干貨分享 | 一文了解多重擴(kuò)增子測序
擴(kuò)增子測序是一種高靶向性方法,用于分析特定基因組區(qū)域中的基因變異。擴(kuò)增子測序主要包括16S rDNA測序、18S rDNA測序、ITS測序及目標(biāo)區(qū)域擴(kuò)增子測序等。
ABclonal早期推出一款適用于多樣品的16S 擴(kuò)增子測序,詳見推文。ABclonal作為酶原料公司,正在積極關(guān)注多重擴(kuò)增酶的應(yīng)用。
多重擴(kuò)增與普通擴(kuò)增的差異
多重擴(kuò)增子測序即針對感興趣的目標(biāo)區(qū)域,設(shè)計多重PCR引物進(jìn)行擴(kuò)增富集并進(jìn)行測序的技術(shù)。通常適用于檢測幾十到幾千個位點,或幾十kb以下的區(qū)域。
建庫流程
多重擴(kuò)增子測序的優(yōu)勢
多重擴(kuò)增子應(yīng)用領(lǐng)域
擴(kuò)增子捕獲測序作為全基因組測序的補(bǔ)充技術(shù)是非常有用的,它大大簡化了實驗流程和分析目標(biāo)。該技術(shù)已被證明是一個快速、有效的技術(shù),并在新一代高通量測序中發(fā)揮獨特之處,已經(jīng)產(chǎn)生了許多令人興奮的新發(fā)現(xiàn),應(yīng)用領(lǐng)域也越來越廣泛。
多重PCR的延伸關(guān)聯(lián)技術(shù)
ABclonal相關(guān)產(chǎn)品
多重 PCR (Multiplex polymerase chain reaction,MPCR)因在同一體系里加入多對引物合成多對擴(kuò)增子,易發(fā)生引物間及擴(kuò)增子間的串?dāng)_,故需要對體系進(jìn)行優(yōu)化,否則會造成檢測結(jié)果的不準(zhǔn)確。
ABclonal有著豐富的聚合酶庫,及體系優(yōu)化的經(jīng)驗,推出了相關(guān)系列產(chǎn)品。
一款基于新一代熱啟動高保真聚合酶Gloria Nova 聚合酶而開發(fā)的擴(kuò)增試劑,具有高保真性和優(yōu)異的擴(kuò)增性能,同時耐受尿嘧啶,具有3′-5′外切酶活性。
針對多重PCR擴(kuò)增進(jìn)行了定向優(yōu)化,適用于10~100ng起始量的各種gDNA、FFPE、cfDNA模板。優(yōu)化后的擴(kuò)增試劑中含有反應(yīng)所需的dNTPs、鎂離子和反應(yīng)緩沖buffer,可以覆蓋寬泛的GC區(qū)間與引物Tm值。
含有多重PCR專用熱啟動DNA聚合酶(Multiplex PCR Enzymes),具有優(yōu)異的擴(kuò)增性能,同時耐受尿嘧啶;延伸速率1 kb/min;
本試劑盒提供深度優(yōu)化的專用緩沖液2.5X Multiplex PCR Buffer,能夠在默認(rèn)條件下穩(wěn)定、高效地完成絕大多數(shù)多重PCR檢測,適用范圍廣,最大程度地減少了反應(yīng)體系優(yōu)化步驟。還提供Multiplex PCR GC Enhancer,針對某些Panel,添加GC Enhancer可以提高擴(kuò)增特異性。