第1章

1)什么是C-值悖理?什么是N-值悖理?

C-值悖理：生物基因組的大小同生物進(jìn)化所處地位的高低無(wú)關(guān)的現(xiàn)象。

N-值悖理：基因數(shù)目與進(jìn)化程度或生物復(fù)雜性的不對(duì)應(yīng)性，稱之為N值悖理

2)什么是序列復(fù)雜性??

基因組中不同序列的DNA總長(zhǎng)，用bp 表示。

3)RNA分子有哪些種類?

mRNA tRNA rRNA scRNA snRNA snoRNA 小分子干擾RNA

4)不編碼蛋白質(zhì)的RNA包括哪些類型?

tRNA rRNA scRNA snRNA snoRNA 小分子干擾RNA

5)什么是假基因?假基因是如何形成的?

來(lái)源于功能基因但已失去活性的DNA序列，有沉默的假基因，也有可轉(zhuǎn)錄的假基因。

產(chǎn)生假基因的原因有很多，如編碼序列出現(xiàn)終止密碼子突變，或者插入和缺失某些核苷酸使mRNA移碼，造成翻譯中途停止或者異常延伸，合成無(wú)活性的蛋白質(zhì)。

6)假基因能否表達(dá)??為什么?

能，假基因相對(duì)于原來(lái)的基因已經(jīng)失去功能但是可能產(chǎn)生新的功能。

最初人們認(rèn)為, 假基因是不能轉(zhuǎn)錄的基因, 隨著基因組數(shù)據(jù)的積累, 現(xiàn)在已知有不少假基因仍然保持轉(zhuǎn)錄的活性, 特別是起源于重復(fù)基因的假基因和獲得啟動(dòng)子加工的假基因，但假基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物已失去原有的功能, 如產(chǎn)生殘缺蛋白質(zhì)。

7)如何劃分基因家族??什么是超基因家族?

基因家族：將來(lái)自共同的祖先，因基因加倍或變異產(chǎn)生了許多在DNA序列組成上基本一致而略有不同的成員劃分為一個(gè)基因家族。

超基因家族：起源于共同祖先，由相似DNA序列組成的許多基因亞家族或相似的基因成員構(gòu)成的群體，它們具有相似的功能。

8)低等生物與高等生物基因組組成有何差別?為什么會(huì)產(chǎn)生這些差別?

低等生物：1)結(jié)構(gòu)緊湊，一般不存在內(nèi)含子（古細(xì)菌除外）；

?2)大小在5 Mb以下；

?3)缺少重復(fù)序列；

?4)很少非編碼序列。

高等生物：1)結(jié)構(gòu)松弛，含有大量重復(fù)序列；

?2） 基因大多為斷裂基因，由內(nèi)含子和外顯子構(gòu)成；

?3)由線性DNA與蛋白質(zhì)組成染色體結(jié)構(gòu)； 4)含有細(xì)胞器基因組。

9）有哪些結(jié)構(gòu)異常的基因？舉例說(shuō)明。

重疊基因：編碼序列彼此重疊的基因。

?1.單個(gè)的mRNA可以編碼2種或多種蛋白質(zhì)。例如：大腸桿菌噬菌體ΦX174基因組長(zhǎng)5386bp，共編碼11個(gè)基因，有7個(gè)基因?yàn)橹丿B基因，其中3個(gè)重疊基因A，A*和B共享部分3’端序列。

?2.由不同的啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的彼此重疊的mRNA，各自編碼不同的蛋白質(zhì)。例如：人類核基因組INK4a/ARF座位有2個(gè)蛋白質(zhì)產(chǎn)物p16和p19，他們利用同一座位的不同啟動(dòng)子，第一個(gè)外顯子不同，但共享第二和第三個(gè)外顯子，產(chǎn)生兩個(gè)不同讀框的mRNA。

基因內(nèi)基因：一個(gè)基因的內(nèi)含子中包含其他基因。例如：線蟲(chóng)基因組中一個(gè)編碼甘氨酸合成酶的基因FGAM有21個(gè)內(nèi)含子，內(nèi)含子9中含有一個(gè)獨(dú)立的基因，內(nèi)含子11中含有4個(gè)獨(dú)立的基因。

反義基因：與已知基因編碼序列互補(bǔ)的負(fù)鏈編碼的基因。例如：大麥有3個(gè)可在種胚糊粉層專一性表達(dá)的α-淀粉酶基因，2個(gè)為A型，一個(gè)為B型，由赤霉素誘導(dǎo)表達(dá)?；蚪M中已檢測(cè)到編碼A型α-淀粉酶反義RNA基因，它的表達(dá)受控于脫落酸，這是脫落酸拮抗赤霉素的分子機(jī)制之一。

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第2章

名詞解釋

遺傳圖、物理圖、重疊群、小衛(wèi)星、微衛(wèi)星

問(wèn)答題：

1.理想的遺傳作圖標(biāo)記應(yīng)該滿足哪些條件？RFLP、SSLP和SNP標(biāo)記各有什么特點(diǎn)和優(yōu)缺點(diǎn)？

2. 造成遺傳圖發(fā)生偏離的因素有哪些？

1)什么是遺傳圖？遺傳作圖的理論基礎(chǔ)是什么？

遺傳圖是應(yīng)用遺傳學(xué)分析方法將基因或其他DNA序列標(biāo)定在染色體上構(gòu)建的連鎖圖。

基礎(chǔ)：孟德?tīng)?865年首次描述的遺傳學(xué)原理。

2）什么是分子標(biāo)記？有哪些分子標(biāo)記??各有什么特點(diǎn)?

是指以DNA片段為標(biāo)記，通過(guò)DNA片段的電泳使DNA產(chǎn)生多態(tài)性。

限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性（restriction fragment length polymorphisms,RFLP）

特點(diǎn)：1）.處于染色體上的位置固定。

2）.同一親本及其子代相同位點(diǎn)上的多態(tài)性片段特征不變。

3）.同一凝膠電泳可顯示同一位點(diǎn)不同的多態(tài)性片段，具有共顯性特點(diǎn)。

4）.有兩種等位形式。

簡(jiǎn)單序列長(zhǎng)度多態(tài)性（simple sequence length polymorphisms,SSLP）

具有多等位性。

又可分為可變串聯(lián)重復(fù)（variable number of tandem repeat,VNTR）

特點(diǎn)：多態(tài)信息含量較高，但數(shù)量有限，而且在基因組上分布不均勻，不適合PCR擴(kuò)增。

?簡(jiǎn)單串聯(lián)重復(fù)序列（single sequence repeat,SSR）

特點(diǎn)：1) 染色體上的位置相對(duì)固定;

2) 操作簡(jiǎn)單，可以用PCR擴(kuò)增；

3) 同一凝膠電泳可顯示不同多態(tài)性片段,表現(xiàn)為共顯性；4) 有多種等位形式。

單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphisms,SNP）

特點(diǎn)：1)理論上同一堿基位置SNP等位形式最多為4，但多數(shù)為2.

2)直接從STS 測(cè)序中可尋找到SNP.

3)數(shù)量極大,

4)SNP與人類易感性疾病有關(guān), 涉及藥物基因組學(xué).

5)編碼區(qū)SNP主要分布在密碼子的第3個(gè)堿基位置.

3）什么是RFLP？為什么會(huì)產(chǎn)生RFLP?

限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性（restriction fragment length polymorphisms）：由于同源染色體同一區(qū)段DNA序列的差異，當(dāng)用限制酶處理時(shí)，可產(chǎn)生長(zhǎng)度不同的限制性DNA片段，這些DNA片段經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳分離，可直接顯示不同個(gè)體同一位點(diǎn)的DNA組成的差異。

凡是可以引起酶切位點(diǎn)變異的突變?nèi)琰c(diǎn)突變和一段DNA的重新組織（如插入和缺失造成酶切位點(diǎn)間的長(zhǎng)度發(fā)生變化）以及堿基突變等均可導(dǎo)致RFLP的產(chǎn)生

4）?什么是SSR標(biāo)記? 為什么會(huì)產(chǎn)生SSR？SSR標(biāo)記有哪些優(yōu)點(diǎn)??

SSR標(biāo)記：是一類由幾個(gè)核苷酸（一般為1~6個(gè)）為重復(fù)單位組成的長(zhǎng)達(dá)幾十個(gè)核苷酸的串聯(lián)重復(fù)序列。

主要產(chǎn)生于DNA復(fù)制時(shí)出現(xiàn)的“滑序”事件以及SSR序列等位形式之間的不等交換。

優(yōu)點(diǎn)：1) 染色體上的位置相對(duì)固定，數(shù)量豐富且分布均勻;

2) 操作簡(jiǎn)單，可以用PCR擴(kuò)增；

3) 同一凝膠電泳可顯示不同多態(tài)性片段,表現(xiàn)為共顯性；

4) 有多種等位形式。

5)什么是SNP?

基因組中單個(gè)核苷酸的突變。

6)是什么原因造成染色體不同區(qū)段之間交換頻率的差別?

同源染色體之間的不均等交換。

7)什么是重組熱點(diǎn)?

染色體上某些比其他位點(diǎn)有更高交換頻率的位點(diǎn)。

第3章

名詞解釋

限制性作圖?、序列標(biāo)記位點(diǎn)、序列標(biāo)記位點(diǎn)作圖、作圖試劑、、克隆文庫(kù)、指紋

問(wèn)答

物理作圖的主要方法有哪些？原理分別是什么？各有什么優(yōu)缺點(diǎn)？

什么叫序列標(biāo)記位點(diǎn)？序列標(biāo)記位點(diǎn)需要具備什么條件？如何在基因組當(dāng)中尋找序列標(biāo)記位點(diǎn)？

如何組建克隆重疊群？

1）什么是基因組物理圖??物理圖與遺傳圖有何不同?有了遺傳圖為什么還要繪制物理圖？
直接檢測(cè)DNA標(biāo)記在染色體上的實(shí)際位置。

前者是描述的基因相對(duì)位置,后者是具體的堿基位置

因?yàn)檫z傳圖存在以下缺點(diǎn)：

1.遺傳學(xué)圖譜分辨率有限。 2.遺傳學(xué)圖的覆蓋面較低。 3.遺傳圖分子標(biāo)記的排列會(huì)出現(xiàn)偏差。

2)如何制備與分離大分子DNA?

采用脈沖凝膠電泳（pulsed-filed gel electrophoresis ,PFGE）將一個(gè)方向不斷變換的電場(chǎng)，取代簡(jiǎn)單的單一電場(chǎng)（單向電場(chǎng))使電泳中受阻的DNA分子在電場(chǎng)改變時(shí)扭轉(zhuǎn)遷移方向，較小的分子比較大的分子重新排列的快，以此達(dá)到分離的目的。分辨率達(dá)到10Mb。

3)何謂限制性作圖?

將限制性酶切位點(diǎn)標(biāo)定在DNA分子的相對(duì)位置。

4)什么是YAC載體??它有什么優(yōu)缺點(diǎn)?

酵母人工染色體（yeast artificial chromosome,YAC），具有酵母染色體的特性，以酵母細(xì)胞為宿主，能在酵母細(xì)胞中復(fù)制。

優(yōu)點(diǎn): 容量大, 插入片段可達(dá)1400 kb.

缺點(diǎn): 轉(zhuǎn)化效率低；插入子穩(wěn)定性差；嵌合克隆比例高, 達(dá)48%；插入DNA的制備相當(dāng)困難。

5)什么是BAC載體??它有什么優(yōu)缺點(diǎn)??

細(xì)菌人工染色體(bacterial artificial chromosome,BAC)，具有細(xì)菌染色體的特性，以細(xì)菌細(xì)胞為宿主，能在細(xì)菌細(xì)胞中復(fù)制。

優(yōu)點(diǎn)：?jiǎn)慰截悘?fù)制，不會(huì)因重組發(fā)生嵌合；采用類似制取質(zhì)粒的方法直接克隆DNA，便于機(jī)械化操作。

6)什么是重疊群（contig）??如何構(gòu)建重疊群?

相互重疊的DNA片段組成的物理圖成為重疊群。

最早采用染色體步移法，首先叢集引文庫(kù)中挑選一個(gè)隨機(jī)或者指定的克隆，將該克隆的起始末端序列分離純化作為探針，然后再基因文庫(kù)中找到與之重疊的第二個(gè)克隆。在第二個(gè)克隆的基礎(chǔ)上重復(fù)操作程序?qū)ふ业谌齻€(gè)克隆，一次延伸，直到完成所需要的重疊群。

7)STS作圖依據(jù)的原理是什么?

兩個(gè)STS出現(xiàn)在同一片段的機(jī)會(huì)取決于他們?cè)诨蚪M中的距離，彼此靠的越近，分離的幾率越小。

兩個(gè)STS之間相對(duì)距離的估算與連鎖分析的原理一樣，它們之間的圖距根據(jù)它們的分離頻率來(lái)算。

8)什么是DNA指紋??有哪些DNA指紋?

DNA指紋：指確定DNA樣品所具有的特定DNA片段組成。

種類：限制性帶型（restriction pattern）指紋；重復(fù)序列（repetitive DNA）指紋；重復(fù)序列DNA PCR(repetitive DNA PCR)或者分散重復(fù)序列PCR（interspersed repeat element PCR, IRE-PCR）;STS作圖（STS content mapping）指紋。

第4章

名詞解釋：

順序間隙、物理間隙、支架、覆蓋面

問(wèn)答：

自動(dòng)化測(cè)序的原理？

基因組測(cè)序與組裝有哪些策略？他們各有什么優(yōu)缺點(diǎn)？

重疊群之間的間隙有哪兩種？

1)DNA測(cè)序中采用的DNA多聚酶與細(xì)胞的DNA多聚酶有什么差別?

1.高酶活性

2.無(wú)5’→3’外切酶活性

3.無(wú)3’→5‘外切酶活性

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2）?鳥(niǎo)槍法測(cè)序與作圖法測(cè)序有何差別?

鳥(niǎo)槍法測(cè)序把基因組全部打散成短序列，測(cè)序后通過(guò)程序?qū)ふ一ハ喔采w的部分進(jìn)行連接得到整個(gè)的序列結(jié)果。

適合小，簡(jiǎn)單，重復(fù)序列少的基因組，測(cè)序速度快，并且無(wú)須提供相關(guān)的遺傳圖譜和物理圖譜，效率高。

作圖法先將DNA分解成長(zhǎng)序列，然后把長(zhǎng)序列通過(guò)mapping定位到染色體上某段位置,再把長(zhǎng)序列打散成短序列進(jìn)行測(cè)序，適合大分子DNA克隆，測(cè)序時(shí)間長(zhǎng)，依賴遺傳圖譜和物理圖譜，效率低。

3)為何原核生物基因組更適合鳥(niǎo)槍法測(cè)序?

因?yàn)樵松锘蚪M結(jié)構(gòu)緊湊，一般不含有內(nèi)含子（古細(xì)菌除外），大小在5Mb以下，缺少重復(fù)序列，很少非編碼的序列。

而鳥(niǎo)槍法適合基因組小，簡(jiǎn)單，重復(fù)序列少的測(cè)序。

4)圖解說(shuō)明BAC克隆測(cè)序與序列組裝的過(guò)程.

書(shū)82頁(yè)

5)為何BAC克隆測(cè)序和全基因組鳥(niǎo)槍法測(cè)序都會(huì)留下間隙（gap）?

任何基因組的測(cè)序都不可避免的會(huì)出現(xiàn)序列間隙和物理間隙。

6)什么是物理間隙??什么是序列間隙??如何填補(bǔ)這兩類間隙?

物理間隙：構(gòu)建基因組文庫(kù)被丟失的DNA序列，他們從已有的克隆群體中永遠(yuǎn)的消失。物理間隙的縫合需要利用其他載體或者宿主菌重新構(gòu)建一個(gè)基因組文庫(kù)，然后利用間隙兩側(cè)的序列作為探針，或者制備相應(yīng)的PCR引物，從新文庫(kù)篩選陽(yáng)性克隆，重新測(cè)序。

序列間隙：測(cè)序時(shí)遺漏的序列，這些序列任然保留在尚未挑選到的克隆中。序列間隙可以通過(guò)利用相鄰已知順序作為探針，篩選已有的基因組文庫(kù)，挑選陽(yáng)性克隆重新測(cè)序進(jìn)行縫合。

7)大型基因組鳥(niǎo)槍法測(cè)序的缺點(diǎn)是什么??如何克服這些缺點(diǎn)?

?容易產(chǎn)生間隙，組裝時(shí)容易出錯(cuò)

與作圖法結(jié)合或多次測(cè)序多次組裝

8)基因組鳥(niǎo)槍法測(cè)序要構(gòu)建大小不同的插入片段克隆文庫(kù),原因何在?

1.采用多個(gè)基因組文庫(kù)時(shí)因?yàn)槿魏我环N載體都會(huì)因某些插入片段與宿主菌的不兼容而不能擴(kuò)增，使一些DNA

片段丟失

2.多種質(zhì)粒文庫(kù)也增加了克隆片段的總長(zhǎng)，擴(kuò)大了覆蓋面

3.10kb文庫(kù)的構(gòu)建有助于在2kb質(zhì)粒來(lái)源的兩端測(cè)序序列組裝時(shí)校正由重復(fù)序列產(chǎn)生的差錯(cuò)

4.Fosmid和BAC文庫(kù)的構(gòu)建可以使下片段DNA文庫(kù)組建的重疊群在大分子克隆中有效而準(zhǔn)確地歸并與整合，避免了再全基因組范圍內(nèi)直接進(jìn)行重疊群排序所產(chǎn)生的錯(cuò)誤，可提高序列組裝的效率，保證序列組裝的可信度。

9)為何著絲粒區(qū)和近端粒區(qū)DNA的測(cè)序非常困難?

重復(fù)序列多

第5章

1)簡(jiǎn)述原核生物和真核生物基因結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)與差別.

真核生物有內(nèi)含子外顯子

2)什么是ORF??

開(kāi)放讀框（open reading frame），由一系列指令氨基酸的密碼子組成。

3)什么是序列同源性??什么是序列一致性??什么是序列相似性?

同源性：起源于同一祖先但發(fā)生變異的序列之間的關(guān)聯(lián)性。

一致性：同源DNA序列的同一堿基位置上相同的堿基成員，或蛋白質(zhì)中同一氨基酸位置相同的氨基酸成員的比例。

相似性：同源蛋白質(zhì)氨基酸序列中一致性氨基酸和可取代氨基酸所占的比例。

4)什么是直系同源基因??什么是共生同源基因??它們的差別是什么?

直系同源基因：不同物種之間的同源基因，他們來(lái)自物種分割之前的同一祖先。

共生同源基因：同一生物內(nèi)部的同源基因，他們常常是多基因家族的不同成員，其共同的祖先可能存在于物種形成之前或之后。

直系來(lái)自不同物種，共生來(lái)自同一物種。

5)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域在基因注解中有何意義?

由于蛋白質(zhì)的整體功能是通過(guò)各個(gè)結(jié)構(gòu)之間的協(xié)同作用而實(shí)現(xiàn)的，因此結(jié)構(gòu)域的組成提供了蛋白質(zhì)功能解毒的關(guān)鍵信息。

6)基因剔除的原理.

在一段無(wú)關(guān)片段的兩側(cè)連接與帶換基因兩側(cè)相同的順序，將這一構(gòu)件導(dǎo)入目的細(xì)胞，由于同源片段之間的重組，可以使無(wú)關(guān)片段取代靶基因整合到染色體中。為了便于篩選,用于取代的外源DNA中含有報(bào)告基因。

基因剔除是最簡(jiǎn)便的基因失活的方法，用于高等生物基因功能的研究。

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第6章

1)異染色質(zhì)與常染色質(zhì)的差別是什么?

異染色質(zhì)，分布在細(xì)胞核周緣，結(jié)構(gòu)致密，著色深。

常染色質(zhì)，分散在整個(gè)細(xì)胞核當(dāng)中，結(jié)構(gòu)比較松弛，著色淺。

2)何謂SAR??何謂MAR?

骨架附著區(qū)（scaffold attachment region，SAR）：與染色體骨架附著區(qū)結(jié)合的DNA序列。

基質(zhì)附著區(qū)（matrix attachment region,MAR）:與核基質(zhì)結(jié)合結(jié)合的DNA序列。

3)什么是CpG島? CpG島有什么分布特點(diǎn)? CpG島是如何產(chǎn)生的?

CpG島:基因組中富含雙堿基CpG的序列。

特點(diǎn)：1.主要在脊椎動(dòng)物中發(fā)現(xiàn),其它種屬基因組中也有CpG島, 但特征不明顯.

2.絕大多數(shù)CpG島中很少出現(xiàn)胞嘧啶甲基化, 因此被認(rèn)為是基因轉(zhuǎn)錄活躍區(qū).

3.CpG島主要分布在基因的啟動(dòng)子區(qū)和第一個(gè)外顯子區(qū).

4.絕大多數(shù)管家基因含有CpG島, 是尋找基因的一個(gè)指標(biāo).

5.在染色體上分布很不均勻，但與基因的分布頻率一致。

產(chǎn)生原因：1. 由于細(xì)胞內(nèi)胞嘧啶甲基化與脫氨基事件常常發(fā)生, 導(dǎo)致復(fù)制時(shí)的C→A錯(cuò)配.在下一輪復(fù)制時(shí)原來(lái)的胞嘧啶(C)位置由胸腺嘧啶(T)取代, 即發(fā)生堿基代換. 因此基因組DNA順序進(jìn)化的總趨勢(shì)是A/T比例增加.

2. 管家基因?qū)ι锏拇婊顦O其重要, 啟動(dòng)子區(qū)是基因調(diào)控的主要成分, 因此很少發(fā)生可遺傳的C→A的突變, 保留了較平均值更高的G/C比.

4)葉綠體和線粒體基因組起源于原核生物的依據(jù)何在?

1.細(xì)胞器基因表達(dá)的過(guò)程很多方面與細(xì)菌相似；

2.細(xì)胞器基因與細(xì)菌基因相似性高于核基因。

5)真細(xì)菌和古細(xì)菌操縱子的組成有何差異?

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6)什么是DNA轉(zhuǎn)座子??什么是RNA轉(zhuǎn)座子(或逆轉(zhuǎn)座子)??這兩類轉(zhuǎn)座子的轉(zhuǎn)座方式有何特點(diǎn)?

DNA轉(zhuǎn)座子：基因組中廣泛存在的一類可以移動(dòng)位置的遺傳因子，涉及DNA的直接轉(zhuǎn)座。

RNA轉(zhuǎn)座子：以RNA為中介進(jìn)行轉(zhuǎn)座。

第一類本身含有編碼轉(zhuǎn)座子酶的基因，可以自主轉(zhuǎn)錄。第二類本身不含有編碼轉(zhuǎn)座子酶的基因，需要在轉(zhuǎn)座的時(shí)候提供轉(zhuǎn)座酶才能轉(zhuǎn)座。

8)?逆轉(zhuǎn)座子可分為哪幾類??各有什么特點(diǎn)?

LTR類逆轉(zhuǎn)座子：A.逆轉(zhuǎn)錄病毒。B.逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子（缺少外殼蛋白基因）

非LTR類逆轉(zhuǎn)座子：C.重復(fù)序列LINE（缺少逆轉(zhuǎn)座子邊界順序） D.重復(fù)序列SINE（由mRNA反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生）

9)?線粒體基因組與葉綠體基因組在結(jié)構(gòu)與組成上有何差異?

線粒體基因組：1.結(jié)構(gòu)非均一

2.不同種屬之間線粒體基因組大小變化很大

3.含有大量短序列正向或反向重復(fù)序列

葉綠體基因組：1.結(jié)構(gòu)緊湊，少非編碼序列

2.不同種屬之間葉綠體基因組大小比較恒定

3.拷貝數(shù)不恒定

4.有兩段很長(zhǎng)的反向序列

第12-13章

1）?什么RNA世界?

科學(xué)依據(jù)多年的科學(xué)研究而提出的一條關(guān)于生命科學(xué)的理論。其內(nèi)容為:生命進(jìn)化的早期，沒(méi)有蛋白質(zhì)(酶)，某些RNA可以催化RNA的復(fù)制--也就是說(shuō)RNA是唯一的遺傳物質(zhì)，是生命的源頭。

2)何謂“生命的三界”？

真細(xì)菌，古細(xì)菌，真核生物 三域

3)?基因組主要通過(guò)什么方式增加基因的數(shù)目?

?1.整個(gè)基因組加倍； 2.單條或部分染色體加倍； 3.單個(gè)或成群基因加倍。

4)?新基因的產(chǎn)生有哪些主要方式?

基因或基因組加倍

結(jié)構(gòu)域洗牌

逆轉(zhuǎn)錄及其隨后的變異或重排

外源基因水平轉(zhuǎn)移

基因裂變與融合

非編碼順序轉(zhuǎn)變?yōu)榫幋a順序.

5)?什么是外顯子洗牌? 什么是結(jié)構(gòu)域重排??它在基因組進(jìn)化中起什么作用?

外顯子洗牌：由不同基因中編碼不同結(jié)構(gòu)域的片段彼此連接形成的全新編碼序列。

結(jié)構(gòu)域重排：不同的結(jié)構(gòu)域重新排列產(chǎn)生具有創(chuàng)新功能的基因。

它們會(huì)有一個(gè)全新的結(jié)構(gòu)組合，可為細(xì)胞提供完全不同的生物學(xué)功能。

6）?轉(zhuǎn)座子對(duì)基因組進(jìn)化有何影響？

1.大多數(shù)轉(zhuǎn)座因子含有控制基因表達(dá)的序列，轉(zhuǎn)座子的插入也能改變基因的表達(dá)模式

2.參與基因編碼序列重排，為基因創(chuàng)新提供原材料

3.可引起基因組重排

7)?基因組的擴(kuò)張有哪些方式?

?1.整個(gè)基因組加倍；

?2.單條或部分染色體加倍；

?3.單個(gè)或成群基因加倍。

1)?什么是分子鐘？（第14章）

單位時(shí)間內(nèi)同源蛋白質(zhì)氨基酸序列或DNA核苷酸序列取代的比率稱為分子鐘。