玄內把黑暗之海的地圖傳送給西島老師，但是西島已經感應不到姬川的位置了。但他沒有放棄希望，他堅信著姬川還活著，一定還活著。

而如今的黑暗之海，死一般的緘默。比曾經更冷，更暗，無邊無際。海中心矗立著一根破舊的擎天柱，柱子的下面是熔巖，熔巖旁堆砌的墻已經支離破碎了。已經被恒常性關閉了的世界樹回到了它沉睡的地方，熔巖下還在等待著再次復出。

究極魔獸：世界樹，我來看你了。

世界樹：現(xiàn)在的你，大不一樣了吧。

究極魔獸拿出D3：是啊，大不一樣了，我終于可以出去了。

世界樹顫抖著，漸漸地隕滅了聲音。

我們把時間調轉回去……

究極魔獸到底是什么樣的存在呢？

因為平衡意志的出現(xiàn)，給恒常性造成了認知上的錯誤。也是因為這樣，姬川真希才有了這樣的命運。

啟示錄獸和四天王出現(xiàn)后，光暗天桿就成了大家的目標。在迪路獸和緬因貓獸的數(shù)據找到的時候，恒常性的錯誤就漸漸地出現(xiàn)了。它相信偶數(shù)才是平衡，奇數(shù)則會破壞平衡。

五個孩子，是奇數(shù)，違反了“平衡”的意志。為了達到平衡，恒常性放棄了姬川的選召，決定犧牲百萬龍獸。于是這場戰(zhàn)爭以超蛇龍獸的死和四天王的封印結束。

究極魔獸見證了這一切，決定對善行發(fā)起進攻，最終被刪除進入了黑暗區(qū)域(被消去數(shù)據的墓地)。究極魔獸在這里進行擴張，與其他六魔王組成黑暗軍團，發(fā)誓要征服數(shù)碼世界。

但是被大輔等人封印在了黑暗之海，來到黑暗之海的他殺掉了達高獸，吸收了他的數(shù)據，變得更加強大。他決定從黑暗之海出去，于是找到了沉睡的世界樹。用自身的力量去喚醒他，和世界樹進行了一場交易。

究極魔獸：我要跟你合作。

世界樹：我為什么要和你合作？

究極魔獸：你可以不同意，那我就直接刪掉你。

世界樹：你刪掉我你也出不去。

究極魔獸：雙贏的事情，你自己看著辦。

世界樹：說吧，你要干什么？

究極魔獸：我要去攻打恒常性，而你要占領人類世界，我們可以合作。

世界樹：需要我做什么？

究極魔獸：我用黑暗種子制造了黑玄內，并讓光暗天桿的數(shù)據變成摻雜啟示錄獸碎片的數(shù)碼獸？其實這都是你的功勞，對吧。

世界樹：我明白了。

因為緬因貓獸的出現(xiàn)，導致相位不平衡，一個又一個的扭曲出現(xiàn)，最初是空間的扭曲，緊接著是數(shù)碼寶貝自身數(shù)據錯位，就是所謂的感染。感染數(shù)碼獸的出現(xiàn)使得數(shù)碼獸之間又出現(xiàn)了不平衡。

恒常性立刻選召了望月芽心，作為緬因貓獸的搭檔，芽心可以讓緬因貓獸變得溫順和善。

但是，世界樹利用黑暗種子找到了黑玄內，讓黑玄內去破壞芽心和緬因貓的伙伴關系，一點一點讓芽心崩潰，芽心的神圣計劃在中途也被動了手腳。

讓阿爾法獸去攻擊02眾人，姬川可以順理成章拿走小賢的D3，被利用的姬川用D3暴龍機來到黑暗之海看到了食夢獸，但是食夢獸卻再也不認識她了。

而究極魔獸的計劃就是利用世界樹拿到D3，同時可以使恒常性和孩子們的關系瓦解。世界樹關閉，恒常性沉睡，拿到D3的究極魔獸可以自由進出黑暗之海，淺層數(shù)碼世界和現(xiàn)實世界。他的黑暗軍團也即將蓄勢待發(fā)。

究極魔獸站在岸邊，搖了搖頭，轉過身，一個巨大的黑色立方體出現(xiàn)了。

黑玄內：究極魔獸？！怎么是你！

究極魔獸：沒想到吧。

黑玄內：等下，世界……

究極魔獸進入了黑玄內的身體，戰(zhàn)斗的序幕即將開始！