一 起因

起因很簡單，實驗室的小伙伴寫的新算法需要在論文發(fā)表的同時發(fā)布到的網(wǎng)上，因此有了以下的過程。
二 調(diào)用

第一步，package的發(fā)布需要再系統(tǒng)層面完成兩步：build包（用于package的打包）的安裝和系統(tǒng)命令twine（package的上傳）的安裝。

第二步：在發(fā)布官方注冊賬號，需要記住賬號與密碼，后面包上傳需要。

第三步，創(chuàng)建一個文件夾，內(nèi)部包含以下文件。

3.1 LICENSE文件用于體現(xiàn)發(fā)布包的許可，官方模板如下：

3.2 pyproject.toml文件用于指定發(fā)布包的系統(tǒng)要求和信息，打包過程中將被使用到。官方模板如下：

3.3 README.md文件，這應(yīng)該是每個程序員最最熟悉的文件了，主要用于介紹發(fā)布包的一些相關(guān)情況。

第四步：發(fā)布包的資源創(chuàng)建。這一步我們需要再src文件下創(chuàng)建發(fā)布包的文件夾。，如本例中發(fā)布包的名稱是add_example，所以src下就有一個同名的文件夾。

這個文件夾即是你需要打包的文件夾，里面通常包含兩個文件，如下：

其中__init__.py可以是空文件，而example.py文件則需要放入你所需要發(fā)布的函數(shù)。本例中需要發(fā)布的就是add_one函數(shù)（就是加1，雖然簡單，但也是最重要的數(shù)據(jù)定理）

第五步：回到src所在目錄，調(diào)用函數(shù)對包進行打包

打包之后，本目錄下會新建一個dist目錄（用于上傳發(fā)布的目錄）

dist文件夾中會出現(xiàn)兩個文件：add_example-0.0.1.tar.gz和add_example-0.0.1-py3-none-any.whl。

當然，在src的文件夾中也會出現(xiàn)一個新的以.egg-info為后綴的文件夾，如下。

只是該目錄下的文件對于發(fā)布包并沒有任何作用。

第六步：利用twine命令上傳，直到顯示所有上傳都已完成即可

上傳完畢之后，你就可以在https://test.pypi.org/中看到你自己的項目了（需要登錄）。

然后，你通過manage按鈕點進去你的project，可以看到

接著點擊0.0.1，可以看見你上傳的兩個文件

即使如此，你上傳的庫會一直存在，如本文上傳的庫，即可以再https://test.pypi.org/project/add-example/#description網(wǎng)站查詢到。登錄進去后，可以看到網(wǎng)頁，如下：

之后，可以直接從pip直接一鍵安裝的命令。

也可以將我們上傳的文件下載下來，在本地進行編譯。

小貼士1，上傳的whl文件可以直接本地安裝，從而查看上傳的包是否會出現(xiàn)bug

小貼士2：這一上傳最好是在linux中（上傳也會比較慢），因為我在windows中上傳的特別慢

所有的檢測都是為了最后能夠正式安裝，所以最后一步必然是上傳到最重要的官方庫中啦（正式版的pypi端）官方庫地址：https://pypi.org/manage/projects/

PS 做一個更正與補充：

《圖一樂：如何使用機器學(xué)習(xí)成為具有藝術(shù)天分的畫家》推文中的github庫為https://github.com/invoke-ai/InvokeAI，下載的模型來自https://huggingface.co/CompVis/stable-diffusion-v-1-4-original

三 慣例小結(jié)

其實寫軟件的目的除了供自己用之外，最重要的目的應(yīng)該就是分享給大家使用了吧，亦或者商業(yè)化。不過對于論文而言，還是盡可能的希望開源吧，這樣才能快速提高，實現(xiàn)價值利用的最大化（不排斥商業(yè)化，畢竟人也是要吃飯的嘛），

Multi-omics Hammer軟件下載地址：

https://github.com/wangjun258/Multi-omics-Hammer

Multi-omics Visual軟件下載地址：https://github.com/wangjun258/Multi_omics_Visual/releases/tag/Multi_omics_Visual_v1.03

PS：因為本軟件是用python腳本撰寫，調(diào)用了部分依賴包，用戶首次使用需要安裝python以及對應(yīng)的包，安裝之后便可永久使用。

本公眾號開發(fā)的相關(guān)軟件，Multi-omics Hammer軟件和Multi-omics Visual軟件歡迎大家使用。文末是本公眾號在其他平臺的賬戶，也歡迎大家關(guān)注并多提意見。

簡書：WJ的生信小院

公眾號：生信小院

博客園：生信小院

最后，也歡迎各位大佬能夠在本平臺上：1傳播和講解自己發(fā)表的論文；2：發(fā)表對某一科研領(lǐng)域的看法；3：想要達成的合作或者相應(yīng)的招聘信息；4：展示自己以尋找博后工作或者博士就讀的機會;5:博導(dǎo)提供博后工作或者博士攻讀機會，都可以后臺給筆者留言。希望本平臺在進行生信知識分享的同時，能夠成為生信分析者的交流平臺，能夠?qū)崿F(xiàn)相應(yīng)的利益互補和雙贏（不一定能實現(xiàn)，但是夢想總得是有的吧）。

另外，怎么說呢，投幣也可，不強求，但奢求。?