蛋白檢測的鳥槍法
鳥槍法(Shotgun)是一種基于“自下而上”策略的蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析技術(shù),它通過直接分析蛋白肽段進(jìn)而實(shí)現(xiàn)對完整蛋白的分析,所以稱之為“自下而上”。進(jìn)行鳥槍法蛋白質(zhì)組學(xué)分析,首先要將完整蛋白質(zhì)酶解消化為小分子肽段,然后利用質(zhì)譜法檢測經(jīng)液相色譜分離后的肽段,根據(jù)肽段母離子的質(zhì)譜數(shù)據(jù)如質(zhì)荷比、離子峰強(qiáng)度等實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的多種分析。鳥槍法策略采用數(shù)據(jù)依賴型模式盡可能的采集所有肽段母離子的碎片信息,可以盡可能多的鑒定樣品中的全部蛋白質(zhì),是一種高通量的蛋白質(zhì)分析技術(shù),可同時(shí)鑒定成百上千種蛋白質(zhì)。常見的Label Free、SILAC、TMT和iTRAQ等蛋白質(zhì)定量技術(shù)都是基于鳥槍法進(jìn)行的。
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