大家好，歡迎觀看《時空日報(bào)》第43期。本期追蹤到時空/單細(xì)胞組學(xué)相關(guān)研究文章共計(jì)6篇。以下是應(yīng)用時空云平臺STOmics Cloud的StereoCopilot模塊生成的文章概要，并輔以人工審核，供了解參考。

1、染色體不穩(wěn)定引起的非細(xì)胞自主性癌癥進(jìn)展

Non-cell-autonomous cancer progression from chromosomal instability

Nature; IF:64.800; DOI: 10.1038/s41586-023-06464-z

內(nèi)容概要：研究了染色體不穩(wěn)定性（chromosomal instability，CIN）對癌癥轉(zhuǎn)移的影響，并發(fā)現(xiàn)CIN誘導(dǎo)的cGAS-STING通路的慢性激活促進(jìn)了癌細(xì)胞下游信號重構(gòu)，導(dǎo)致促轉(zhuǎn)移的腫瘤微環(huán)境。通過使用STING抑制劑治療，可以減少CIN驅(qū)動的黑色素瘤、乳腺癌和結(jié)直腸癌的轉(zhuǎn)移。這項(xiàng)研究為識別和治療CIN誘導(dǎo)的炎癥引發(fā)的腫瘤提供了可行的策略。

2、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析揭示胰腺癌肝轉(zhuǎn)移中的免疫抑制性腫瘤微環(huán)境

Single cell transcriptomic analyses implicate an immunosuppressive tumor microenvironment in pancreatic cancer liver metastasis

Nature Communications; IF:16.600; DOI: 10.1038/s41467-023-40727-7

內(nèi)容概要：研究了胰腺癌肝轉(zhuǎn)移的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)特征，發(fā)現(xiàn)肝轉(zhuǎn)移的腫瘤細(xì)胞具有明顯的轉(zhuǎn)錄組差異，并且在肝轉(zhuǎn)移的微環(huán)境中存在特定的亞型的基質(zhì)和免疫細(xì)胞，包括RGS5+?癌相關(guān)成纖維細(xì)胞、CCL18+?脂質(zhì)相關(guān)巨噬細(xì)胞、S100A8+?中性粒細(xì)胞和FOXP3+?調(diào)節(jié)性T細(xì)胞。

3、雙調(diào)蛋白結(jié)合IL1RL1+?調(diào)節(jié)性T細(xì)胞和癌相關(guān)成纖維細(xì)胞阻礙抗腫瘤免疫

Amphiregulin couples IL1RL1+?regulatory T cells and cancer-associated fibroblasts to impede antitumor immunity

Science Advances; IF:13.600; DOI: 10.1126/sciadv.add7399

內(nèi)容概要：IL1RL1信號通路在T細(xì)胞中抑制了IL-33和PD-1阻斷的抗腫瘤活性。通過scRNA-seq和阻斷實(shí)驗(yàn)，發(fā)現(xiàn)AREG-EGFR軸介導(dǎo)了IL1RL1+?調(diào)節(jié)性T（regulatory T，Treg）細(xì)胞和癌相關(guān)成纖維細(xì)胞（cancer-associated fibroblasts，CAFs）之間的相互作用。此外，雙調(diào)蛋白（amphiregulin，AREG）mAbs和IL-33聯(lián)合抑制了腫瘤生長。該研究揭示了一個以前未知的AREG/EGFR介導(dǎo)的Treg/CAF耦合機(jī)制，它控制著成纖維細(xì)胞功能狀態(tài)的分叉，是癌癥免疫治療的關(guān)鍵障礙。

4、原發(fā)性干燥綜合征中B細(xì)胞的多模態(tài)單細(xì)胞測序

Multi-modal single cell sequencing of B cells in primary Sj?gren's Syndrome

Arthritis and Rheumatology; IF:13.300; DOI: 10.1002/art.42683

內(nèi)容概要：通過scRNA-seq和scVDJ-seq，發(fā)現(xiàn)SSA/SSB自身抗體陽性（SSA/SSB+）的原發(fā)性干燥綜合征（primary Sj?gren's Syndrome，pSS）患者的幼稚B細(xì)胞比例最高，記憶B細(xì)胞比例最低，所有B細(xì)胞亞型中干擾素誘導(dǎo)基因的上調(diào)最為顯著。與對照組相比，IGHV1-69和IGHV4-30-4在所有pSS亞組中使用率更高。這些結(jié)果為pSS患者的分層提供線索，有助于更好地理解B細(xì)胞的內(nèi)在差異和其對表型和結(jié)果的影響。

5、二甲雙胍拯救腦室周圍異位癥患者細(xì)胞的遷移缺陷

Metformin rescues migratory deficits of cells derived from patients with periventricular heterotopia

EMBO Molecular Medicine; IF:11.100; DOI: 10.15252/emmm.202216908

內(nèi)容概要：通過scRNA-seq分析表明，人類神經(jīng)元祖細(xì)胞（human neuronal progenitor cells，hNPCs）的自噬相關(guān)基因表達(dá)水平相似。二甲雙胍通過增強(qiáng)AMPK依賴的自噬，可以促進(jìn)腦室周圍神經(jīng)元異位癥（periventricular neuronal heterotopia，PH）患者的hNPCs的遷移，暗示了在某些形式的PH中調(diào)節(jié)hNPCs的自噬可能會挽救神經(jīng)元遷移缺陷。

6、整合基于成像的分類和轉(zhuǎn)錄組學(xué)并根據(jù)人類卵母細(xì)胞生殖效率對其進(jìn)行質(zhì)量評估

Integrating imaging-based classification and transcriptomics for quality assessment of human oocytes according to their reproductive efficiency

Journal of Assisted Reproduction and Genetics; IF:3.100; DOI: 10.1007/s10815-023-02911-y

內(nèi)容概要：通過成像和scRNA-seq技術(shù)建立了一個排名工具，可以預(yù)測受精、囊胚化和著床的成功率。成像參數(shù)中的光密度、梯度、反差矩陣熵和結(jié)構(gòu)復(fù)雜度等具有最高的預(yù)測性能，揭示了低質(zhì)量卵子的細(xì)胞周期受損情況。

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