10 DonutStat

1.Update Description

BioSciTool v1.3.0
Website: https://bioscitools.github.io
Github: https://github.com/bioscitools/bioscitools.github.io

親愛的BioSciTools用戶:
此次更新從v1.2.5直接更新到v1.3.0，意味著BioSciTool再次美化和更新布局，同時此次大更新帶來用戶數(shù)據(jù)分析中使用頻率較高的10款數(shù)據(jù)分析及可視化應(yīng)用。主要包括Statistics分類中的BarStat, ScatterPlot, GroupLine, QuantileQ(QQ), DensityNormal, BoxStat, ViolinStat, PieStat, DountStat，以及Sequence分類中的Seq Motif程序。以下將從程序界面美化、分析程序更新簡單展示敘述。

注BioSciTools中的宗旨是編寫功能最健全的分析程序，每個程序都傾注著開發(fā)者的大量時間調(diào)研、斟酌，希望能成為用戶得心應(yīng)手的分析工具，每個程序的參數(shù)接口都值得去體驗和巧妙使用。

2.Update User Interface UI

更新BioSciToolsUI界面主要為了使得程序更加簡約、舒服、現(xiàn)代化，我也是在不斷探索中審視自己的審美觀，最終發(fā)現(xiàn)好的界面需要邏輯清晰、界面簡約舒適。

Home添加BioSciTools Introduction和Applications Stat

Home添加所有的程序卡片完善后美化，現(xiàn)在通過點擊對應(yīng)程序的卡片預(yù)覽可以直接打開程序開始分析。

為所有程序添加調(diào)節(jié)圖像寬度(Width)、高度(Height)和分辨率(DPI)的調(diào)節(jié)組件，每張圖像默認以黃金比例0.618:1導(dǎo)出。同時為大多數(shù)程序添加標題(Title)、X軸(xLabel)、Y軸(yLabel)的標題修改接口。

3 New Applications

3.1 Seq Motif

Sequence Motif圖可以直觀清晰的反應(yīng)序列偏好特征，每個位置出現(xiàn)的堿基或氨基酸類型反映了該位置序列的偏好性，每個字母的大小與該堿基在該位置上的出現(xiàn)頻率成正相關(guān)。這種表現(xiàn)方式對研究轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合、RNA修飾等有重要指導(dǎo)意義，時常被應(yīng)用到論文中。

3.2 BarStat

柱狀圖允許主題自定義、SCI配色選擇。柱狀圖/條形圖變換，柱狀圖不分組統(tǒng)計標準誤、標準差、箱型圖，柱狀圖分組可排列、堆疊、百分比等形式展示。

3.3 ScatterPlot

散點圖允許主題自定義、SCI配色選擇。不同分組以顏色區(qū)分、以散點形狀區(qū)分、同時以顏色與形狀區(qū)分。包含13種SCI配色，包含25種散點形狀。

3.4 GroupLine

分組線性圖，根據(jù)每組的散點以折線、曲線連接，即折線圖。提供主題選擇、顏色選擇，允許不同分組可以以顏色區(qū)分、散點形狀區(qū)分、同時以顏色與散點形狀區(qū)分。

3.5 QQ (Quantile-Quantile)

QQ Plot也就是Quantile-Quantile Plots，是通過比較兩個概率分布的分位數(shù)對這兩個概率分布進行比較的概率圖方法。如果兩個分布相似，則該Q-Q圖趨近于落在y=x線上。如果兩分布線性相關(guān)，則點在Q-Q圖上趨近于落在一條直線上，但不一定在y=x線上。

3.6 DensityNormal

根據(jù)數(shù)據(jù)分布密度可視化并添加正態(tài)分布線，程序支持多種主題、配色選擇，運行在一個面板中可視化多組數(shù)據(jù)，或者將每組數(shù)據(jù)以面板分割可視化。

3.7 BoxStat

箱線圖在傳統(tǒng)的圖像上支持多組數(shù)據(jù)單面板或多面板可視化，程序同樣支持多種主題和配色。箱線圖中可以添加散點、四分位線、統(tǒng)計學(xué)數(shù)據(jù)。

3.8 ViolinStat

小提琴圖在傳統(tǒng)的圖像上支持多組數(shù)據(jù)單面板或多面板可視化，程序同樣支持多種主題和配色。可以添加箱線圖、散點、四分位線、統(tǒng)計學(xué)數(shù)據(jù)。

3.9 PieStat

餅圖支持根據(jù)數(shù)據(jù)自動計算百分比，默認保留兩位小數(shù)，每個扇形、扇形之間的Gap區(qū)域皆運行用戶自定義美化，包括顏色、透明度、標簽。

3.10 DonutStat

同心圓圖類似與餅圖，支持根據(jù)數(shù)據(jù)自動計算百分比，默認保留兩位小數(shù)，每個扇形、扇形之間的Gap區(qū)域皆運行用戶自定義美化，包括顏色、透明度、標簽。

祝以上為此次大版本更新的內(nèi)容，祝大家科研生活愉快！