一軟件包介紹

密度圖是一種展示與數(shù)據(jù)組對應(yīng)的邊界或閾對象的可視化方式。簡而言之呢，就是展示不同組別數(shù)據(jù)間的邊界以及相互之間的比例。是一種非常形象的展示數(shù)據(jù)分布的方式（當(dāng)然，通過條形圖、折線圖等也可展示，只是不那么美觀）。

二 python包使用

1 加載對應(yīng)的python包

2?加載數(shù)據(jù)集
之后，加載數(shù)據(jù)集。這里需要提到的是我們在做推文數(shù)據(jù)展示的時候會苦惱數(shù)據(jù)從何而來。創(chuàng)造數(shù)據(jù)吧，絞盡腦汁也不一定有好的數(shù)據(jù)，因此如果用自己論文的數(shù)據(jù)，就...(論文想不想發(fā)了，還畢不畢業(yè)了)。如果用別人論文的數(shù)據(jù)，又有侵權(quán)風(fēng)險。因此，最好用的方式就是使用公共數(shù)據(jù)集，不僅數(shù)據(jù)合理，而且可視化的效果也好。

PS:因為默認(rèn)情況下seaborn包繪圖會有背景和網(wǎng)格，這里需要通過set_style實現(xiàn)去除的效果，各位讀者可以按照個人需求增減

其中tips的文件數(shù)據(jù)為

其中g(shù)eyser的文件數(shù)據(jù)為

隨后，我們開始各種類型密度圖的繪制

3 密度圖繪制
3.1 第一種密度圖（一維）

首先，直接代碼貼上

本段代碼共有五句話：1定義輸出圖片名稱；2定義圖片大??；3調(diào)用包進行繪圖；4將圖片保存；5關(guān)閉繪圖窗口。

其中sns.kdeplot參數(shù)的意思分別是：

data：數(shù)據(jù)集

x：數(shù)據(jù)集中用于繪繪圖的列數(shù)據(jù)

hue：映射以確定繪圖元素顏色的語義變量，即元素分類列

multiple：密度圖多個元素的繪圖方法

隨后，一鍵出圖。

3.2 第二種密度圖（一維）

代碼意思與第一種密度相差不大，重點再與第三句參數(shù)的意思。

fill：如果為真，則填充單變量密度曲線下面積。如果為假，則僅有線條。

common_norm：如果為真，則按觀察次數(shù)縮放每個條件密度，使所有密度下的總面積總和為1。否則，獨立地歸一化每個密度。

palette：用于選擇映射色調(diào)語義時使用的顏色的方法。字符串值被傳遞到color_palete。如果是列表或dict值表示分類映射，而colormap對象表示數(shù)字映射。這里我們的size是數(shù)字，應(yīng)該屬于后者，即列表表示分類映射。

alpha：顏色的透明度。

linewidth：每個曲線最外圍的線條長度。

3.3 第三種密度圖（二維）

之前的3.1和3.2都是一維數(shù)據(jù)進行密度圖展示，這里我們也提供了另一種方式用于二維數(shù)據(jù)的密度展示。

3.4 第四種密度圖（二維）

3.3圖雖然能夠展現(xiàn)二維數(shù)據(jù)的密度分布，但是太不夠直觀了，所以這里我們提供一種方式將不同的密度通過顏色深淺進行展示?？梢钥闯鲋行膮^(qū)域的點密度最高。

3.5 第五種密度圖（二維）

這里的代碼新增了兩個參數(shù)，thresh和levels

thresh：繪制等高線的最低iso比例級別。當(dāng)級別為向量時忽略。僅與雙變量數(shù)據(jù)相關(guān)。

levels:?繪制等高線的等高線級別或值的數(shù)量。向量參數(shù)必須在[0,1]中具有遞增值。水平對應(yīng)于密度的iso比例：例如，20%的概率質(zhì)量將低于0.2繪制的等高線。僅與雙變量數(shù)據(jù)相關(guān)。

隨后，一鍵出圖。不得不說，這種圖片隱隱有那種通過望遠(yuǎn)鏡觀察宇宙中遙遠(yuǎn)雙子星系的趕腳。

三 慣例小結(jié)

實際上，數(shù)據(jù)的展示方式多種多樣。本推文所提供的密度圖展示方式，雖有其不合理之處，比如會降密度分布超出數(shù)據(jù)邊界，顯然是不合理的。但是，對于一些數(shù)據(jù)而言，該方法能夠很好的反應(yīng)數(shù)據(jù)的部分特征，則使用該方法也并無不可。其次，最近為啥更新的少了呢，因為懶了

。

Multi-omics Hammer軟件下載地址：

https://github.com/wangjun258/Multi-omics-Hammer

Multi-omics Visual軟件下載地址：https://github.com/wangjun258/Multi_omics_Visual/releases/tag/Multi_omics_Visual_v1.03

PS：因為本軟件是用python腳本撰寫，調(diào)用了部分依賴包，用戶首次使用需要安裝python以及對應(yīng)的包，安裝之后便可永久使用。

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另外，怎么說呢，投幣也可，不強求，但奢求。