如何拿下國自然新熱點擬素化修飾?看這篇29分文章的研究思路!
Hello!小薇帶著國自然新熱點擬素化修飾(Neddylation)來嘍!擬素化修飾是近年來發(fā)現(xiàn)的新型蛋白質翻譯后修飾,可以廣泛地調(diào)節(jié)生物學過程。Cell metabolism上發(fā)表的這篇最新研究中,研究者詳解擬素化修飾調(diào)控葡萄糖代謝穩(wěn)態(tài)的新機制。那么我們要如何get這個新熱點?今天小薇就帶大家一起了解這些問題,一起探索這篇文章研究內(nèi)容及思路。 文獻詳情:
l?題目:磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1的擬素化控制葡萄糖代謝 l?雜志:Cell metabolism l?影響因子:IF=29 l?發(fā)表時間:2023年7月
研究背景
葡萄糖是細胞能量的主要來源。在禁食期間,肝臟通過動員內(nèi)部營養(yǎng)儲存和非碳水化合物前體從頭產(chǎn)生葡萄糖(糖異生),在維持葡萄糖穩(wěn)態(tài)中起著關鍵作用。這些生理代謝重編程支持身體能量需求,而這種重編程的改變會導致不同病理條件下葡萄糖穩(wěn)態(tài)的異常,如癌癥和糖尿病。 擬素化(Neddylation)是近年來發(fā)現(xiàn)的一種類似泛素化的蛋白質翻譯后修飾過程,涉及一個三步的酶促過程,可以通過多種方式調(diào)節(jié)蛋白質的活性。但泛素化的作用仍然很大程度上未知。 研究思路
在本篇文章中,作者首先在小鼠體內(nèi)驗證肝擬素化作用受到營養(yǎng)物質利用率的調(diào)節(jié)。接著作者在小鼠中使用四種擬素化損傷模型,發(fā)現(xiàn)擬素化在肝臟維持葡萄糖生產(chǎn)中發(fā)揮著重要作用。進一步,作者在四種模型中發(fā)現(xiàn)擬素化缺乏均顯著降低了激素治療的高血糖效應,并評估了擬素化作用的中斷是否會導致胰島素抵抗。同時作者評估了肥胖、血糖正?;騎2D正常的成人(男性和女性)肝臟中的擬素化水平。接著作者通過蛋白質組,鑒定出糖異生的關鍵限制酶PCK1,并進一步揭示PCK1在K278、K342和K387殘基中的擬素化是其體內(nèi)、外糖異生活性所必需的。(ps有問題找小薇,關注小薇,科研熱點、國際前沿or創(chuàng)新型思路,想看啥call下小薇,咱就是說安排?。? 主要結果
01肝擬素化作用受到營養(yǎng)物質利用率的調(diào)節(jié)
首先作者使用禁食24小時的小鼠,發(fā)現(xiàn)NAE1、NEDD8和擬素化的肝cullins(一個由NEDD8擬素化的蛋白家族)的蛋白水平增加;再喂養(yǎng)后下降(圖1A)。進一步觀察到糖食組和瘦素治療組中禁食誘導的肝臟NAE1、NEDD8和擬素化cullins的蛋白水平的的升高被減弱(圖1B,1C)。與此相一致的是,缺乏瘦素受體的小鼠(db/db小鼠)顯示NEDD8和擬素化的cullins水平升高(圖1D)。這些數(shù)據(jù)表明,肝臟擬素化水平通過瘦素受體依賴的機制,因營養(yǎng)缺乏而增加的。
02抑制肝擬素化可以減少葡萄糖的產(chǎn)生
作者在小鼠中使用了四種擬素化損傷模型。與對照組小鼠相比,四種動物模型顯示血糖水平較低,直接反映了糖異生受損(圖1F-1I)。禁食24小時后,所有模型的小鼠的血糖水平都下降(圖1J-1M)。當接受熱量限制(caloric restriction,CR)時,這些模型都沒有一個能夠維持與對照組小鼠相同的血糖水平(圖1N-1Q)。與此一致,與對照組相比,禁食(圖1R)和熱量限制(圖1S)肝臟Nae1敲低小鼠的肝葡萄糖生成(hepatic glucose production,HGP)降低??傊?,這些發(fā)現(xiàn)表明,擬素化在肝臟維持葡萄糖生產(chǎn)中發(fā)揮著重要作用。
圖1 擬素化在缺乏營養(yǎng)時被激活,是維持血糖水平的必要條件?
03 肝擬素化調(diào)節(jié)胰高血糖素、腎上腺素和糖皮質激素的糖異生作用
在四種模型中,擬素化缺乏均顯著降低了激素治療的高血糖效應(圖2)。因此,擬素化介導了葡萄糖反調(diào)節(jié)激素的作用,并且是HGP所必需的。
圖2?擬素化是反調(diào)節(jié)激素的糖異生作用所必需的
04肝擬素化與胰島素抵抗相關l
作者用高脂肪飲食(HFD)喂養(yǎng)小鼠短期(4天),損害肝臟胰島素敏感性,刺激了HGP。在所有四種擬素化抑制條件下(如藥理或遺傳),小鼠在HFD治療4天后PTT期間顯示葡萄糖水平降低(圖3A-3D)。這些結果表明,阻斷擬素化可以改善HFD誘導的糖異生。接下來,作者通過在小鼠肝臟(livNAE1小鼠)中過表達NAE1(AAV-DIO-NAE1)進行了功能獲得實驗。這些小鼠與對照組小鼠的體重相同,但丙酮酸轉化為葡萄糖的能力增加,而葡萄糖耐量或胰島素敏感性沒有變化(圖3E-3J)。此外,livNAE1小鼠在禁食24小時期間(圖3K)和急性胰島素治療后(圖3L)也表現(xiàn)出高于對照組小鼠的血糖水平,這表明肝臟中擬素化的激活有利于HGP,并排除了胰島素的降血糖作用。
圖3?抑制擬素化可降低高脂肪飲食誘導的葡萄糖水平
05 2型糖尿病患者肝臟擬素化增加
作者評估了血糖正常肥胖或T2D的患者(男性和女性)肝臟中的擬素化水平。數(shù)據(jù)顯示,與正常血糖肥胖患者相比,T2D組NAE1、NEDD8和擬素化cullins蛋白水平升高(圖4A),以及NAE1和NEDD8蛋白水平與空腹血糖水平和口服葡萄糖耐量率呈正相關(圖4B和4C)。因此,這些發(fā)現(xiàn)表明,肝擬素化的變化與肥胖和T2D患者的高血糖有關。當按性別,數(shù)據(jù)顯示,與肥胖和血糖正常的肥胖女性和男性相比,肥胖和T2D的女性和男性肝臟中NAE1蛋白水平同樣增加(圖4D),擬素化的cullins和NEDD8的蛋白水平均有所升高(圖4D和4E)。
圖4 T2D患者的肝臟中擬素化水平升高
06 糖異生的關鍵限制酶PCK1在營養(yǎng)缺乏時被擬素化
接著,作者使用液相色譜串聯(lián)質譜(LC-MS/MS)分析方法分離了不同亞組的肝擬素化蛋白質組(圖5A)。在210個擬素化蛋白中,只有61個在CR后擬素化水平存在顯著差異。功能富集分析顯示,糖異生的比例過多(圖5B);例如,糖異生的關鍵限制酶PCK1。與自由喂食的對照組小鼠相比,PCK1在CR喂養(yǎng)的小鼠中富集。同時作者通過免疫沉淀發(fā)現(xiàn)肝臟中PCK1。這些實驗表明,在營養(yǎng)缺乏條件下,NEDD8與PCK1的共沉淀水平升高(圖5C和5D)。PCK1在營養(yǎng)剝奪時擬素化,PCK1和NAE1之間通過免疫共沉淀發(fā)現(xiàn)PCK1和NAE1在這些條件下更相關(圖5E和5F)。然后,作者進行了LC-MS/MS分析。通過PCK1肽譜分析發(fā)現(xiàn),三個PCK1賴氨酸在禁食條件下可能被擬素化:K278、K342和K387(圖5G)。
圖5 PCK1在熱量限制和禁食后在三個賴氨酸中被擬素化
07 PCK1在K278、K342和K387殘基中的擬素化是其體內(nèi)、外糖異生活性所必需的
最后,為了深入了解PCK1擬素化的功能后果,作者將肝細胞在沒有營養(yǎng)物質的培養(yǎng)基中培養(yǎng),然后沉默NAE1和NEDD8。禁食細胞的PCK1活性增加;相反,NAE1和NEDD8抑制阻斷了禁食誘導的PCK1活性,同時培養(yǎng)基中的葡萄糖水平降低(圖6A-6C)。這些結果也在體內(nèi)得到了證實。根據(jù)這些發(fā)現(xiàn)以及蛋白質組學和建模,發(fā)現(xiàn)同時突變PCK1的三個賴氨酸殘基(如K278、K342和K387)或單獨突變K387會降低培養(yǎng)基中的PCK1的活性和葡萄糖水平(圖6d和6E)。同樣,通過過表達WT PCK1,而不能通過過表達三個PCK1突變體或單一(K387R)PCK1突變體來恢復活性和葡萄糖生產(chǎn)(圖6D和6E),突出了PCK1賴氨酸殘基的擬素化對PCK1糖異生功能的相關性。PCK1的沉默降低了培養(yǎng)基中PCK1的蛋白水平和活性以及葡萄糖的釋放。PCK1-WT的補充恢復了PCK1的蛋白水平和活性,并持續(xù)增加了培養(yǎng)基中的葡萄糖分泌(圖6G-6I)。三突變體或單突變體的PCK1(K387R)均不能恢復PCK1的活性或葡萄糖水平(圖6J-6O)。同時,作者在小鼠體內(nèi)進一步證實結果。
圖6 擬素化的PCK1是體外糖異生功能所需要的
文章小結 上述研究中,作者描述了擬素化PCK1三個關鍵賴氨酸殘基在葡萄糖穩(wěn)態(tài)發(fā)揮生理作用,整體邏輯清晰、環(huán)環(huán)相扣!并結合組學分析探索潛在新靶標及應用價值。該文章對于擬素化的研究思路和實驗設計提供一個方向。感興趣的小伙伴們快來看看吧! 小薇有話說
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