天然藥物分子的作用靶點發(fā)現(xiàn)方法學(xué)及案例分析——曾克武 北京大學(xué)天然藥物及仿生藥物

北京大學(xué)曾克武老師官網(wǎng)簡介:http://dnm.sps.bjmu.edu.cn/szdw_20180110150803713087/trywhxyjs_20180110150803713087/192684.htm
一、背景
1.天然產(chǎn)物很好:
青蒿素、砒霜、二甲雙胍(修飾山羊豆來源的山羊豆堿)、石杉堿甲(來源于蛇足草)、達(dá)菲(修飾八角茴香來源的莽草酸)
2.如何產(chǎn)生活性
產(chǎn)物活性分子與靶器官靶點結(jié)合發(fā)揮作用(化學(xué)生物學(xué)
二、實驗室方法(其實驗室2012年開始)
1.生物素標(biāo)記法。
標(biāo)記天然分子
從細(xì)胞裂解液中獲取結(jié)合蛋白,結(jié)合高分辨質(zhì)譜鑒定靶標(biāo)蛋白
2.基于環(huán)氧基標(biāo)記策略(類似生物素標(biāo)記)
老師說是因為他結(jié)構(gòu)復(fù)雜,生物素掛不上去
3.基于蛋白微陣列技術(shù)
前面兩種方法基于組織細(xì)胞裂解液
豐度低的轉(zhuǎn)錄因子,蛋白可以通過此法改善。

4.基于點擊化學(xué)的細(xì)胞胞內(nèi)靶點鑒定
活性分子結(jié)合某特定標(biāo)簽,在胞內(nèi)和靶標(biāo)結(jié)合,照射UV后能形成穩(wěn)定復(fù)合物。(有一篇類似工作港大孫紅哲教授團隊在nature communication上確定了鉻元素結(jié)合蛋白)
5.****非標(biāo)記技術(shù)。不對藥物分子修飾
一類技術(shù),在這僅介紹一些。
確定結(jié)合位點-點突變驗證-分子互作研究
6.****多組分,中藥復(fù)雜成分
1.磁性微球結(jié)合二硫甲酮,UV下活化,和天然產(chǎn)物分子無差別光交聯(lián)→中藥芯片,在細(xì)胞裂解液中吊
7.從小分子到大分子
三、答疑
- 方法只是普篩,只關(guān)心該技術(shù)能篩到什么,至于全不全,是不是關(guān)鍵的核心分子,或者篩不到,就換一個植物再研究,反正我國中草藥多。
- ?藥物分子和靶標(biāo)共晶很重要,可以和結(jié)構(gòu)生物學(xué)實驗室合作48:37?
- 有商業(yè)化探針購買
- 生物素是最可靠的,有些方法學(xué)實驗室他有很多探針僅用于發(fā)表論文,生物素穩(wěn)定可靠公認(rèn),點擊化學(xué)近年很火(上文提到)。
- 很多藥物多靶標(biāo)。只能多方法共同確認(rèn)。如何通過技術(shù)方法區(qū)分結(jié)合蛋白與關(guān)鍵靶標(biāo)
- 如果不能確認(rèn)功能,如抗炎,抗腫瘤。從傳統(tǒng)角度來講,有些中藥抗疲勞,很宏觀的藥效,可以研究肌肉組織試圖找靶點;補脾益氣-消化道。
- 和第一個問題差不多。比如人參和全身多組織作用
- 芯片技術(shù)很成熟,可以直接購買。
工作出色,工作量大,希望大家有條件可以多關(guān)注他們課題組的文章(雖然我沒在知網(wǎng)上找到他指導(dǎo)的學(xué)位論文,北大好像自己數(shù)據(jù)庫)