蛋白質(zhì)N端的重要生物學(xué)功能和測序技術(shù)
蛋白質(zhì)和多肽N端的重要生物學(xué)功能
蛋白質(zhì)的合成從N端開始,蛋白質(zhì)N端的序列組成影響蛋白質(zhì)的整體生物學(xué)功能。例如,N端序列影響蛋白質(zhì)的半衰期,并與蛋白質(zhì)亞細(xì)胞器的定位有關(guān)。蛋白質(zhì)的N端測序分析有助于分析蛋白質(zhì)的高級(jí)結(jié)構(gòu)并揭示蛋白質(zhì)的生物學(xué)功能。隨著現(xiàn)代生物制藥工業(yè)的發(fā)展,出現(xiàn)了許多蛋白質(zhì)和肽類藥物分子。這些蛋白質(zhì)藥物分子的N端序列的分析和確認(rèn)也是制藥行業(yè)質(zhì)量控制中的重要環(huán)節(jié)。N端區(qū)域也是蛋白質(zhì)和肽的重要結(jié)構(gòu)和功能位點(diǎn),大多數(shù)蛋白質(zhì)可以通過N端的幾個(gè)氨基酸殘基來鑒定。例如,鑒定蛋白質(zhì)和肽類藥物N端的人工修飾位點(diǎn),如環(huán)化修飾和甲基化修飾,可以為提高其降解穩(wěn)定性和延長功效奠定基礎(chǔ)。
蛋白質(zhì)和多肽的N端測序技術(shù)
Edman降解
埃德曼降解法是一種非常成熟和經(jīng)典的蛋白質(zhì)和多肽N端測序的方法,被廣泛應(yīng)用于生物技術(shù)領(lǐng)域。Edman降解測序的原理主要是指通過循環(huán)反應(yīng)從蛋白質(zhì)的N端一一鑒定氨基酸類型,從而確定蛋白質(zhì)的N端序列。在堿性條件下,異硫氰酸苯酯(PITC)與待分析肽的N端氨基反應(yīng),形成苯胺硫代甲酰胺衍生物,然后用酸處理耦合產(chǎn)物。肽鏈的N端被選擇性切割,釋放出該氨基酸殘基的噻唑啉酮苯胺衍生物。提取的氨基酸衍生物在強(qiáng)酸性條件下轉(zhuǎn)化為穩(wěn)定的PTH-氨基酸,降解的PTH-氨基酸可以通過HPLC或電泳分析來得到蛋白質(zhì)或肽的N端序列信息。
Edman降解測序的缺點(diǎn)
Edman降解法受到許多限制,例如用于序列分析的蛋白質(zhì)或肽必須具有高純度,不適合用于高通量分析,靈敏度不夠等。
質(zhì)譜N端測序
基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)N端序列分析技術(shù),尤其是電噴霧電離(ESI)和基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間(MALDI-TOF)技術(shù)的應(yīng)用,質(zhì)譜在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析中的應(yīng)用發(fā)生了一次革命性的飛躍。高靈敏度、高精度、高分辨率和高通量生物質(zhì)譜技術(shù)為蛋白質(zhì)N端測序提供了一個(gè)重要的選擇,基于質(zhì)譜的N端測序技術(shù)可以實(shí)現(xiàn)N端封閉和PEG化蛋白質(zhì)的序列測定,這是對(duì)Edman測序的有效補(bǔ)充。該分析可用于確認(rèn)和鑒定重組蛋白藥物的高級(jí)結(jié)構(gòu)完整性以及重組蛋白N端序列的修飾位點(diǎn)。

化學(xué)標(biāo)記結(jié)合質(zhì)譜
N端序列分析的許多研究方法都結(jié)合使用了質(zhì)譜技術(shù)以及各種化學(xué)方法和生物酶方法,例如,蛋白質(zhì)被側(cè)鏈氨基的還原、烷基化和胍基化封閉。用不同的生物素試劑標(biāo)記游離的N端,用胰蛋白酶消化標(biāo)記的蛋白質(zhì)后,用抗生物素蛋白親和系統(tǒng)分離被標(biāo)記的N端肽,然后通過MALDI-TOF/MALDI-TOF-PSD MS從頭測序獲得N端肽的序列。
N端測序的未來發(fā)展
隨著經(jīng)典方法、基于質(zhì)譜的各種化學(xué)修飾以及酶輔助技術(shù)的不斷發(fā)展和完善,蛋白質(zhì)和多肽的N端序列分析獲得了豐富的末端肽序列信息,為加速蛋白質(zhì)藥物高級(jí)結(jié)構(gòu)的鑒定和修飾位點(diǎn)的研究提供了有力的基礎(chǔ)。復(fù)雜生物系統(tǒng)中成千上萬種蛋白質(zhì)的N端序列分析技術(shù)仍然是我們面臨的巨大挑戰(zhàn),尤其是對(duì)于更大規(guī)模地詳細(xì)確定N端修飾多樣性而言,還需要更具針對(duì)性的研究策略。未來的發(fā)展方向可能是探索選擇性更好、修飾更可控的化學(xué)修飾試劑和修飾條件。
參考文獻(xiàn)
1. John Bryan Smith. Peptide Sequencing by Edman Degradation. Encyclopedia of Life Sciences,2001.
2. Vecchi M M, Xiao Y, et al. Identification and Sequencing of N-Terminal Peptides in Proteins by LC-Fluorescence-MS/MS: An Approach to Replacement of the Edman Degradation. Anal Chem, 2019, 91(21):13591-13600.
3. Misal S A, Li S, et al. Identification of N-terminal protein processing sites by chemical labeling mass spectrometry. Rapid Commun Mass Spectrom, 2019;33(11):1015-1023.