科研代碼分享|生物信息分析之SCI熱門圖表—KM曲線和tROC曲線
科研有捷徑,輸入代碼,一鍵獲取科研成果!就是這么省事,來具體看下有多方便!
搜索http://985.so/a9kb查看全部代碼(目前共計(jì)50+持續(xù)新增中),也可以點(diǎn)擊右側(cè)【目錄】,可以看到更多有趣的代碼
真香提示:文末可以知道如何獲取代碼~
在生物信息學(xué)分析中,對(duì)于表達(dá)譜數(shù)據(jù),我們經(jīng)常需要篩選與腫瘤預(yù)后顯著相關(guān)的因子。而通過KM曲線和tROC曲線可以直觀的觀察到不同分組或者因子與生存預(yù)后的關(guān)聯(lián),因此是做腫瘤預(yù)后評(píng)估中必備的可視化方式之一。?
利用純生物信息學(xué)分析發(fā)表高分SCI,KM曲線和tROC曲線是預(yù)后分析中必不可少的可視化展示方式。如下圖。這是來自Frontiers in Immunology的一篇IF > 7分生信文章。


但是具體要如何實(shí)現(xiàn)??? 今天,小編以代碼提供的數(shù)據(jù)為例進(jìn)行說明。
碼具體包括:
Step1 輸入數(shù)據(jù)(第一列是樣本,第二列是生存時(shí)間,第三列是生存狀態(tài),第四列是評(píng)分,第五列是分組。其中生存時(shí)間和生存狀態(tài)為重要信息)
Step2 R代碼繪制KM曲線和tROC曲線
下面是代碼中附帶數(shù)據(jù)繪制的KM曲線圖

下面是代碼中附帶數(shù)據(jù)繪制的tROC曲線圖

神奇吧,就是如此簡(jiǎn)單,我們用的都是入門級(jí)函數(shù),稍微懂點(diǎn)R語言就能實(shí)現(xiàn)。
如需代碼及示例數(shù)據(jù)等文件,請(qǐng)掃碼聊天框回復(fù) “B18”領(lǐng)??!
