慢病毒感染效率低怎么辦,如何提高慢病毒感染效率?
病毒一直是基因轉導研究中的一大利器,尤其?慢病毒?更是實驗室的??汀H欢?,慢病毒的存儲不當或用量不合適,可能會導致轉染效率低,細胞狀態(tài)差等情況。
慢病毒感染效率低,主要需要考慮的問題有
1、細胞是否適合用慢病毒進行感染?(慢病毒適用于大部分細胞系,例如肝細胞、心肌細胞、腫瘤細胞等,但也有一些細胞不適合用慢病毒感染,可能更適合用腺病毒,可查閱文獻,或咨詢漢恒)
2、慢病毒是否進行了正確的存儲和稀釋?(如果病毒存儲不當或反復凍融會降低病毒滴度/活性,正確的存儲稀釋方法詳見下文)
3、感染操作問題(MOI是否合適?感染方法,感染及觀察時間是否合適?詳見下文)
4、對于一些難感染細胞的感染方法:例如懸浮細胞可使用平角離心轉染法,其他一些較難感染的細胞可進行二次感染。
5、可以添加助轉染試劑polybrene增加感染效率
慢病毒的安全和存儲
慢病毒相關實驗需要在生物安全柜(BL-2級別)內進行操作,如果不小心濺出也不要驚慌,立即用70%乙醇加 1%的SDS溶液擦拭干凈即可。接觸過病毒的槍頭,離心管,培養(yǎng)板等要用84消毒液浸泡后統(tǒng)一處理。病毒相關的廢棄物也需要特殊收集再統(tǒng)一經高溫滅菌處理哦。
慢病毒是存儲在-80℃的,如果您在收到慢病毒的一周內就會使用,也可放在4°C保存,避免反復凍融,有必要可以先進行分裝。
摸索病毒感染的MOI
MOI(Multiplicity of Infection,感染復數)是指每個細胞感染的病毒數,通常MOI越高,病毒整合到染色體的數量以及目的蛋白的表達量越高。
用96孔板摸索梯度值:
實驗前一天,以每毫升3~5X10^6個目的細胞接種96孔培養(yǎng)板中的12個孔,
體積為90 μl。感染預實驗共分為四組,每組三個不同梯度的MOI。
實驗開始,配備1X10^8TU/ml、1X10^7TU/ml、1X10^6TU/ml病毒液。
將10 μl三個不同梯度的病毒加到各組的相應孔中。加入的病毒量分別為1X10^6TU,1X10^5 TU,1X10^4 TU,而細胞經過生長,此時細胞的數目大約為1 X10^4個,所以三個孔的MOI分別為100、10、1
感染3-4天后,觀察熒光表達情況,通過細胞感染效果,確認目的細胞的感染條件和感染參數。
※ 每孔加病毒量(μl)=MOI*細胞數/滴度(TU/ml)×1000
確定了細胞的MOI值,下面就要開始進行細胞的感染
我們推薦1/2小體積感染法,即在正常培養(yǎng)液的一半量的情況下加入慢病毒,感染4h后補足培養(yǎng)液至正常體積,感染24h后換液。對于適用Polybrene的細胞,也可適量加入來提升感染效率,它最常用的工作濃度為6~8μg/ml。
感染后48h,對于帶GFP報告基因的病毒,可通過熒光顯微鏡觀測GFP表達效率,如果要篩選穩(wěn)定攜帶Puromycin抗性基因的病毒,則需換上含適當濃度Puromycin的新鮮完全培養(yǎng)液。
附:部分細胞慢病毒感染參數
注:不同實驗室由于細胞的來源、代數和細胞狀態(tài)等因素的影響,MOI值也略有差異,以下數據是在細胞感染效率在85-100%細胞狀態(tài)良好的情況下獲得的,僅供參考。
對于一些特殊的細胞在感染時我們還要注意以下事項
◆懸浮細胞:感染懸浮或半懸浮細胞,要通過平角離心轉染法,低速(200′g)離心1 h,然后放入培養(yǎng)箱中正常培養(yǎng)即可。若由于實驗條件有限,沒有平角離心機,可用離心管代替。
◆極難感染的細胞:對于極難感染的細胞,如DC(樹突狀細胞)等,可采用多次感染的方法,即感染24 h后,更換新鮮病毒進行二次感染,可顯著提升感染效率。
◆傳代能力較差的原代細胞:對于一些傳代能力較差的原代細胞,比如BMSC等,建議采用滴度更高的腺病毒進行感染。