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“百益之果”不同產(chǎn)地果實(shí)形態(tài)及活性成分的差異性研究-代謝組學(xué)

2022-10-02 09:06 作者:百趣代謝組學(xué)  | 我要投稿

“百益之果”皺皮木瓜在不同產(chǎn)地果實(shí)形態(tài)及活性成分的差異性研究-代謝組學(xué)解讀

文章標(biāo)題:Comparative Metabolomics Study of Chaenomeles speciosa(Sweet) Nakai from Different Geographical Regions

發(fā)表期刊:FOODS

發(fā)表時(shí)間:2022.3.31

影響因子:4.35

合作客戶:西南大學(xué)

百趣生物提供服務(wù):植物廣靶代謝組學(xué)檢測(cè)服務(wù)


研究背景

百趣代謝組學(xué)解讀,皺皮木瓜作為一種可鮮食的水果備受人們的喜愛,在我國(guó)的云南、貴州、山東、四川、浙江和重慶,湖北和安徽等地廣泛栽培。皺皮木瓜果實(shí)中含有多種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)和活性成分,在抗癌、抗氧化、抗病毒、抗菌性能、抗炎等方面有著一定的作用。本文選取了8個(gè)皺皮木瓜的主要產(chǎn)地進(jìn)行研究,系統(tǒng)的論證了生態(tài)環(huán)境因素對(duì)皺皮木瓜果實(shí)代謝產(chǎn)物的影響。


01.研究?jī)?nèi)容

地理區(qū)域氣候條件對(duì)果實(shí)大小的影響

百趣代謝組學(xué)解讀,在本研究中,收集了8個(gè)主要產(chǎn)地YN(中國(guó)云南臨滄馬臺(tái)鄉(xiāng))、GZ(中國(guó)貴州鎮(zhèn)安桐梓坪)、CQ(中國(guó)重慶綦江打通)、ZJ(中國(guó)浙江淳安左口)、HB(中國(guó)湖北長(zhǎng)陽土家族自治縣榔坪)、AH(中國(guó)安徽宣城新田)、SC(四川達(dá)州復(fù)興)和SD(山東臨沂湯河)。圖1A為本研究的8個(gè)聚集點(diǎn),圖1B為8個(gè)產(chǎn)區(qū)的經(jīng)緯度,圖1C,D為各氣候參數(shù)。SD是八個(gè)產(chǎn)地中氣溫最低的地區(qū),海拔高度HB最高,YN次之,SD和AH最低。YN年降雨量最高,SD年光照時(shí)間最長(zhǎng),年降雨量最少。廣州和CQ的年降水量和光照時(shí)數(shù)均低于ZJ、HB、AH和SC。從總體上看,8個(gè)不同果區(qū)的氣候條件存在明顯差異。

對(duì)商品成熟期的果實(shí)樣本進(jìn)行研究,表1是方差分析和Duncan檢驗(yàn)的結(jié)果。從整體上看,SC和GZ產(chǎn)區(qū)的果實(shí)較其他地區(qū)明顯較厚、較長(zhǎng)、較重,其中AH產(chǎn)區(qū)的微型果實(shí)最多。不同品種的果實(shí)形態(tài)差異明顯,特別是GZ、SC和AH。以上結(jié)果表明,不同地理區(qū)域的氣候條件對(duì)果實(shí)大小有重要影響。

圖1. 采集的果實(shí)樣本的地理分布和氣候條件,(A)樣品生產(chǎn)地點(diǎn),(B)八個(gè)區(qū)域坐標(biāo),(C)年降雨量(mm)和年日照時(shí)數(shù)(h),(D)年平均溫度(?C)和海拔高度(m)

表1. 不同地區(qū)果實(shí)表觀差異

02.不同地區(qū)果實(shí)代謝物檢測(cè)分析

為進(jìn)一步了解不同產(chǎn)地果實(shí)的代謝產(chǎn)物差異,采用UPLC-QqQ-MS/MS對(duì)8個(gè)產(chǎn)地的鮮果進(jìn)行了檢測(cè)分析,共鑒定到了974種代謝物,并將其分為19類(圖2A/B),包括163種類黃酮、119種生物堿、118種萜、83種酚、58種氨基酸及其衍生物、50種有機(jī)酸及其衍生物、47種脂類、47種類固醇及其衍生物、40種碳水化合物和醇、39種苯丙素、38種核苷酸及其衍生物、30種香豆素、20種木脂素、17種苯及其取代衍生物、15種口山酮、15種維生素及其衍生物、14種醌、13種植物激素和48種其他類代謝物。百趣代謝組學(xué)解讀。

圖2. 不同地區(qū)果實(shí)代謝物聚類熱圖、餅圖、HCA圖和PCA圖展示

03.TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中識(shí)別有效代謝物

我們將鑒定到的974個(gè)代謝物與TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行匹配,以確定與抗病和藥物靶點(diǎn)相關(guān)的有效成分,對(duì)匹配到的有效成分進(jìn)行分類統(tǒng)計(jì),并對(duì)疾病和藥物靶點(diǎn)分別進(jìn)行了相關(guān)性作圖分析。如圖3所示,黃酮類化合物在與疾病和藥物靶點(diǎn)相關(guān)的代謝產(chǎn)物中含量最高,相關(guān)性也最顯著。此外,木脂素、苯丙素和生物堿類物質(zhì)也與疾病或靶點(diǎn)顯著相關(guān)。為了進(jìn)一步尋找潛在的關(guān)鍵活性代謝物,以口服利用度(OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18作為篩選標(biāo)準(zhǔn),發(fā)現(xiàn)黃酮類化合物是潛在的主要抗病成分。百趣代謝組學(xué)解讀。

圖3.?(A)19種化合物與326種相關(guān)疾病代謝物的Pearson相關(guān)性分析、(B) 19種化合物類與336個(gè)相關(guān)靶點(diǎn)代謝物的Pearson相關(guān)性分析

*不同類別與疾病或目標(biāo)有顯著相關(guān)性,p < 0.05

**不同類型與疾病或靶標(biāo)顯著相關(guān),p < 0.01

***不同類別與疾病或靶標(biāo)顯著相關(guān),p < 0.001

04.不同地區(qū)氣候、主要代謝物和差異代謝物的相關(guān)性研究

在研究中我們還發(fā)現(xiàn)經(jīng)緯度與黃酮類代謝產(chǎn)物含量存在較強(qiáng)的負(fù)相關(guān)關(guān)系。緯度越高(?N),類黃酮含量越低,如表2所示。為了進(jìn)一步分析尋找不同產(chǎn)地木瓜果實(shí)代謝物的差別,我們對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行了可視化作圖分析,如圖3所示,對(duì)篩選到的548個(gè)差異代謝物的種類按數(shù)量進(jìn)行排序(圖4A),并將其映射到KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中,選出差異顯著性前25的通路進(jìn)行繪制(圖4B),發(fā)現(xiàn)黃酮類化合物在木瓜果實(shí)的代謝中起著主要作用。百趣代謝組學(xué)解讀。

表2. 氣候特征與主要大類代謝物的相關(guān)性分析

圖4. 548個(gè)差異代謝物分析,(A) C. speciosa 548個(gè)差異代謝物的分類,(B) 548個(gè)差異代謝物和前25個(gè)通路的KEGG富集分析,(C)選擇潛在的標(biāo)記代謝物,使每個(gè)區(qū)域的標(biāo)記代謝物可視化
05.核心區(qū)的確定及與其他區(qū)域的比較

經(jīng)過前期研究分析,我們發(fā)現(xiàn)YN與其他產(chǎn)地差異顯著。我們將YN作為一個(gè)核心群體與其他群體進(jìn)行比較。如圖5A所示,繪制不同地區(qū)差異代謝物的集合圖(圖5A),最終選擇25個(gè)共同的差異代謝物作為YN的關(guān)鍵代謝物,并進(jìn)行層次聚類圖的繪制(圖5C)。此外,我們對(duì)YN地區(qū)果實(shí)差異代謝物進(jìn)行了富集通路分析表明黃酮類化合物的生物合成、甾體激素的生物合成、苯丙素的生物合成和生物堿的生物合成途徑是YN區(qū)果實(shí)代謝物主要的富集途徑(圖5D)。百趣代謝組學(xué)解讀。

圖5. YN與其他區(qū)域差異代謝物的比較,(A)常用的代謝物用倒置圖表示,(B)共有代謝物中含量最高的5種代謝物,(C) 25種常見代謝物的熱圖,(D) YN中含量較高的差異代謝物KEGG富集分析


結(jié)論

百趣代謝組學(xué)解讀,在本研究中,我們對(duì)8個(gè)地區(qū)皺皮木瓜果實(shí)的代謝物進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)不同地區(qū)皺皮木瓜果實(shí)的代謝產(chǎn)物含量存在差異,表明了生態(tài)因素對(duì)皺皮木瓜果實(shí)的代謝有一定的影響,在8個(gè)地區(qū)中,YN地區(qū)和其他地區(qū)的代謝產(chǎn)物有著較為明顯的差異。此外,本研究還將皺皮木瓜的代謝物和TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)相結(jié)合,對(duì)數(shù)據(jù)源等重要信息進(jìn)行了整理總結(jié),以O(shè)B≥30%、DL≥0.18為篩選標(biāo)準(zhǔn),共篩選出101個(gè)潛在的關(guān)鍵代謝產(chǎn)物,為其活性成分在治療人類疾病方面提供了一定的參考依據(jù)。

文/阿趣代謝組學(xué)



“百益之果”不同產(chǎn)地果實(shí)形態(tài)及活性成分的差異性研究-代謝組學(xué)的評(píng)論 (共 條)

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