利用純生物信息學(xué)分析發(fā)表高分SCI，相關(guān)性熱圖和散點圖是相關(guān)性分析中必不可少的可視化展示方式。

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關(guān)于相關(guān)性，表示數(shù)據(jù)之間的相互依賴關(guān)系。但需要注意，數(shù)據(jù)具有相關(guān)性不一定意味著具有因果關(guān)系。相關(guān)性在組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘中應(yīng)用非常廣，如樣本的重復(fù)檢驗、基因的共表達(dá)分析、微生物群落的共發(fā)生網(wǎng)絡(luò)分析等。

研究兩個數(shù)值變量之間的關(guān)系，通常會選擇散點圖。在散點圖中，每個數(shù)據(jù)點都單獨表示為一個點，x 軸對應(yīng)一個特征值，y 軸對應(yīng)另一個特征值。

熱圖是直方圖的二維版本，可以替代散點圖。和散點圖一樣，要繪制的兩個數(shù)值變量位于兩個坐標(biāo)軸上。和直方圖類似，圖表區(qū)域被劃分為網(wǎng)格，累計每個網(wǎng)格的數(shù)據(jù)點數(shù)量。

利用純生物信息學(xué)分析發(fā)表高分SCI，相關(guān)性熱圖和散點圖是相關(guān)性分析中必不可少的可視化展示方式。如下圖。這是來自Frontiers in Immunology的一篇IF > 7分生信文章。

文獻(xiàn)中的相關(guān)性熱圖和散點圖

相關(guān)性分析其實較為簡單，用R語言自帶的cor()函數(shù)非常容易計算得到兩兩變量間的相關(guān)系數(shù)。但是具體要如何實現(xiàn)？？？ 今天，小編以代碼提供的數(shù)據(jù)為例通過R語言實現(xiàn)相關(guān)性計算并繪制相關(guān)性熱圖和散點圖。

代碼具體包括：

Step1 輸入數(shù)據(jù)（基因表達(dá)矩陣）

Step2 cor()函數(shù)計算相關(guān)性

Step3繪制相關(guān)性熱圖和散點圖

下面是代碼中附帶數(shù)據(jù)繪制的相關(guān)性熱圖

下面是代碼中附帶數(shù)據(jù)繪制的相關(guān)性散點圖

神奇吧，就是如此簡單，我們用的都是入門級函數(shù)，稍微懂點R語言就能實現(xiàn)。

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