1、排膿

排膿是其主要癥狀。一般來說，新生成的瘺管排膿較多，膿汁粘稠，黃色、味臭。瘺管日久的排膿相對較少，或時有時無，稀淡如水。若膿量增加，則表示新瘺管生成。瘺管有時會暫時封閉，不排膿液，從而出現(xiàn)局部腫痛，體溫上升，以后封閉的瘺口破潰，又排出膿液，也可從瘺口排出氣體或糞便。

2、疼痛

瘺管通暢無炎癥時，一般無疼痛，只有肛門局部略有腫脹感，行走時可加重，若外口封閉，瘺管存積膿液，或糞便進(jìn)入瘺管，則會使疼痛加重或排便時疼痛加重，而內(nèi)盲瘺則常感直腸下部和肛門部灼熱不適，排便時疼痛加重。

3、瘙癢

肛門部皮膚由于膿液及其他排出物刺激，常會感覺皮膚瘙癢。

4、硬結(jié)或瘢痕

由于瘺管壁及瘺口的反復(fù)刺激，使纖維組織增生，在管壁和瘺口形成質(zhì)韌的結(jié)締組織，常表現(xiàn)為瘺管周圍皮膚變色，表皮脫落，凹陷變形，觸及條索狀硬結(jié)通向肛門內(nèi)。

5、全身癥狀

多數(shù)無全身癥狀，當(dāng)肛瘺侵犯范圍較大、較深或支管較多時，反復(fù)炎癥感染，會導(dǎo)致消瘦、貧血、便秘、排便困難等全身癥狀。