廣泛的耐藥性已經(jīng)成為全球衛(wèi)生保健的關(guān)鍵問(wèn)題，其中腫瘤耐藥也一直是國(guó)自然熱門(mén)課題，所以一些整理耐藥信息的數(shù)據(jù)庫(kù)應(yīng)運(yùn)而生···

目前已經(jīng)開(kāi)發(fā)了一些耐藥相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)，但都是針對(duì)某些疾病類(lèi)別，比如癌癥（如CancerDR和KinaseMD）、病毒感染（如Stanford HIV數(shù)據(jù)庫(kù)和HBVdb）、細(xì)菌感染（如CARD和MEGARes）以及真菌感染（如MARDy）。然而，出現(xiàn)耐藥性的疾病遠(yuǎn)不止癌癥/感染，所以迫切需要建立一個(gè)涵蓋各種疾病類(lèi)別和不同類(lèi)型的機(jī)制的綜合性耐藥數(shù)據(jù)庫(kù)。

科研的終極目標(biāo)就是應(yīng)用，浙大朱峰教授團(tuán)隊(duì)在Nucleic Acids Research上發(fā)布了全球首個(gè)綜合耐藥性數(shù)據(jù)庫(kù)DRESIS。

數(shù)據(jù)庫(kù)可免費(fèi)使用，網(wǎng)址：http://dresis.idrblab.net/，跟著布小谷一起來(lái)看看吧！

數(shù)據(jù)庫(kù)概況

DRESIS作為全球首個(gè)綜合耐藥性數(shù)據(jù)庫(kù)，首次系統(tǒng)地提供了所有六種類(lèi)型的耐藥分子機(jī)制，覆蓋了現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)中最廣泛的疾病，并描述了超過(guò)20000種藥物的臨床/實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的耐藥數(shù)據(jù)。

DRESIS數(shù)據(jù)庫(kù)包含6種耐藥分子機(jī)制：

i.藥物治療靶點(diǎn)的異常(ADTT)

ii.藥物攝取和藥物排出的不規(guī)則(IDUE)

iii.結(jié)構(gòu)修飾導(dǎo)致的藥物失活(DISM)

iv.DNA、RNA和蛋白質(zhì)的表觀遺傳改變(EADR)

v.促生存途徑的異常激活(UAPP)

vi.疾病微環(huán)境的調(diào)節(jié)(RTDM)

數(shù)據(jù)庫(kù)收錄信息

數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了超過(guò)20 000種具有臨床/實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證耐藥性信息的藥物（包括816個(gè)FDA批準(zhǔn)的藥物、336種臨床前/臨床試驗(yàn)藥物和19675種研究藥物），對(duì)應(yīng)395種耐藥疾病（其中有232種(58.7%)屬于癌癥或感染），以及2197個(gè)關(guān)鍵耐藥分子的分子機(jī)制，并分析了耐藥相關(guān)分子的疾病特異性和組織特異性。

數(shù)據(jù)庫(kù)檢索結(jié)果展示

1)藥物的耐藥性信息的詳細(xì)描述

數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)地提供了每種藥物的耐藥性信息的詳細(xì)描述，以化療藥物“多柔比星”為例，主要信息包括：藥物名稱(chēng)、藥物同義詞、疾病適應(yīng)癥(以及藥物的相應(yīng)臨床狀態(tài))、藥物結(jié)構(gòu)(可下載2D和3D格式)、藥物靶點(diǎn)，與其他分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的外部鏈接（如PubChem），以及已報(bào)告對(duì)該藥物具有耐藥性的疾病列表。

2)藥物耐藥機(jī)制信息

DRESIS中繪制了一個(gè)交互式圖表以展示藥物、疾病和機(jī)制之間的相互作用。藥物被放置在中間，并被各種類(lèi)型的機(jī)制所包圍，各種疾病類(lèi)別與每種機(jī)制類(lèi)型相關(guān)聯(lián)，而每種機(jī)制類(lèi)型又與關(guān)鍵的抗性分子相關(guān)聯(lián)。以“多柔比星”為例，交互圖顯示它有六種耐藥機(jī)制，在每個(gè)機(jī)制下顯示相應(yīng)的抗性疾病，并為相應(yīng)的疾病提供關(guān)鍵的抗性分子。

此外，數(shù)據(jù)庫(kù)也可以根據(jù)疾病類(lèi)別分類(lèi)的藥物的詳細(xì)耐藥機(jī)制，提供了關(guān)鍵耐藥分子、耐藥證據(jù)類(lèi)型和實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)的數(shù)據(jù)。共鑒定出2197個(gè)關(guān)鍵耐藥分子，針對(duì)關(guān)鍵耐藥分子，描述了它們?cè)谀退幖膊≈械淖兓?，以及不同?lèi)型的耐藥證據(jù)(臨床報(bào)告，由體內(nèi)模型驗(yàn)證或由細(xì)胞系實(shí)驗(yàn)確定)。還提供了各種實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)，包括多樣化的實(shí)驗(yàn)技術(shù)、數(shù)百種疾病細(xì)胞系和感染性菌株、數(shù)百種體內(nèi)模型以及在耐藥疾病中被調(diào)節(jié)的各種信號(hào)通路。

3)針對(duì)特定疾病的耐藥藥物的全景圖

數(shù)據(jù)庫(kù)提供針對(duì)特定疾病的藥物和關(guān)鍵耐藥分子的綜合列表。以“乳腺癌”為例，在縱軸上使用藥物id提供了耐藥藥物的完整列表，在橫軸上使用相應(yīng)的分子id顯示了關(guān)鍵耐藥分子列表。由于乳腺癌(以及許多其他疾病)中涉及大量藥物和關(guān)鍵分子，DRESIS通過(guò)拖動(dòng)圖中所示交互圖底部和右側(cè)的滑塊，實(shí)現(xiàn)了整個(gè)全景的可視化圖。圖中用不同顏色的圓圈(中間有字母“R”)表示了不同類(lèi)型的抗性機(jī)制，將鼠標(biāo)放在任意一個(gè)圓圈上，可以交互查看機(jī)制類(lèi)型、耐藥藥物和關(guān)鍵分子的詳細(xì)信息。

除了全景圖之外，詳細(xì)的耐藥機(jī)制也在DRESIS的疾病網(wǎng)頁(yè)中有明確的描述，包括關(guān)鍵分子的數(shù)據(jù)、耐藥性證據(jù)的類(lèi)型和實(shí)驗(yàn)細(xì)節(jié)，信息與第2步中一致。

4)耐藥分子的疾病/組織特異性豐度

DRESIS提供了關(guān)鍵抗性分子的疾病和組織特異性表達(dá)豐度。基于TCGA和GTEx數(shù)據(jù)庫(kù)分析了疾病患者和健康個(gè)體之間這些關(guān)鍵抗性ncRNAs的豐度差異，以小提琴圖形式展示?；?/span>GEO和GTEx數(shù)據(jù)庫(kù)分析不同組織之間關(guān)鍵抗性分子的組織特異性豐度變化，以柱狀圖形式展示。

數(shù)據(jù)下載

用戶(hù)可以從數(shù)據(jù)庫(kù)“Download”頁(yè)面免費(fèi)下載數(shù)據(jù)庫(kù)完整數(shù)據(jù)。

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參考文獻(xiàn)

Sun X, Zhang Y, Li H, et al. DRESIS: the first comprehensive landscape of drug resistance information. Nucleic Acids Res. 2023;51(D1):D1263-D1275. doi:10.1093/nar/gkac812