生信分析中的轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫有哪些？
爾云間? 一個(gè)專門做科研的團(tuán)隊(duì)
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各位小伙伴大家好，小果和大家又見面了，今天呢小果來給大家分享幾個(gè)常用的轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫。小果下面的內(nèi)容從以下方面展開：一是什么是轉(zhuǎn)錄因子，二是常用轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫。
一、什么是轉(zhuǎn)錄因子，它的作用是什么？
轉(zhuǎn)錄因子全稱為transcription factor，簡稱TF，是一群能與基因5`端上游特定序列專一性結(jié)合，從而保證目的基因以特定的強(qiáng)度在特定的時(shí)間與空間表達(dá)的蛋白質(zhì)分子。真核生物在轉(zhuǎn)錄時(shí)往往需要多種蛋白質(zhì)因子的協(xié)助。一般這些促成轉(zhuǎn)錄起始所需的轉(zhuǎn)錄結(jié)構(gòu)包括三個(gè)重要的組成部分，即亞基，聚合酶復(fù)合物和特異順序。
轉(zhuǎn)錄因子是通過和順式因子的互作來實(shí)現(xiàn)的。這段序列可以和轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合域?qū)崿F(xiàn)共價(jià)結(jié)合，從而對基因的表達(dá)起抑制或增強(qiáng)的作用。
二、常用的幾個(gè)轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫
JASPAR數(shù)據(jù)庫
可預(yù)測轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)，
網(wǎng)址為：https://jaspar.genereg.net
Cistrome DB數(shù)據(jù)庫
可展示轉(zhuǎn)錄因子的相關(guān)調(diào)控，
網(wǎng)址為：http://cistrome.org/db/
HOCOMOCO數(shù)據(jù)庫
人與小鼠專用數(shù)據(jù)庫，
網(wǎng)址為：https://hocomoco11.autosome.ru/
hTFtarget數(shù)據(jù)庫
人類TF-target數(shù)據(jù)庫，網(wǎng)址為：
http://bioinfo.life.hust.edu.cn/hTFtarget#!/
以上就是小果的分享，轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫有很多，小果列了些自己常用的一些數(shù)據(jù)庫，供各位伙伴參考，同時(shí)也歡迎各位果粉提問留言。
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