實驗送樣、數(shù)據(jù)分析樣品、組名命名規(guī)范
1，樣品名唯一性
不管是自己做實驗還是外送公司做實驗，同一批送的樣品，樣品名字要唯一，不能有重復。
錯誤示例（×）：a1，a2，a3，a4，a5，a5
正確示例（√）：a1，a2，a3，a4，a5，a6
錯誤說明：錯誤示例中有兩個a5，如果我們要對a5樣品進行PCR，那么到底是處理第1個a5，還是處理第2個a5？
2，樣品名要有意義，簡單、易讀
樣品名要根據(jù)實際樣品屬性進行命名。
錯誤示例（×）：a，b，c，d，e，f
正確示例（√）：con_1，con_2，con_3，exp_1，exp_2，exp_3
錯誤說明：遇見這種純字母的樣品名，如果沒有額外的記錄，那么1個月以后，連你自己都無法區(qū)分你的樣品了。并且reviewer看到這種樣品名后，也很難知道你哪些是對照，哪些是實驗，第一印象就不好。
3，樣品名不能過長或過短，盡量保持均衡
樣品名長度無論對于實驗人員還是分析人員都是一種挑戰(zhàn)。
如果樣品名過長：
1）在錄入計算機時會更容易出錯(因為需要打的字更多)。
2）儀器或者軟件識別不了很長的名字，例如如果以樣品名作為excel的sheet名，那么長度不能超過31，超過就會截斷。
3）出圖的時候，長的樣品名會影響圖的布局或者拼圖，名字可能會被截斷，或者出現(xiàn)圖被縮小或者看不見的情況。想象一下你的樣品名長度為256個字符，那么這個名字在任何圖上都會出問題。
4）同一批樣品名字有長有短，影響視覺效果。例如做熱圖時，名字有的很長，有的很短，短的名字下面會出現(xiàn)大片空白區(qū)域。
圖1. 非常長的名字影響圖的布局和美觀度
錯誤示例（×）：human_tissue_control_sample_24_hour_BCG_1, human_tissue_control_sample_24_hour_BCG_24，樣品名盡量使用英文體系名字
5，樣品名縮寫要遵循常規(guī)設定
6，樣品名區(qū)分大小寫
7，盡量避免同時使用1、l和I；以及0和O等
8，盡量避免使用純數(shù)字
9，盡量避免使用特殊符號
圖3. 特殊符號
10，盡量避免使用系統(tǒng)或者程序內(nèi)置關(guān)鍵詞
錯誤示例（×）：con
正確示例（√）：ctrl
錯誤說明：由于windows系統(tǒng)中con為系統(tǒng)關(guān)鍵詞，所以我們不能將我們的樣品名寫作con，因為這個名字的文件根本沒法在windows系統(tǒng)上創(chuàng)建，會報“指定的設備名無效”錯誤。
圖4. 常見內(nèi)置關(guān)鍵詞（避免使用）
11，注意區(qū)分6和9、Z和2
特別對于手寫的樣品名，如果將6倒過來看就變成9了（圖5）；而2和Z的手寫體也較難區(qū)分。
圖5. 6還是9？此處請將手機倒置查看
正確的一般是在數(shù)字下面加一橫線，在Z中間加個小橫線，寫成?。
12，樣品名不能帶空格
錯誤示例（×）：sample 1
正確示例（√）：sample_1
一般編程語言都是不允許使用帶有空格的變量名的，因此盡量避免在樣品名中使用空格，可以使用下劃線“_”代替。
13，命名方式一致性
錯誤示例（×）：s1，sample2，sample_3,sample-4
正確示例（√）：s1，s2，s3，t4，t5，t6
錯誤說明：錯誤示例中樣品名的規(guī)則很亂，讓人看著不舒服。
14，比較時組名順序
錯誤示例（×）：control vs experiment
正確示例（√）：experiment vs control
一般我們比較的時候都是實驗組vs對照組，因此，請將實驗組寫在前面，對照組寫在后邊。否則比較的時候，有可能會比反（也就是上調(diào)變下調(diào)，下調(diào)變上調(diào)）。
圖6. 組名順序不一樣，上下調(diào)反了
樣本名、組名不僅是給自己看的，也是給實驗人員，數(shù)據(jù)分析人員，reviewer看的，因此要認真對待自己的樣品名，這也是一個優(yōu)秀科研人員的基本素養(yǎng)。
附：R變量命名規(guī)則
1）變量名是區(qū)分大小寫的，比如：變量y和變量Y兩者是不同變量；
2）變量名的首字母不能是數(shù)字和符號，比如：2y和_xy都不能作為變量名；
3）變量名不能包含空格號，比如：my name不能作為變量名，可以用my.name或者my_name替代。
微生信助力高分文章，用戶62000+，引用820+
