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我說實驗方案設(shè)計遍地是雷,你同意嗎

2022-03-25 16:45 作者:爾云間  | 我要投稿


實驗方案設(shè)計是科研工作的關(guān)鍵環(huán)節(jié),“創(chuàng)新性”和“可行性”則是合格的實驗方案所必備的2個關(guān)鍵點。

理論上來說,及時跟進最新的科研動態(tài)、充分的前期調(diào)研、大膽的科研假設(shè)是提高科研創(chuàng)新性的主要思路,而結(jié)合自身資源、謹慎的方案設(shè)計則是提高可行性的重要途徑。

然而,現(xiàn)實中的科研實踐則總是比理論來的更復(fù)雜,我們受制于各種因素,面臨著多種制約和挑戰(zhàn)。

以下是我們列舉出的部分常見方案設(shè)計的

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戰(zhàn)略篇:

1,不知道有新熱點可供選擇,仍然在關(guān)注競爭最大的方向和相對過時的熱點,比如近年來細胞焦亡、鐵死亡已經(jīng)逐漸替代細胞凋亡和自噬等;

2,同一個研究熱點,在小疾病方向勉強還可以做,但是在關(guān)注度高的大疾病方向已經(jīng)近乎淘汰,比如以各種非編碼RNA研究出發(fā)的ceRNA機制等;

3,新熱點有聽說,但了解不夠深入,處于機械性模仿和抄作業(yè)階段,可能會造成一些錯誤,比如絕大部分非編碼RNA不具有物種保守性,也就是說非編碼RNA的研究原則上不能跨物種(部分miRNA除外)。

4,或出于主觀的省錢,或出于客觀的遺漏,方案設(shè)計中出現(xiàn)少量細節(jié)遺漏,按照審稿人的要求重新檢測指標(biāo),實驗幾乎需要重新做一遍;

5,做了一部分實驗,但是結(jié)果不符合,需要調(diào)整方案甚至完全更改研究方向:

6,標(biāo)書中標(biāo)了,當(dāng)時設(shè)計的一些高端、酷炫的實驗內(nèi)容,從可行性角度需要重新評估優(yōu)化;

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戰(zhàn)術(shù)篇(以細胞實驗為例):

1,盡量避免培養(yǎng)難度高細胞(比如,部分原代細胞、神經(jīng)細胞和干細胞)、細胞要做鑒定(STR鑒定、干性鑒定、分化能力鑒定等);

2,不知道哪株細胞好養(yǎng),可以優(yōu)先選擇文獻報道最多的細胞系;如果該細胞系依然不好培養(yǎng),可能是細胞老化或者凍存、復(fù)蘇操作失誤,建議更換一個采購渠道;

3,涉及到細胞模型構(gòu)建時,盡量將陰性對照、陽性對照和空白對照都做上,否則最后審稿人要求補一組,則很可能整個實驗都需要重做。另外,一定要驗證構(gòu)建模型是否成功;

4,基因敲低的細胞轉(zhuǎn)染可三選一:siRNA(需細胞容易轉(zhuǎn)+費用少+沉默時效短)、shRNA(需細胞容易轉(zhuǎn)+費用適中+沉默時效長)和shRNA慢病毒感染(難轉(zhuǎn)染的細胞+費用較高+沉默時效長);

5,細胞加藥實驗,不同公司、不同批次、不同純度的藥物作用效果差異很大,文獻報道差異也較大,注意文獻中的用藥單位及濃度梯度設(shè)置;

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沒有人能天生擅長某個具體領(lǐng)域,我們的方案設(shè)計團隊也是基于上千項方案設(shè)計的案例積累出方案設(shè)計的經(jīng)驗,最終我們將這些經(jīng)驗匯聚成上百頁的 “方案設(shè)計注意事項”,后期將逐步匯總,請保持關(guān)注我們。



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