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分子的物理模型在化學(xué)中的作用

2022-08-12 10:05 作者:邱新龍分子模擬小破屋  | 我要投稿

與數(shù)學(xué)、物理學(xué)等學(xué)科廣泛使用概念模型不同,化學(xué)學(xué)科廣泛使用物理模 型,較少使用概念模型。為了說(shuō)明物理模型在化學(xué)中的作用,首先檢查如何用物 理模型描述氫氣與氧氣作用生成水的反應(yīng)

2H2 + O2— 2H2O (2-1)

在原子、分子模型(atomic models and molecular models)被廣泛認(rèn)可、采 納以前,化學(xué)家會(huì)根據(jù)上述反應(yīng)中所消耗的氫氣和氧氣的質(zhì)量以及生成的水的質(zhì) 量,得出1份氫氣與8份氧氣反應(yīng)生成9份水;或者,水由1份氫氣和8份氧氣 組成。類似地,雙氧水這種也是僅由氫、氧兩種元素組成的分子,由1份氫氣和 16份氧氣組成。

在原子、分子模型被廣泛采納后,化學(xué)家得出1個(gè)水分子由1 個(gè)氧原子和2個(gè)氫原子組成,而1個(gè)雙氧水分子則由2個(gè)氧原子和2個(gè)氫原子組 成。另外,化學(xué)反應(yīng)中反應(yīng)物和生成物之間的質(zhì)量關(guān)系,可用簡(jiǎn)單的算術(shù)運(yùn)算得 到,無(wú)需精確的實(shí)驗(yàn)測(cè)定。事實(shí)上,由于反應(yīng)(2-1)的反應(yīng)物都是氣體,產(chǎn)物 水在沸點(diǎn)溫度100°C以上也是氣體,用體積表示反應(yīng)物和產(chǎn)物的定量關(guān)系更接近 現(xiàn)代原子論、分子論的描述。在反應(yīng)(2-1)中,2體積氫氣與1體積氧氣反應(yīng) 生成2體積水(在相同溫度和壓力下)。

從這個(gè)簡(jiǎn)單的化學(xué)反應(yīng)可以發(fā)現(xiàn),如果刻意回避原子、分子模型,即使描述 水的化學(xué)組成以及氫氣與氧氣反應(yīng)生成水這樣的簡(jiǎn)單化學(xué)反應(yīng)也非常復(fù)雜。對(duì)蛋 白質(zhì)、核酸這樣復(fù)雜的生物分子及其發(fā)生的化學(xué)反應(yīng),刻意回避原子、分子模型 的描述顯然是無(wú)法實(shí)現(xiàn)的。事實(shí)上,正是由于多種分子模型的建立和廣泛采納, 為人們認(rèn)識(shí)分子的性質(zhì)及其分子間的化學(xué)反應(yīng)提供了巨大的便利,促進(jìn)了化學(xué)學(xué) 科的迅速發(fā)展。

物理模型是人類對(duì)自然界客觀事物或過(guò)程的簡(jiǎn)化、抽象和近似,是對(duì)客觀 事物或過(guò)程的某個(gè)、某些側(cè)面的反映。模型可以是不全面的、不完善的甚至是 不完全正確的。但是,任何模型只要能反映事物的某些屬性,有助于人們認(rèn)識(shí) 事物,就是有用的模型。因此,模型的價(jià)值不僅在于其正確性、完善性,更在 于其實(shí)用性。相反,目前看來(lái)正確的、完善的模型,隨著人們對(duì)事物認(rèn)識(shí)的不 斷深人,也可能被發(fā)現(xiàn)是不完善的甚至是錯(cuò)誤的,但這并不影響人們對(duì)該模型 的繼續(xù)使用。

物理模型并不深?yuàn)W,在人們?nèi)粘I钪须S處可見。例如,兒時(shí)玩過(guò)的洋娃 娃、玩具汽車,多是物理模型的實(shí)例。通過(guò)洋娃娃這個(gè)最簡(jiǎn)單的人體模型,幼小 的我們更加深入地認(rèn)識(shí)了人體的基本結(jié)構(gòu)與功能。中學(xué)生理課上,通過(guò)更復(fù)雜的 人體模型認(rèn)識(shí)了人體的器官與功能等。類似地,通過(guò)玩具汽車這個(gè)簡(jiǎn)單的汽車模 型,人們認(rèn)識(shí)了汽車的基本結(jié)構(gòu)與功能。市場(chǎng)上更復(fù)雜、高檔的電動(dòng)玩具汽車 等,可以幫助人們更加深入地了解汽車的內(nèi)部結(jié)構(gòu)與功能,是更復(fù)雜的物理 模型。

化學(xué)研究的是微小的分子,不但肉眼無(wú)法觀察,即使電子顯微鏡也難以直接 觀察。只有借助最先進(jìn)的掃描隧道顯微鏡,才能直接觀察最簡(jiǎn)單的分子。因此, 分子的物理模型,更是學(xué)習(xí)和研究化學(xué)不可缺少的工具。

在化學(xué)教學(xué)和研究中,最常用的是球棍模型(ball and stick models)。球棍 模型反映了分子最基本的屬性:原子大體上球形對(duì)稱,化學(xué)鍵把成鍵原子連接起 來(lái)形成分子,原子在分子中的排列次序及其相對(duì)位置固定。為了從不同側(cè)面了解 分子的性質(zhì)或強(qiáng)調(diào)分子的不同特性,化學(xué)中還常常用到其他類型的分子模型。例 如,比例模型(spacefilling models或CPK molecular models)可以比較精確地 反映分子內(nèi)不同原子及原子間距離的相對(duì)尺寸。近年來(lái),隨著個(gè)人計(jì)算機(jī)圖形功 能的增強(qiáng)和化學(xué)圖形軟件的日益普及,像帶狀模型(ribbon models)、管狀模型 (tube models),荊棘條模型(licorice models)、線狀模型(wireframe models) 等分子模型得到了廣泛的應(yīng)用,增進(jìn)了人們對(duì)分子結(jié)構(gòu)的認(rèn)識(shí),促進(jìn)了化學(xué)、生 物化學(xué)、材料科學(xué)等的發(fā)展。

隨著化學(xué)研究的進(jìn)一步深入,上述各種由不同形狀的幾何體表示的分子的幾 何模型(geometrical models) ?已經(jīng)越來(lái)越難滿足實(shí)際工作的需要。因此,出現(xiàn) 了比幾何模型更深入的物理模型。例如,為了理解或解釋分子的紅外光譜,必須 在分子幾何模型的基礎(chǔ)上,引入化學(xué)鍵伸縮和鍵角彎曲的諧振子模型或其他振動(dòng) 模型。為了理解或預(yù)測(cè)大分子的構(gòu)型與性質(zhì),特別是復(fù)雜的生物分子的構(gòu)型與功 能,必須在化學(xué)鍵伸縮和鍵角彎曲振動(dòng)模型的基礎(chǔ)上進(jìn)一步引入化學(xué)鍵的轉(zhuǎn)動(dòng)、 分子內(nèi)和分子間的非鍵或弱鍵相互作用等模型。在分子幾何模型的基礎(chǔ)上,引入分子內(nèi)和分子間相互作用及其能量的概念后,就得到了分子的力學(xué)模型或分子力 場(chǎng)模型(molecular force field models)。

分子力場(chǎng)模型,仍然不能解釋分子的許多性質(zhì),需要發(fā)展。例如,分子力場(chǎng) 模型雖可以解釋分子的振動(dòng)光譜,但無(wú)法解釋分子的可見-紫外光譜、X射線光 電子能譜(X-ray photoelectron spectroscopy)等。這時(shí),就需要引入比分子力 場(chǎng)模型更進(jìn)一步的量子力學(xué)模型(quantum mechanical models)。分子的量子力 學(xué)模型,是建立在Schrodinger方程或密度泛函理論基礎(chǔ)上的一個(gè)電子模型,研 究電子在組成分子全部原子核所形成的電場(chǎng)中的運(yùn)動(dòng)及其規(guī)律,是目前人們所知 的最深入的分子模型。但是,求解分子的量子力學(xué)模型非常困難,目前只有在處 理孤立的不太大的分子或者具有周期性邊界條件的晶體等體系時(shí)才能得到比較精 確的結(jié)果,在處理大分子或處在溶液中的分子等時(shí),難以得到理想的結(jié)果。

從上述分析可以知道,雖然化學(xué)與數(shù)學(xué)和物理學(xué)相比較少使用概念模型和數(shù) 學(xué)公式,但在化學(xué)中廣泛應(yīng)用各種類型的分子模型。這些分子模型是典型的物理 模型,它們的建立和應(yīng)用在化學(xué)研究中起著極其重要的作用。對(duì)于化學(xué)或相關(guān)專 業(yè)人員,除了需要學(xué)習(xí)并掌握各種實(shí)驗(yàn)方法和技能外,不可忽視對(duì)分子模型的學(xué) 習(xí),嘗試用分子模型解釋觀察到的實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象。此外,還要善于總結(jié)實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象,從 實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象中抽提規(guī)律,建立合理的分子模型。


分子的物理模型在化學(xué)中的作用的評(píng)論 (共 條)

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