西北農(nóng)林科技大學(xué)生命學(xué)院生物化學(xué)復(fù)習(xí)指南第7章 酶促反應(yīng)動力學(xué)
第7章 酶促反應(yīng)動力學(xué)
?名詞、符號、結(jié)構(gòu)
? DIFP :二異丙基氟磷酸(DIPF)??
? Ks:親和標(biāo)記試劑。 ES的解離常數(shù)(底物常數(shù))
? Km :是當(dāng)酶反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時的底物濃度。
?Vmax:酶完全被底物飽和是的最大反應(yīng)速率。
?簡答
1.舉兩個例子說明抑制劑在藥物開發(fā)中的應(yīng)用?
答: 抑制劑分為可逆抑制劑和不可逆抑制劑:
不可以抑制劑:青霉素是一種不可逆抑制劑,青霉素可以與糖肽轉(zhuǎn)肽酶活性部位絲氨酸羥基共價結(jié)合,使酶失活,而糖肽轉(zhuǎn)肽酶是細(xì)胞壁合成中使聚肽糖鏈交聯(lián)。一旦酶失活,細(xì)菌細(xì)胞壁合成受阻,細(xì)菌生長被損害,因此青霉素可以起到抗菌作用。
可逆抑制劑:磺胺藥是通過干擾敏感菌的葉酸代謝而抑制其生長繁殖的,對磺胺類藥敏感的細(xì)菌在生長繁殖過程中,不能直接從生長環(huán)境中利用外援葉酸,而是利用對氨基苯甲酸(PABA)喋啶和谷氨酸,在二氫葉酸合成酶的催化下合成二氫葉酸的,再經(jīng)二氫葉酸還原酶還原為四氫葉酸是一碳單位轉(zhuǎn)移酶的輔酶,參與嘌呤、嘧啶、氨基酸的合成,磺胺類藥物的化學(xué)結(jié)構(gòu)與PABA競爭二氫葉酸合成酶,抑制二氫葉酸的形成,或者形成以磺胺代替PABA的偽葉酸,最終使核酸合成受阻,阻止細(xì)菌生長繁殖,高等動植物能夠利用外源葉酸,所以代謝不影響。
2.可逆抑制作用分為哪幾種,每一種的動力學(xué)特征有何不同?
答:競爭性抑制:有些抑制劑和底物結(jié)構(gòu)極為相似,可和底物競相與酶結(jié)合,當(dāng)抑制劑與酶結(jié)合后,就妨礙了底物與酶的結(jié)合,減少了酶的作用機(jī)會,因而降低了酶的活力。這種抑制作用叫競爭性抑制作用。
常見的競爭性抑制劑 如對氨基苯磺酰胺(磺胺藥)


非競爭性抑制


·?反競爭性抑制



3.什么是米氏方程,米氏常數(shù),米氏常數(shù)與酶和底物親和力的關(guān)系,如何計算米氏常數(shù)和最大反應(yīng)速度。
反應(yīng)速度和底物濃度關(guān)系的數(shù)學(xué)方程式---米式方程

V:某一底物濃度時的反應(yīng)速度; Vmax:最大反應(yīng)速度??
[S]:底物濃度Km;? Km值是當(dāng)酶反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時的底物濃度。其單位是底物濃度的單位,一般用mol/L或mmol/L表示。
米氏常數(shù)(Michaelis constant):Km是酶的特征常數(shù),它與酶反應(yīng)性質(zhì)有關(guān),它是在特定的底物、pH、溫度、離子強(qiáng)度等條件下,該酶反應(yīng)速度常數(shù)kl,k﹣l,k2的函數(shù)。如果一種酶有幾種底物時,則對每種底物各有一特定Km值,其中Km值最小的底物稱為該酶的最適底物或天然底物。因此Km可作為鑒別酶的一種手段。
(2)當(dāng)酶促反應(yīng)處于υ═ 1/2Vmax 時,Km ═[S]??梢?,Km的物理意義是當(dāng)酶反應(yīng)速度達(dá)到最大反應(yīng)速度一半時的底物濃度。Km的單位與底物濃度一樣,范圍一般在10–7mol/L~10–1mol/L。
(3)由于ES →E + P的反應(yīng)為限速步驟,kl 和 k-1>> k2,結(jié)果Km≈Ks,Km可看作是復(fù)合物ES的解離常數(shù)。因此1/Km近似地表示酶對底物親和力的大小,1/ Km值越大,表明酶對底物的親和力強(qiáng),因為1/ Km越大,Km越小,達(dá)到最大反應(yīng)速度一半所需要的底物濃度也就愈小。反之,1/ Km值越小,表明酶對底物的親和力弱。
(4)Km是代謝物對多種代謝途徑選擇取向的決定因素之一。在生物體內(nèi),一個代謝物如果可以進(jìn)入不同的代謝途徑,哪一個代謝途徑反應(yīng)的第一個酶Km最小,那么該代謝物就優(yōu)先進(jìn)入那一個途徑。
(5)對于Vmax= k2[ES]又可以表達(dá)為Vmax= kcat[Et]。kcat代表單位時間內(nèi)每個酶分子將底物分子轉(zhuǎn)換成產(chǎn)物的最大值,kcat稱為轉(zhuǎn)換數(shù)。對于大多數(shù)酶而言,轉(zhuǎn)換數(shù)在每秒1~104范圍內(nèi)。如果一個酶有兩個競爭性底物,kcat / Km比值可衡量酶對底物的專一性。比值越大,專一性越強(qiáng)。
(6)在已知Km值的情況下,應(yīng)用米氏方程即可計算任意底物濃度時的反應(yīng)速度,或任何反應(yīng)速度下的底物濃度。
當(dāng) V=1/2 VMAX? Km=[S] Km單位為濃度單位。
? 米氏常數(shù)是酶的特征物理常數(shù)。一個酶在一定條件下,對某一底物的Km為一定值,故通過測定Km的數(shù)值,可鑒別酶。
? 如果一個酶可催化幾個底物,對每個底物用一個Km。
? Km越小,酶對底物的親和力越大,反之已然。Km可表征酶對底物的親和力。

米氏常數(shù)的求法:
最常用的是Lineweaver–Burk的作圖法(雙倒數(shù)作圖法)

