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可視化繪圖軟件Multi-omics Visual之組合圖繪制

2022-11-26 15:13 作者:生信小院  | 我要投稿


條形圖和折線圖雖然作為一種常見的圖,卻是生物實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)展示中必不可少的一環(huán)。然而,要畫出好看的折線圖或者條形圖,通常需要在諸如sigmaplot類的軟件上耐心細(xì)致的調(diào)整才能實(shí)現(xiàn)吧。至于將這兩種圖形進(jìn)行組合,應(yīng)該是許多繪圖軟件所缺少的,又或者說即便是能夠繪制,也需要較大的學(xué)習(xí)成本才能實(shí)現(xiàn)。而作為Multi-omics Visual軟件的開發(fā)者,又放任這一現(xiàn)象存在呢(主要是自己當(dāng)時(shí)也需要繪制這樣的圖,哈哈)。因此,在堅(jiān)持日常需要必開發(fā)的原則,在本軟件上實(shí)現(xiàn)了一個(gè)小功能bar_line_chart,可以幫助各位用戶快速進(jìn)行組合圖(條形圖和折線圖)的繪制和美化。

PS:這次也小小的改進(jìn)了一下調(diào)參窗口的GUI部分。

一 組合圖繪制

1、安裝好我們的軟件之后,首先第0步需要做就是打開軟件界面。

圖1 打開組合圖繪制界面

我們的示例文件內(nèi)容如步驟1。當(dāng)用戶準(zhǔn)備好文件之后,即可通過步驟2,即直接將文件拖入對(duì)話框,內(nèi)容即會(huì)被軟件讀取。需要注意的是,本文繪制的為組合圖,所以需要兩類文件,條形圖數(shù)據(jù)和折線圖數(shù)據(jù),通過步驟12僅能夠?qū)l形圖數(shù)據(jù)拖入軟件中。


圖2 讀取條形圖數(shù)據(jù)

接下來,通過步驟4將內(nèi)容為3的文件拖入軟件中進(jìn)行讀取。在數(shù)據(jù)讀取完畢之后,即可通過步驟5進(jìn)行調(diào)參。PS:因?yàn)楸緢D涉及兩個(gè)組合圖,所以調(diào)參部分會(huì)略顯復(fù)雜,然而,即使復(fù)雜,也通過步驟5的點(diǎn)點(diǎn)點(diǎn)即可實(shí)現(xiàn)。至于具體的調(diào)參環(huán)節(jié),后面的推文中會(huì)詳細(xì)介紹,用戶也可以自己下載軟件進(jìn)行摸索。


圖3 讀取折線圖數(shù)據(jù)并繪圖

最后,點(diǎn)擊‘start’按鈕,即可打開組合圖界面,如圖4所示。需要注意的是,本軟件提供了豐富多樣的參數(shù)用以對(duì)圖片進(jìn)行美化,比如條形圖柱子形狀、次要刻度線、雙坐標(biāo)軸等等。讀者可以充分利用這些參數(shù)完成圖片的繪制和美化工作。


圖4 繪制組合圖

本軟件的一大優(yōu)化就是用戶友好。使用本軟件的用戶可以通過步驟9和步驟10完成參數(shù)的保存與加載,這樣保證了每次繪圖都能夠從原來圖片的基礎(chǔ)上進(jìn)行進(jìn)一步的美化(當(dāng)然,也得在原數(shù)據(jù)的基礎(chǔ)上)。本次軟件更新主要是針對(duì)調(diào)參窗口的每個(gè)參數(shù)進(jìn)行了整理,將同類型的參數(shù)以一至三行的形式歸納到一起。

圖5 參數(shù)調(diào)節(jié)

二?慣例小結(jié)

其實(shí),需要注意的是,本軟件也有自身的局限性。因?yàn)楸救藦膭傞_始利用各種編程語(yǔ)言進(jìn)行圖片繪制時(shí),就發(fā)現(xiàn)有許多細(xì)節(jié)的參數(shù)無法調(diào)節(jié),或者說需要花費(fèi)大量的學(xué)習(xí)成本才了解如何進(jìn)行調(diào)節(jié)。因此,筆者就考慮出一款軟件,即有豐富又易用的多樣參數(shù),能夠讓讀者對(duì)單一圖片的各個(gè)細(xì)節(jié)進(jìn)行全面而細(xì)致的美化,從而繪制高質(zhì)量的圖片(本軟件也提供了批量繪圖的插件,但是這一插件無法做到對(duì)每個(gè)圖片都進(jìn)行美化,僅可模式化出圖,后期也會(huì)介紹)。

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另外,怎么說呢,投幣也可,不強(qiáng)求,但奢求。


可視化繪圖軟件Multi-omics Visual之組合圖繪制的評(píng)論 (共 條)

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