純生信有多香，各位小伙伴都知道呀！純生信真是解決了不少科研打工人無實驗平臺或是實驗經(jīng)費不足的煩惱！這不是小云今天又給大家?guī)硪黄兩诺腟CI！這還是一篇1區(qū)SCI！ 先來總結一下這篇SCI的特點！第一個特點還是多疾病整合分析啦！當大家還在做雙疾病分析的時候！這篇SCI已經(jīng)悄悄做了6種疾病整合分析了！~目前研究也是主要趨向多疾病的關聯(lián)的研究，例如已有很多雙疾病的SCI文章啦，這篇文章更是做了6種疾病的整合分析！所以多疾病聯(lián)合分析是趨勢呀！第二點切入點也是比較新穎，主要是從神經(jīng)性厭食癥切入，給人一種眼前一亮！第三,?GWAS!科研人都懂！所以總結這篇SCI多疾病整合的全基因組分析選對了！ 研究神經(jīng)性厭食癥（AN）和相關表型的共同遺傳結構，包括精神分裂癥(SCZ)、雙相情感障礙(BIP)、重性抑郁(MD)、情緒不穩(wěn)定(mood)、神經(jīng)質(NEUR)和智力(INT)。使用基于多效性的條件錯誤發(fā)現(xiàn)率（FDR）統(tǒng)計量，通過結合兩個GWAS來鑒定AN位點，以它們與其他表型的關聯(lián)為條件來識別AN位點。此外，應用ConjFDR來鑒定共同的遺傳位點，從而揭示了AN與相關精神疾病和性狀之間的其他共享多基因結構。

（ps:不知道如何找切入點或創(chuàng)新升級的可以找小云?。?/p>

題目：神經(jīng)性厭食癥和主要精神疾病及相關性狀的全基因組分析揭示了遺傳重疊，并確定了神經(jīng)性厭食癥的新風險位點

雜志：translational psychiatry

影響因子：IF=?6.8

發(fā)表時間：2023年9月

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研究背景

神經(jīng)性厭食癥?（AN） 是一種遺傳性進食障礙 （50-60%），具有一系列常見的精神疾病和相關特征。盡管已經(jīng)報道了AN與精神疾病和相關性狀之間的顯著遺傳相關性，但它們的共同遺傳結構在很大程度上尚未得到充分研究。

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數(shù)據(jù)來源

研究思路

作者調查了AN與精神分裂癥(SCZ)、雙相情感障礙(BIP)、重性抑郁(MD)、情緒不穩(wěn)定(mood)、神經(jīng)質(NEUR)和智力(INT)的共同遺傳結構。應用條件性錯誤發(fā)現(xiàn)率(conditional false discovery rate, FDR)方法識別新的神經(jīng)癥風險位點，結合FDR方法識別神經(jīng)癥與相關表型共有的位點，匯總相關全基因組關聯(lián)研究(genome-wide association studies, GWAS)數(shù)據(jù)。個體GWAS樣本從72517到420879人不等。利用條件性FDR，發(fā)現(xiàn)了58個新的AN基因座。此外，發(fā)現(xiàn)了38個在AN和主要精神疾病(SCZ, BIP和MD)之間以及45個在AN和心理特質(Mood, NEUR和INT)之間的獨特位點。在遺傳相關性方面，大部分共享位點的效應方向一致。功能分析顯示，共享的基因座涉及65個獨特的通路，其中有幾個在分析中重疊，包括參與Hippo信號傳導的“MST1信號通路”。結果表明，神經(jīng)性厭食癥與相關疾病和性狀之間的一些共同特征可能有遺傳基礎。 ?

主要結果

1.?AN與相關精神疾病和心理特征的遺傳重疊和相關性 條件性Q-Q圖顯示，在每種精神疾病和心理性狀的關聯(lián)p值的條件下，AN的SNP富集程度連續(xù)增加(圖1)。在條件性狀的兩個方向上均具有較高顯著性的變異的子集持續(xù)增加的左偏，表明AN與其他精神疾病和相關性狀之間有大量的多基因重疊。 全基因組LD評分回歸顯示AN與以下疾病和性狀顯著正相關:SCZ、BIP、MD、NEUR和INT。AN和Mood之間的遺傳相關性不顯著。某些遺傳相關性(如AN和SCZ)的統(tǒng)計顯著性高于其他遺傳相關性(如MD和SCZ)，盡管點估計值較低，因為估計值的精確度較高。這可能是由于某些表型的遺傳度和可發(fā)現(xiàn)性較高(例如，SCZ的可發(fā)現(xiàn)性高于MD)。

圖1條件分位數(shù)-分位數(shù)圖

2.?AN與相關精神疾病和心理特征之間共有的位點 ConjFDR分析揭示了AN與相關疾病和性狀之間共享的許多位點（見表1），分別有20個、10個和20個位點與SCZ、BIP和MD相關。總之，在神經(jīng)性神經(jīng)痛和相關精神疾病之間確定了38個獨特的共享基因座。此外，分別有13、29和36個位點與Mood、NEUR和INT聯(lián)合相關。共有45個位點在AN與心理特質之間具有獨特的共通性;其中9個與AN和精神疾病獨有的38個重疊。在所有分析中合并物理上重疊的condFDR基因座后，共有56個與AN相關的“唯一”基因座。所有共享位點的曼哈頓圖見圖2-3。

圖2?基于-log10轉換的每個單核苷酸多態(tài)性的轉化conjFDR值的曼哈頓圖

圖3 基于-log10轉換的每個單核苷酸多態(tài)性的轉化conjFDR值的曼哈頓圖

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文章小結

其實這篇SCI主要優(yōu)勢是選對了切入點，多疾病整合的全基因組分析更上一層！利用GWAS數(shù)據(jù)發(fā)純生信SCI也是逐年增加，得益于GWAS在識別新型變異性狀關聯(lián)方面非常成功，發(fā)現(xiàn)新的生物機制。目前也有GWAS研究結果具有多種臨床應用，并且可以提供對復雜性狀的種族變異的洞察力。新穎的生信技術再加新穎的選題就能把握SCI門路。