1.菌種的高效性

　　細(xì)菌的高效微生物是微生物肥料的核心。根據(jù)不同作物和土壤類型，采用人工或生物工程技術(shù)對(duì)這些細(xì)菌進(jìn)行篩選和改良，經(jīng)過大量的科學(xué)實(shí)驗(yàn)，獲得了優(yōu)良菌株。由于核心菌株或菌株生理生化功能的差異，不同微生物肥料的效果不盡相同。以根瘤菌為例，菌株的固氮作用差異很大，有些菌株甚至沒有固氮作用。

　　2.活性菌量豐富

　　活性微生物的數(shù)量是充分發(fā)揮肥效的基礎(chǔ)。任何微生物肥料都必須含有足夠多的活性特定微生物，這些特定微生物的數(shù)量和純度直接關(guān)系到微生物肥料的應(yīng)用效果，是衡量微生物肥料質(zhì)量的重要標(biāo)志。當(dāng)微生物肥料中的特定微生物數(shù)量減少到一定程度，或者純度達(dá)不到要求時(shí)，肥效就會(huì)降低，甚至失效。因?yàn)榧?xì)菌的存活時(shí)間是有限的，微生物肥料的有效期也是衡量微生物肥料的一個(gè)重要因素。

　　3.種類明確，作用清楚

　　微生物肥料中發(fā)揮作用的微生物必須經(jīng)過嚴(yán)格的鑒定，其分類地位明確，對(duì)人、畜、植物無害，不會(huì)破壞土壤微生態(tài)環(huán)境。比如在生長(zhǎng)代謝過程中，有些假單胞菌可以產(chǎn)生促進(jìn)植物生長(zhǎng)的物質(zhì)，但也有一些有害物質(zhì)，有些甚至是人類、動(dòng)物或植物的致病菌。這種微生物不能用作微生物肥料。事實(shí)上，歷史上已經(jīng)有過使用未經(jīng)嚴(yán)格鑒定的微生物造成危害的教訓(xùn)。“有效無害”是生產(chǎn)和施用微生物肥料的原則，許多國家對(duì)此都有明確的立法。

　　4.針對(duì)性強(qiáng)，適用研究范圍管理得當(dāng)

　　不同的微生物肥料適用于相應(yīng)的作物和特定的土壤環(huán)境條件。在生產(chǎn)實(shí)踐中，很多用戶并沒有注意到這一點(diǎn)，在我國已經(jīng)出現(xiàn)了誤用小麥、玉米、大豆根瘤菌劑的情況。

　　5.嚴(yán)格的存儲(chǔ)和應(yīng)用技術(shù)

　　溫度、光線、酸堿度和滲透壓等環(huán)境因素會(huì)影響微生物的存活。微生物肥料的貯存條件應(yīng)為暗、低溫。應(yīng)使用微生物肥料以防止長(zhǎng)時(shí)間暴露于陽光下，以防止紫外線殺死肥料中的微生物; 不應(yīng)將微生物肥料與化學(xué)肥料直接混合使用，以避免滲透壓變化，并抑制或殺死其中一種有效的細(xì)菌。