臨近畢業(yè)季，是不是很多小伙伴一定很想發(fā)表一篇屬于自己的SCI，但是卻苦于沒有實驗環(huán)境和樣本？選擇臨床數(shù)據(jù)庫是生信分析的基礎(chǔ)，對于臨床科研具有非常重要的作用。臨床數(shù)據(jù)庫包含了大量的患者信息和醫(yī)療數(shù)據(jù)，可以幫助臨床研究人員挖掘數(shù)據(jù)中的潛在規(guī)律和關(guān)聯(lián)關(guān)系，并提高醫(yī)學(xué)研究的效率和質(zhì)量。

通常情況下，生信文章只會引用一個數(shù)據(jù)庫，但今天布小谷就發(fā)現(xiàn)一篇簡短但性價比極高的文章，作者選擇了兩個數(shù)據(jù)庫，一個是大名鼎鼎的SEER數(shù)據(jù)庫，結(jié)合醫(yī)院JSPH數(shù)據(jù)庫，對疾病進(jìn)行了生存分析。結(jié)合兩個數(shù)據(jù)庫的好處有：1）如果在兩個數(shù)據(jù)庫中都有相同結(jié)果，那么增加了研究結(jié)果的說服力；2）兩個數(shù)據(jù)庫讓審稿人眼前一亮，增加了接收率。

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題目: 原發(fā)性肺淋巴上皮瘤樣癌的臨床病理特征及癌癥特異性預(yù)后：美國SEER數(shù)據(jù)庫與中國某醫(yī)院的人群研究

雜志：Front Oncol

影響因子：IF=5.738

發(fā)表時間：2023年5月

研究背景

肺癌是全球癌癥相關(guān)死亡的主要疾病，可大致分為非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）和小細(xì)胞肺癌（SCLC）。原發(fā)性肺淋巴上皮瘤樣癌（PPLELC）是一種罕見的組織學(xué)類型的非小細(xì)胞肺癌，占NSCLC的不到1%。目前，尚無公認(rèn)的PPLELC治療指南。

研究思路

在2000 年至 2015 年間SEER數(shù)據(jù)集確定了 PPLELC 患者 （n = 72），以及在 2014 年至 2020 年間從JSPH確定了 PPLELC 患者（n = 16）。所有診斷均經(jīng)病理檢查確診，并檢索和總結(jié)患者的臨床病理特征。使用Kaplan-Meier分析和對數(shù)秩檢驗進(jìn)行生存分析。使用Cox回歸風(fēng)險模型進(jìn)行多變量生存分析。

主要結(jié)果

1.SEER數(shù)據(jù)集中PPLELC的發(fā)病率

根據(jù)SEER數(shù)據(jù)集，2000-2015年期間有816436例確診肺癌病例。其中，0.065‰的白人患者、0.056‰的黑人患者、0.528‰的亞太島民（API）被診斷為PPLELC（表1）。這表明在API中，PPLELC亞型在肺癌中的比例更高。

2.PPLELC 病例的臨床和人口統(tǒng)計學(xué)特征

研究包括了 SEER 數(shù)據(jù)集中的 72 名患者和 JSPH 隊列中的 16 名患者。其中，兩個 PPLELC 隊列的中位診斷年齡均為 64 歲，范圍為 15 至 86 歲。女性和男性的發(fā)病率相似。右肺偏側(cè) (47/88, 53.4%) 的病例多于左肺 (39/88, 44.3%)。超過一半的病例被診斷為 TX/T1 期（55.7%），而 T2、T3 和 T4 期的比例分別為 26.1%、10.2% 和 8.0%。大多數(shù)病例（54/88，61.4%）淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈陰性，其余34例（38.6%）淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈陽性。上述呈陽性的34例中，N1期11例，N2期21例，N3期2例。88例中，69例（78.4%）行病灶切除術(shù)，16例（18.1%）行束流放療，40例（45.5%）行化療。在 JSPH 隊列中，只有兩例為 65歲或以上，與 SEER 數(shù)據(jù)集相比有顯著差異。有趣的是，43.8% (7/16) 的病例顯示腫瘤位于右肺中葉內(nèi)。相比之下，只有6.9%的 SEER 病例顯示了這個腫瘤位置，而且都是 API，證明這種差異似乎與種族有關(guān)。盡管 M1 期病例的百分比在 SEER 隊列和 JSPH 隊列中相當(dāng)，但治療選擇似乎不同。在 JSPH 隊列中，接受手術(shù)切除的病例更多（87.5% 對 75.0%），接受放療的病例更少（6.3% 對 20.8%）（表 2）。

3.PPLELC 病例中癌癥特異性生存率（CSS）的生存分析

截至追蹤期結(jié)束時，有24例因PPLELC死亡。1年、3年和5年癌癥特異性生存率（CSS）分別為90.8%、79.5%和72.6%（圖2A）。平均CSS時間為148.7±12.6個月。接下來，利用Kaplan-Meier生存分析，根據(jù)臨床和人口統(tǒng)計學(xué)特征將患者分為不同的亞組（圖2B-E）。KM曲線顯示，患者的M分期顯著影響PPLELC的CSS（圖2B）；M0期患者的5年CSS率為78.5%，M1期患者降至40.7%。此外，患者的N分期也影響預(yù)后（圖2C）；TNM III-IV期患者的預(yù)后始終優(yōu)于TNM I-II期患者（圖2D）；接受手術(shù)切除的患者的5年CSS率為78.8%，而未進(jìn)行手術(shù)干預(yù)的患者僅為48.7%（圖2E）。相比之下，其他因素似乎對PPLELC存活率沒有顯著影響。使用 Cox 回歸風(fēng)險模型對多個變量（年齡、性別、TNM分期、手術(shù)切除、放療和化療）進(jìn)行分析（表3），發(fā)現(xiàn)TNM分期是唯一對PPLELC生存有獨立預(yù)后影響的因素。

文章小結(jié)

研究對比了SEER數(shù)據(jù)集和JSPH數(shù)據(jù)集中PPLELC患者的臨床病理特征，當(dāng)前治療和預(yù)后。研究證明了PPLELC在亞洲人中發(fā)病率較高，預(yù)后良好；其中，TNM分期是PPLELC的獨立預(yù)后因素。文章分析思路雖然簡單，但是作者利用了SEER和JSPH兩個數(shù)據(jù)庫，增加了分析的可信度，兩個數(shù)據(jù)庫得出結(jié)果一致，也增加了結(jié)果的可靠性。內(nèi)容不多還能發(fā)到5分+，可見SEER真的是一個可參考的好方向。感興趣的小伙伴一定要碼??！