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zotero+obsidian+dataview助力文獻(xiàn)閱讀

2022-06-26 17:05 作者:維客筆記  | 我要投稿

大家好,我是BCS!

很早之前,分享了一篇zotero與obsidian聯(lián)用的一個(gè)教程,但現(xiàn)在隨著需求的增加,不得不更新了!

1 工作流簡介

關(guān)于我的文獻(xiàn)閱讀工作流,之前或多或少都提到了一些

?? Obsidian模板插件有此一個(gè)足矣!

??給Obsidian新手科研人的開箱即用庫:BCS's Vault for Researchers V1.0

這次根據(jù)需要,又做了一些更新,部分流程參考了英文論壇的這個(gè)帖子[1]~

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  • 在Google/CNKI/wof等學(xué)術(shù)網(wǎng)站檢索文獻(xiàn)

  • 利用zotero connector插件保存文獻(xiàn)到zotero library

  • 文獻(xiàn)閱讀

    • 建議在閱讀之前,可先利用mdnotes插件生成文獻(xiàn)模板筆記到Obsidian

    • 利用zotero內(nèi)置的PDF閱讀器也可使用第三方閱讀器(推薦PDF exchange editor)

    • 邊閱讀邊在obsidian中積累筆記和寫作素材,通過設(shè)置好的快捷方式一鍵添加文獻(xiàn)閱讀隨想和專業(yè)知識(shí)元筆記

  • 新建一個(gè)文獻(xiàn)閱讀筆記匯總頁,利用dataview將文獻(xiàn)筆記和文獻(xiàn)閱讀隨想?yún)R總展示(可根據(jù)需要補(bǔ)充/修改筆記內(nèi)容(這里主要利用懸浮編輯)& 回顧筆記 & 知識(shí)串聯(lián).......)

下圖就是一個(gè)Reading Notes的匯總預(yù)覽圖,就類似于Notion中的數(shù)據(jù)庫

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一鍵隨想(文獻(xiàn)閱讀隨想)和補(bǔ)充新知(專業(yè)知識(shí)筆記)的演示,請看此推文??

為BCS's Vault for Researchers開箱即用庫加入了更便捷的思考環(huán)節(jié)和專業(yè)知識(shí)歸納環(huán)節(jié)

大致的流程就是這么多~

2 配置教程

對于文獻(xiàn)檢索與導(dǎo)入zotero的過程我就不再介紹了,研究生生存基本技能~

2.1 Mdnoteos與zotero聯(lián)用

這一部分之前也有介紹,貌似之前的前程略微繁瑣,這次整個(gè)更簡單的

??Zotero與Obsidian交互 助力科研

2.1.1 Mdnotes和better Bibtex插件安裝

可在文末獲取這倆插件,然后依次點(diǎn)擊zotero---Tools---Add-ons,即可彈出如下界面

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此刻你只需要將mdnotes和better bibtex插件拖入此界面,即可完成安裝

對于better bibtex插件,是否安裝,主要看你自己需求,如果你使用Latex寫論文的話還是很有必要安裝的;如果只使用word,那大可不必安裝。


2.1.2 配置Mdnotes占位符

為了能夠利用dataview匯總文獻(xiàn)筆記,我們需要在zotero中利用占位符對字段格式進(jìn)行自定義,也就是能夠讓dataview識(shí)別到。這個(gè)在mdnotes說明文檔[2]里也有詳細(xì)說明。

dataview能識(shí)別Yaml區(qū)內(nèi)的字段,且字段后只需要跟一個(gè)冒號(hào)和一個(gè)空格;當(dāng)然對此文獻(xiàn)筆記占位符,我更推薦使用字段+雙冒號(hào)+一個(gè)空格這種方式,emmm,對于dataview的基礎(chǔ)知識(shí),請自行了解,網(wǎng)上太多了,本推文不做介紹。

下面咱們就來更改zotero中mdnotes字段的占位符

  • 依次點(diǎn)擊edit---preference---Advanced---General---config editor

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  • 在彈出的配置占位符的窗口中輸入mdnotes檢索一下,如下圖

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我有必要說一下上圖,一共有4列:

  • 第一列就是占位符名稱(也可理解為ob筆記模板的字段名稱),注意看前面一大長串都是相同的,只有后面.url ?.tags ?.title等有區(qū)別,也就是說你需要自定義一個(gè)這里沒有的占位符,照抄上面的名稱就行,第二、三列不用管

  • 第四列就是占位符具體的格式,設(shè)置具體原理自己看說明文檔,這里我只說你怎么改,而且改動(dòng)非常小,也非常簡單。就拿url這個(gè)來說吧,只需要將Value這一列,{{field_contents}}前面的內(nèi)容換為我上圖的\nURL:: 即可,注意URL后是雙冒號(hào)+一個(gè)空格。

  • 另外publicationTitle就是我新建的,你把下面的名稱和value復(fù)制粘貼過去就行,名稱:extensions.mdnotes.placeholder.publicationTitle;值:{"content":"\npublicationTitle:: {{field_contents}}","zotero_field":"publicationTitle","link_style":"wiki"}

當(dāng)然,你可能不知道如何新建一個(gè)占位符?

右鍵標(biāo)題欄(就是preference name那一欄)----New----String

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然后就是輸入名稱和值

配置完之后,關(guān)閉即可。


2.1.3 在Obsidian中新建文件夾和筆記模板

  • 新建文件夾。打開Obsidian,新建一個(gè)文件夾(名稱自定義,例如Reading Notes),用于存放文獻(xiàn)筆記,在我的開箱即用庫中B-科研筆記/Reading Notes已新建此文件夾。

  • 新建筆記模板。新建一條筆記,將其名稱命名為Mdnotes ? ? ? ? ? ? ? ? ?Default ? ? ? ? ?(默認(rèn)) ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?Template ? ? ? ? ?(模板) ? ? ? ? ? ? ? ?(必須是此名稱,不可自定義),然后將此筆記(模板)放在模板文件夾下,當(dāng)然你想放在任意文件夾下都是可以的。在本人分享的開箱即用庫中,此模板存放于Z-附件/@Templates文件夾下。

關(guān)于mdnotes筆記模板,這里我需要強(qiáng)調(diào)一下,mdnotes的模板有好幾種:

  1. Mdnotes Default Template.md

  2. Standalone Note Template.md

  3. Zotero Metadata Template.md

  4. Zotero Note Template.md

    我采用的是第一種,這種會(huì)創(chuàng)建一條包含文獻(xiàn)元數(shù)據(jù)的空白筆記文件(也就是說不會(huì)將你標(biāo)注的內(nèi)容提取出來);如果你需要提取PDF標(biāo)注內(nèi)容,請使用3和4,具體配置參見mdnotes說明文檔[2]

emmm,我的最新文獻(xiàn)筆記模板,在V1.5版本的開箱即用庫中獲取。


2.1.4 Mdnotes偏好設(shè)置

安裝好插件之后,點(diǎn)擊Tools,便會(huì)看到mdnotes preference,點(diǎn)擊它

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在彈出窗口(見下圖)中要設(shè)置模板文件和筆記存放文件夾路徑

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我不喜歡將citekey設(shè)置為標(biāo)題,因?yàn)椴环奖阄以趏b中檢索,我偏向于將筆記名稱設(shè)置為年+文獻(xiàn)title。

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前綴設(shè)置為‘-’是為了在其前面輸入年份,看個(gè)例子:

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mdnotes的配置完成。


2.1.5 better BibTex的配置

配置它的目的是將其導(dǎo)出的Bib引用格式設(shè)置為google學(xué)術(shù)導(dǎo)出的bib引用格式。

依次點(diǎn)擊Edit---preference---選中better BibTex,按下圖配置

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配置完畢。


2.2 在Ob中設(shè)置一鍵隨想和補(bǔ)充新知

在閱讀文獻(xiàn)的過程中,難免會(huì)遇到各種問題和產(chǎn)生各種想法,此時(shí)便需要方便快捷的記錄它。當(dāng)然你可以直接寫在obsidian文獻(xiàn)筆記里,但這樣不適合引用和匯總。

另外,根據(jù)我自己的工作流,我希望將遇到的新知識(shí)(主要是概念,原理等)都添加到專業(yè)知識(shí)這個(gè)文件夾中,方便日后補(bǔ)充和引用。

下面說一下具體配置教程

用到的插件是QuickAddpage ? ? ? ? ? ? ? ? ?header ? ? ? ? ?(標(biāo)頭) ? ? ? ? ? ? ? ?以及Ob模板

2.2.1 設(shè)置模板

在模板文件夾新建兩個(gè)模板,模板名稱隨意,在我的開箱即用庫中就命名為文獻(xiàn)閱讀隨想模板和專業(yè)知識(shí)模板,模板里的內(nèi)容自定義,下面是我的模板(放在開箱即用庫里了)

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模板的內(nèi)容根據(jù)自己的需要隨便填。要強(qiáng)調(diào)的一點(diǎn)是,為了能用dataview查詢到不在yaml區(qū)的字段,在字段后要跟兩個(gè)冒號(hào)和一個(gè)空格。


2.2.2 配置QuickAdd

我就以一鍵隨想為例,演示如何設(shè)置,【quickadd的簡介和原理我就不介紹了,帖子很多】

  • 打開Quickadd選項(xiàng)頁,按下圖輸入

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  • 點(diǎn)擊add choice,然后點(diǎn)擊右邊的配置一鍵隨想

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  • 在彈出的窗口中,按下圖配置

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按上圖配置,當(dāng)你運(yùn)行一鍵隨想命令,便會(huì)在@Inbox/ZK Box文件夾創(chuàng)建一條以日期+時(shí)間為名稱的筆記,且此筆記的雙鏈會(huì)被添加到當(dāng)前文獻(xiàn)筆記的光標(biāo)處。此功能倒是與我之前分享的這篇推文類似??

  • 然后在Quick窗口,點(diǎn)擊一下閃電形狀的圖標(biāo),為了將其添加到命令,按ctrl+P可以檢索到它

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  • 接下來就是利用page ? ? ? ? ? ? ? ? ?header ? ? ? ? ?(標(biāo)頭) ? ? ? ? ? ? ? ?插件將一鍵隨想命令添加到文檔標(biāo)題欄,方便我們點(diǎn)擊

打開page header選項(xiàng),點(diǎn)擊Add Command,添加一鍵隨想命令即可

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補(bǔ)充新知(專業(yè)知識(shí)模板)也是按上述步驟配置,唯一不同的是,在點(diǎn)擊命令后,會(huì)彈出一個(gè)輸入窗口,我們可以直接輸入問題,并將此問題會(huì)自動(dòng)變?yōu)楣P記名稱,具體配置方式,在我的開箱即用庫里,打開quickadd選項(xiàng)即可看到,這里我就不多說了。


2.3 DataView匯總文獻(xiàn)筆記和一鍵隨想

前面配置好了,這個(gè)就很簡單了。安裝好dataview,然后設(shè)置好語句,就可以匯總了,最簡單的語句如下,直接復(fù)制粘貼過去就能用。

  • 文獻(xiàn)筆記匯總

這個(gè)在開箱即用庫V1.5的Home筆記中都配置好了,只要Reading Notes文件夾中有筆記,就會(huì)被檢索匯總到Home筆記中。

  • 一鍵隨想?yún)R總

這個(gè)是在@Inbox/ZK Box文件夾,已配置好,開箱即用。


3 寫在最后

拿到開箱即用庫V1.5版,文末獲取。

開箱方式(Ob新手指南)??

https://flowus.cn/hust1037/share/1c977c13-d3eb-4c52-a93f-d77f56e4923e

實(shí)現(xiàn)上述工作流,只需要做下面兩件事

  • 安裝mdnotes插件,配置mdnotes,就是2.1.4,設(shè)置模板和筆記存放路徑等

  • 修改占位符2.1.2和2.1.5


有問題,歡迎加入維客筆記交流群交流,特別歡迎你分享好玩且有趣的工具等,入群方式在公眾號(hào)后臺(tái)右下角(群人數(shù)大于200人,只能通過邀請入群),


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4 Reference

[1] 英文論壇帖子:

https://forum.obsidian.md/t/zotero-zotfile-mdnotes-obsidian-dataview-workflow/15536

[2] mdnotes說明文檔:

https://argentinaos.com/zotero-mdnotes/docs/quick-start-guide


插件與開箱即用庫獲取方式:關(guān)注維客筆記微信公眾號(hào),后臺(tái)回復(fù)20220626

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